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基于TCGA數(shù)據(jù)庫的腎癌自噬相關(guān)基因預后模型的建立與應用

發(fā)布時間:2023-08-06 18:42
  目的利用TCGA數(shù)據(jù)庫建立預測腎透明細胞癌預后的自噬相關(guān)基因預后模型,分析自噬相關(guān)基因預后模型與腎透明細胞癌各臨床病理特征之間的關(guān)系。方法通過R語言軟件篩選出TCGA數(shù)據(jù)庫中腎透明細胞癌樣本及正常樣本中差異表達的自噬相關(guān)基因,Cox比例風險回歸模型從中篩選和建立多基因預后模型,計算預后評分。根據(jù)預后評分的中位數(shù)將患者分為高風險組和低風險組。利用Kaplan-Meier生存曲線分析高風險組及低風險組生存差異。將臨床病理因素和預后評分因素納入Cox回歸模型分析腎透明細胞癌患者的生存影響因素。根據(jù)臨床病理因素與腎癌自噬相關(guān)基因預后模型預后評分的相關(guān)性,驗證多基因模型對腎透明細胞癌患者中的預后價值。結(jié)果共篩選出8個差異基因(BNIP3、ATG16L2、CASP4、RGS19、EIF4EBP1、CX3CL1、SPHK1、BID)建立腎癌自噬相關(guān)基因預后模型。預后風險評分(RS)公式為:RS=0.274×ATG16L2的表達量-0.294×BNIP3的表達量+0.415×CASP4的表達量-0.424×RGS19的表達量+0.238×EIF4EBP1的表達量-0.199×CX3CL1的表達量+0....

【文章頁數(shù)】:7 頁

【文章目錄】:
1 材料與方法
    1.1 一般資料
    1.2 研究方法
    1.3 統(tǒng)計學方法
2 結(jié)果
    2.1 自噬相關(guān)差異基因的篩選
    2.2 自噬相關(guān)差異基因多基因預后模型的建立
    2.3 TCGA數(shù)據(jù)庫中選取的腎透明細胞癌患者的臨床特征
    2.4 腎透明細胞癌患者生存影響因素的Cox回歸分析及多指標ROC曲線
    2.5 腎癌自噬相關(guān)基因預后模型臨床相關(guān)性分析
3 討論



本文編號:3839849

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