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針對(duì)結(jié)核桿菌泛酸合成酶的虛擬篩選

發(fā)布時(shí)間:2017-05-17 03:09

  本文關(guān)鍵詞:針對(duì)結(jié)核桿菌泛酸合成酶的虛擬篩選,由筆耕文化傳播整理發(fā)布。


【摘要】:結(jié)核病是由結(jié)核桿菌引起的傳染性疾病,結(jié)核桿菌一般在巨噬細(xì)胞內(nèi)進(jìn)入潛伏期而躲避人類免疫系統(tǒng)并影響藥物的療效,F(xiàn)有臨床抗結(jié)核藥物只涵蓋結(jié)核桿菌的部分生存機(jī)制,未能滿足患者的治療需求,且由于耐藥菌株的出現(xiàn)及流行,有必要研發(fā)新作用機(jī)制的抗結(jié)核藥物,來治療或殺滅敏感型或耐藥性以及處于潛伏期的結(jié)核桿菌。隨著結(jié)核桿菌全基因組測(cè)序的完成以及結(jié)構(gòu)生物學(xué)的發(fā)展,為確立新作用靶點(diǎn)并進(jìn)行抗結(jié)核藥物合理設(shè)計(jì)帶來了新的機(jī)遇。利用計(jì)算機(jī)虛擬篩選技術(shù)對(duì)新發(fā)現(xiàn)的潛在藥物靶標(biāo)開展研究,人們已經(jīng)獲得了許多抗結(jié)核活性化合物。其中,以酶為靶點(diǎn)的抗結(jié)核藥物研發(fā)已經(jīng)成為該領(lǐng)域的研究熱點(diǎn)。本研究選擇結(jié)核桿菌泛酸合成酶(pantothenate synthetase, PS)進(jìn)行基于受體結(jié)構(gòu)的虛擬篩選。泛酸合成酶負(fù)責(zé)合成的泛酸是輔酶A和酰基載體蛋白的重要合成前體。由于泛酸合成酶在人體內(nèi)不存在且輔酶A和;d體蛋白是結(jié)核桿菌生長的必需的輔助因子,因此泛酸合成酶是開發(fā)新的抗結(jié)核藥物的潛在理想靶點(diǎn)。本學(xué)位論文利用Glide對(duì)接篩選軟件和Specs小分子數(shù)據(jù)庫對(duì)結(jié)核桿菌泛酸合成酶進(jìn)行虛擬篩選,根據(jù)小分子與泛酸合成酶的相互作用特征及ADMET和類藥性質(zhì),挑選出33個(gè)具有潛在活性的化合物進(jìn)行實(shí)驗(yàn)測(cè)試。本研究利用虛擬篩選技術(shù)發(fā)現(xiàn)結(jié)核桿菌泛酸合成酶的一些具有新穎結(jié)構(gòu)的潛在活性化合物,,可供后期進(jìn)行結(jié)構(gòu)優(yōu)化改造,以期發(fā)現(xiàn)新型抗結(jié)核藥物。
【關(guān)鍵詞】:結(jié)核桿菌 泛酸合成酶 藥物設(shè)計(jì) 虛擬篩選 抑制劑
【學(xué)位授予單位】:南昌大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2014
【分類號(hào)】:R378.911
【目錄】:
  • 摘要3-4
  • ABSTRACT4-6
  • 第1章 引言6-10
  • 第2章 虛擬篩選方法及軟件簡介10-18
  • 2.1 虛擬篩選方法簡介10-13
  • 2.2 對(duì)接程序 Glide 簡介13-18
  • 第3章 針對(duì)結(jié)核桿菌泛酸合成酶的虛擬篩選18-36
  • 3.1 結(jié)核桿菌泛酸合成酶及其抑制劑簡介18-24
  • 3.1.1 結(jié)核桿菌泛酸合成酶 (MTB-PS)簡介18-20
  • 3.1.2 泛酸合成酶 (MTB-PS)晶體結(jié)構(gòu)20-22
  • 3.1.3 泛酸合成酶 (MTB-PS)抑制劑報(bào)道22-24
  • 3.2 Glide 對(duì)泛酸合成酶的虛擬篩選24-36
  • 3.2.1 晶體結(jié)構(gòu)復(fù)合物 1N2H 的驗(yàn)證對(duì)接24-27
  • 3.2.2 Decoys 驗(yàn)證 1N2H 對(duì)接模型27-29
  • 3.2.3 Glide 對(duì) 1N2H 模型的 Specs 數(shù)據(jù)庫篩選29-36
  • 第4章 結(jié)論36-39
  • 致謝39-40
  • 參考文獻(xiàn)40-47
  • 攻讀學(xué)位期間的研究成果47-48
  • 綜述48-66
  • 參考文獻(xiàn)62-66

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本文編號(hào):372425

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