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人纖溶酶原Kringle 5與電壓依賴性陰離子通道蛋白VDAC1的相互作用研究

發(fā)布時間:2020-05-17 08:18
【摘要】:惡性腫瘤已成為威脅人類生命健康的重大疾病之一,F(xiàn)有研究證實,人纖溶酶原Kringle 5通過與電壓依賴性陰離子通道蛋白VDAC1相互作用來誘導細胞凋亡,抑制腫瘤增長。但二者之間具體的相互作用尚不清楚。對此,本研究采用分子動力學模擬和實驗相結合的方法,對人纖溶酶原Kringle 5與VDAC1的相互作用機理進行了研究。利用分子動力學模擬得到二者相互作用的軌跡。對兩者相互作用的氨基酸分析,發(fā)現(xiàn)二者通過氫鍵,靜電力與范德華力相互作用,對構象變化進行分析,發(fā)現(xiàn)復合物中由268VAL,269ASN,270ALA與由165THR,166GLN,167SER構成的β片層消失變?yōu)闊o規(guī)則卷曲;由162SER,163ARG,164VAL與由327PRO,328GLU,329THR構成的無規(guī)則卷曲變?yōu)榱诵〉摩缕瑢?且163ARG,166GLN分別通過氫鍵與Kringle 5中的361TYR和357PRO產生作用。對結合能量進行了分析并分解,發(fā)現(xiàn)二者的結合可以自發(fā)進行,且靜電力為二者相互作用的主要驅動力,29GLU為二者相互作用的關鍵氨基酸。對關鍵氨基酸進行了突變研究,也從反面驗證了二者之間存在相互作用。實驗方面采用了前沿色譜法和表面等離子共振來研究。結果表明Kringle 5能與VDAC1發(fā)生相互作用。前沿色譜中,結合常數采用兩種方法計算得到分別為3.63×10~6 L/mol,3.5×10~6 L/mol,用SPR法得到的結合常數為1.63×10~4 L/mol。這些參數均能從實驗方面驗證VDAC1與Kringle 5之間的相互作用。
【圖文】:

人纖溶酶原,血管抑素,緒論,抑制素


第一章 緒論 K1-K4 功能區(qū)與血管生成抑制素具有高度同源性血管抑素類似的或相關的蛋白,也包含著同樣的有同樣的功能,可以也對血管內皮細胞的增殖與 5 個環(huán)狀結構域(Kringles),水解后可產生一片段,經研究發(fā)現(xiàn),Kringles 1-4,Kringles 1-5,K血管增生[21,22],重組人的纖溶酶原 Kringles 1、Kr抑制內皮的增生,研究報道,Kringles 4 可以抑制。

人纖溶酶原,結構示意圖


的血管增生,重組人的纖溶酶原 Kringles 1、Kring能抑制內皮的增生,研究報道,Kringles 4 可以抑制內生。圖 1.1 人纖溶酶原,血管生成抑素與 Kringle 5 的關系[22]人纖溶酶原中與血管生成抑制素相連的一個環(huán)狀結構域硫鍵(圖 1.2),分子量約為 8KD,與 Kringle 1、Krin較高的同源性。
【學位授予單位】:西北大學
【學位級別】:碩士
【學位授予年份】:2018
【分類號】:R730.5

【參考文獻】

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本文編號:2668218

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