嗅覺(Olfactory)是動物最重要的感覺能力之一,對動物的生存至關重要。動物可以通過嗅覺能力直接感知外界環(huán)境變化,與其生存環(huán)境取得直接聯(lián)系。動物依靠嗅覺進行尋找捕獲食物、選擇配偶、識別個體或群體、識別有毒物質、躲避天敵、標記領土等重要行為活動。自嗅覺受體(Olfactory receptor,OR)基因家族被發(fā)現(xiàn)后,便開啟了對嗅覺基因家族研究的大門。目前,對嗅覺受體基因的研究主要涉及到嗅覺受體基因結構、分類、表達部位、差異性表達、表達調控、進化歷程、假基因生物學作用、功能基因與假基因之間的關系和感官器官間補償機制等眾多研究領域。豬獾、狗獾同屬于鼬科動物,兩者棲息地類型相似,雜食,屬于夜行性動物,在我國分布十分廣泛,是重要的經(jīng)濟動物。對兩者的研究主要涉及到保護、養(yǎng)殖技術、食性、棲息地類型、疾病、獾油利用價值等研究領域,其分子方面的研究較少,主要涉及到了免疫分子、MHC基因和苦味受體等研究領域,但未曾見到關于兩者嗅覺的研究。通過探討嗅覺適應性進化,了解OR基因與生態(tài)環(huán)境之間的關系,可以提高豬獾、狗獾野生資源的合理可持續(xù)利用,提高兩者經(jīng)濟價值。因此,根據(jù)物種生態(tài)特征,本研究選取了豬獾、狗...

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【學位級別】：碩士

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摘要
Abstract
第一章 緒論
    1.1 豬獾和狗獾研究現(xiàn)狀
        1.1.1 生態(tài)特征方面的研究
        1.1.2 分子方面的研究
        1.1.3 經(jīng)濟價值方面的研究
    1.2 嗅覺受體基因文獻綜述
        1.2.1 嗅覺受體的發(fā)現(xiàn)及其結構
        1.2.2 OR基因分類及其表達部位
        1.2.3 OR基因進化
    1.3 轉錄組與測序技術的發(fā)展
        1.3.1 轉錄組概念
        1.3.2 測序技術的發(fā)展
        1.3.3 轉錄組測序技術的應用
    1.4 研究意義
第二章 材料與方法
    2.1 材料和試劑
        2.1.1 研究對象
        2.1.2 實驗試劑
        2.1.3 實驗儀器設備
    2.2 實驗方法
        2.2.1 總RNA的提取與檢測
        2.2.2 文庫的構建與上機測序
        2.2.3 測序數(shù)據(jù)處理
        2.2.4 勞亞獸總目物種的嗅覺受體功能基因篩選步驟
        2.2.5 豬獾狗獾嗅覺受體功能基因篩選步驟
        2.2.6 OR基因堿基組成分析
        2.2.7 OR基因亞型劃分
        2.2.8 OR基因系統(tǒng)發(fā)育分析
        2.2.9 OR基因統(tǒng)計分析
        2.2.10 OR基因潛能預測
第三章 結果
    3.1 測序數(shù)據(jù)質量評估
    3.2 測序數(shù)據(jù)過濾
    3.3 轉錄本拼接
    3.4 嗅覺基因總覽
    3.5 嗅覺基因家族堿基組成
    3.6 嗅覺基因家族亞型劃分
    3.7 OR基因系統(tǒng)發(fā)育分析
    3.8 OR基因相關性分析
    3.9 嗅覺基因的PIC分析
    3.10 豬獾狗獾OR基因氣味識別潛能
第四章 討論
    4.1 OR功能基因數(shù)目特征
    4.2 OR功能基因分類
    4.3 OR功能基因統(tǒng)計分析
    4.4 嗅覺潛能預測
第五章 結論與展望
    5.1 結論
    5.2 展望
參考文獻
致謝
附錄



本文編號：3839841