目的從理論上篩選出新型冠狀病毒(SARS-CoV-2)的RNA依賴的RNA聚合酶(RdRp)抑制劑。方法依據(jù)SARS-CoV-2的RNA聚合酶與SARS聚合酶結(jié)構(gòu)(6NUR)具有高度的同源性,以SARS的RNA聚合酶為模板構(gòu)建SARS-CoV-2的RNA聚合酶的三維結(jié)構(gòu),利用分子對接軟件Autodock Vina研究選中15個化合物與模型靶酶的相互作用,評估化合物對SARS-CoV-2的RNA聚合酶的抑制活性。結(jié)果研究發(fā)現(xiàn),所選化合物均與靶酶的活性位點有一定相互作用,其中瑞德西韋活性形式、法匹拉韋活性形式、黃酮及異黃酮類化合物與靶酶的相互作用較強,以瑞德西韋活性形式與靶酶的結(jié)合能最低(為-7.9kal/mol),化合物1、2、8、13、14與酶的結(jié)合作用相對弱,提示對靶酶的抑制活性弱于瑞德西韋等,而化合物15沒有酶抑制活性。結(jié)論通過虛擬篩選,得到了SARS-CoV-2 RNA聚合酶的一些抑制劑,其中的某些中藥"活性成分"與目前臨床上應(yīng)用方劑的療效具有較大的相關(guān)性,與清肺排毒湯等中醫(yī)藥治療方案相互佐證。本研究為開發(fā)實施有效的抗新型冠狀病毒治療方案提供一定的理論參考,具體作用機制可進行進一...

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【文章目錄】：
1 實驗過程
    1.1 靶標(biāo)蛋白的分子建模
    1.2 小分子配體的選擇
    1.3 分子對接及運算過程
        1.3.1 配體處理
        1.3.2 受體處理
        1.3.3 利用分子對接軟件Autodock Vina進行對接處理
        1.3.4 結(jié)果處理
2 分子對接的結(jié)果及分析
3 討論
4 總結(jié)



本文編號：4024655