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基于網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)探討增液湯改善脂質(zhì)代謝紊亂可能分子作用機制

發(fā)布時間:2024-10-03 00:37
   目的本研究旨在運用網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)方法探討增液湯改善脂質(zhì)代謝紊亂的可能物質(zhì)基礎(chǔ)及機制。方法基于BATMAN-TCM并聯(lián)用中藥系統(tǒng)藥理學(xué)數(shù)據(jù)庫與分析平臺(Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology Database and Analysis Platform,TCMSP)及化學(xué)數(shù)據(jù)庫(Chemistry Database),篩選增液湯中的有效化學(xué)成分,基于BATMAN-TCM、TCMSP、DrugBank和UniProt篩選其有效化學(xué)成分的對應(yīng)靶點;DiGSeE和GeneCards、DisGeNET數(shù)據(jù)庫篩選脂質(zhì)代謝紊亂疾病對應(yīng)靶標(biāo),并對增液湯靶點與脂質(zhì)代謝紊亂疾病靶標(biāo)進行維恩圖(Venn)分析,并在此基礎(chǔ)上建立"增液湯-中藥-有效化學(xué)成分-共有靶點"網(wǎng)絡(luò)結(jié)構(gòu)模型;利用DAVID及OmicShare數(shù)據(jù)庫對靶標(biāo)進行京都基因與基因組百科全書數(shù)據(jù)庫(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)通路富集、基因本體論(Gene Ontology,GO)分析并作可視化圖;利用STRING在線工具對共有靶...

【文章頁數(shù)】:7 頁

【部分圖文】:

圖4生物過程的顯著性氣泡圖

圖4生物過程的顯著性氣泡圖

圖3增液湯GO富集分析結(jié)果圖5分子功能的顯著性氣泡圖


圖6細(xì)胞組成的顯著性氣泡圖

圖6細(xì)胞組成的顯著性氣泡圖

圖5分子功能的顯著性氣泡圖2.4共有靶點的KEGG通路富集分析


圖7增液湯KEGG通路富集數(shù)目統(tǒng)計圖

圖7增液湯KEGG通路富集數(shù)目統(tǒng)計圖

應(yīng)用DAVID數(shù)據(jù)庫及OmicShare軟件對共有靶點進行KEGG生物途徑富集分析,選擇P<0.01作為靶點的篩選標(biāo)。同時制作目標(biāo)基因EnsemblID,使用Omicshare處理分析,選擇通路(Pathway)為前置條件,篩選符合P≤0.01信號通路進行富集分析。將上述最終結(jié)....


圖8增液湯KEGG通路富集分析顯著性氣泡圖

圖8增液湯KEGG通路富集分析顯著性氣泡圖

圖7增液湯KEGG通路富集數(shù)目統(tǒng)計圖2.5共有靶點的PPI網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建及核心靶點確定



本文編號:4006548

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