根據(jù)甘薯[Ipomoea batatas(Linn.) Lam.]轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù),從甘薯品種‘福菜薯7-6’(‘Fucaishu 7-6’)中克隆獲得1個(gè)編碼查爾酮異構(gòu)酶的基因,命名為IbCHI;IbCHI基因全長(zhǎng)732 bp,GC含量為55.19%,共編碼243個(gè)氨基酸。生物信息學(xué)分析結(jié)果表明:在IbCHI基因編碼的氨基酸序列第12至第214位包含1個(gè)Chalcone結(jié)構(gòu)域;IbCHI蛋白分子式為C₁₁₅₆H₁₈₃₁N₂₉₁O₃₅₁S₇,理論相對(duì)分子質(zhì)量為25 646.41,理論等電點(diǎn)為pI 5.25,并可能具有1個(gè)跨膜螺旋區(qū),定位于細(xì)胞核和細(xì)胞膜上;其氨基酸序列中包含24個(gè)帶正電荷和27個(gè)帶負(fù)電荷的氨基酸殘基,丙氨酸、絲氨酸、纈氨酸和甘氨酸所占比例較高,半胱氨酸所占比例最低;IbCHI蛋白的不穩(wěn)定指數(shù)和總親水性平均系數(shù)分別為38.49和0.074,表明IbCHI蛋白是一種穩(wěn)定的親水性蛋白質(zhì);IbCHI蛋白二級(jí)結(jié)構(gòu)中,α螺旋、隨機(jī)卷曲、延伸鏈和β轉(zhuǎn)角所占比例分別為39.51%、3...

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【文章目錄】：
1 材料和方法
    1.1 材料
    1.2 方法
        1.2.1 總RNA提取和IbCHI基因克隆
        1.2.2 生物信息學(xué)分析
        1.2.3 qRT-PCR分析
        1.2.4 重組載體構(gòu)建及亞細(xì)胞定位
    1.3 數(shù)據(jù)處理和分析
2 結(jié)果和分析
    2.1 IbCHI基因的克隆和生物信息學(xué)分析
        2.1.1 IbCHI基因克隆分析
        2.1.2 氨基酸序列的多重比對(duì)和同源性分析
        2.1.3 IbCHI蛋白的結(jié)構(gòu)和理化性質(zhì)
        2.1.4 IbCHI基因啟動(dòng)子區(qū)功能分析
    2.2 IbCHI基因的相對(duì)表達(dá)量分析
        2.2.1 IbCHI基因表達(dá)的組織特異性
        2.2.2 干旱和鹽脅迫對(duì)IbCHI基因相對(duì)表達(dá)量的影響
    2.3 IbCHI基因的亞細(xì)胞定位
3 討論和結(jié)論



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