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基于網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)研究中藥歸經(jīng)與治療疾病的關(guān)系

發(fā)布時間:2020-11-15 04:59
   目的:通過網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)的方法,以分子對接篩選2015版藥典中中藥的活性靶點(diǎn),研究不同歸經(jīng)中藥生物學(xué)基礎(chǔ),并通過已知的活性靶點(diǎn)與疾病的關(guān)系,挖掘不同歸經(jīng)中藥的適應(yīng)癥。利用網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)初步探索歸經(jīng)理論的生物學(xué)基礎(chǔ),為歸經(jīng)理論的進(jìn)一步研究提供理論基礎(chǔ)。方法:本研究首先通過對2015版藥典的整理,收集了藥典中中藥及其歸經(jīng)信息,并通過現(xiàn)有數(shù)據(jù)庫和文獻(xiàn)的收集整理,得到中藥與化學(xué)成分?jǐn)?shù)據(jù);通過drug bank數(shù)據(jù)庫收集人類蛋白靶點(diǎn)名稱,并從PDB數(shù)據(jù)庫上下載人類蛋白靶點(diǎn)結(jié)構(gòu),通過TTD網(wǎng)站呢收集蛋白靶點(diǎn)與疾病的關(guān)系。然后通過分子對接的方法,篩選中藥的活性成分和潛在蛋白靶點(diǎn)。通過活性蛋白靶點(diǎn)挖掘中藥的適應(yīng)癥,統(tǒng)計各歸經(jīng)中藥在不同疾病中出現(xiàn)的頻率,探索不同歸經(jīng)中藥可能治療的適應(yīng)癥,并尋找各歸經(jīng)中藥的共同作用靶點(diǎn),通過在Gene Ontology網(wǎng)站上富集分析,分析不同歸經(jīng)中藥可能的生物學(xué)基礎(chǔ)。結(jié)果:(1)通過對2015版《中國藥典》的整理收集到615味中藥的歸經(jīng)信息,通過數(shù)據(jù)庫及文獻(xiàn)整理收集到相關(guān)化學(xué)成分13144個,drugBank上收集到人類蛋白靶點(diǎn)名稱936個,下載到蛋白結(jié)構(gòu)198個,通過分子對接篩選出361味中藥的1227個活性分子,86個活性蛋白靶點(diǎn),篩選出了在歸經(jīng)中90%味中藥都存在的蛋白靶點(diǎn)。其中肝經(jīng)20個,肺經(jīng)15個,胃經(jīng)16個,脾經(jīng)15個,腎經(jīng)22個,心經(jīng)23個,大腸經(jīng)19個,膀胱經(jīng)18個,膽經(jīng)25個,小腸經(jīng)23個,心包經(jīng)39個,三焦經(jīng)25個。(2)利用活性靶點(diǎn)和疾病的關(guān)系,統(tǒng)計中藥在不同歸經(jīng)和疾病中的分布,大腸經(jīng)中藥在肌肉骨骼系統(tǒng)和結(jié)締組織疾病、消化系統(tǒng)疾病、血液及造血器官疾病和涉及免疫機(jī)制的某些疾患中有較高的分布頻率。肺經(jīng)中藥在眼和附器類疾病、呼吸系統(tǒng)疾病、精神和行為障礙疾病上有較高頻率的分布。肝經(jīng)中藥在皮和皮膚下疾病、呼吸系統(tǒng)疾病、泌尿生殖系統(tǒng)疾病、內(nèi)分泌、營養(yǎng)、代謝類疾病中有較高頻率的分布。膽經(jīng)中藥在呼吸系統(tǒng)疾病、皮和皮膚下疾病、精神和行為障礙疾病上有較高頻率分布。脾經(jīng)中藥在呼吸系統(tǒng)疾病皮和皮膚下疾病、精神和行為障礙疾病上有較高頻率的分布。腎經(jīng)中藥在血液及造血器官疾病和涉及免疫機(jī)制的某些疾患、呼吸系統(tǒng)疾病、神經(jīng)系統(tǒng)疾病上有較高分布。胃經(jīng)中藥在眼和附器類疾病、血液及造血器官疾病、皮和皮膚下的疾病有較高的頻率分布。小腸經(jīng)中藥在皮和皮膚下疾病、呼吸系統(tǒng)疾病、精神和行為障礙疾病上有較高的頻率分布。心經(jīng)中藥在精神和行為障礙疾病、眼和附器類疾病、呼吸系統(tǒng)疾病、血液及造血器官疾病和涉及免疫機(jī)制的某些疾患中有較高的分布頻率。(3)通過基因富集分析,在分子功能上,肝經(jīng)中藥主要影響催化活性和抗氧化活性;心經(jīng)中藥主要影響結(jié)合功能、催化活性、及抗氧化活性,脾經(jīng)中藥主要影響催化活性和通道調(diào)節(jié)活性;肺經(jīng)中藥主要影響抗氧化活性和通道調(diào)節(jié)活性;腎經(jīng)中藥主要影響通道調(diào)節(jié)活性和催化活性;大腸經(jīng)中藥主要影響通道調(diào)節(jié)活性功能、催化活性功能和結(jié)合功能;膀胱經(jīng)中藥主要影響分子轉(zhuǎn)導(dǎo)活性、催化活性和酶活性的調(diào)節(jié);胃經(jīng)中藥主要影響通路調(diào)節(jié)活性和催化活性。在生物過程中,肝經(jīng)中藥主要影響生物體的代謝、信號、應(yīng)激過程的調(diào)節(jié);心經(jīng)中藥主要會影響生物體的細(xì)胞,信號、應(yīng)激、多細(xì)胞過程的調(diào)節(jié);脾經(jīng)中藥主要會影響生物體的細(xì)胞、信號、應(yīng)激、定位過程的調(diào)節(jié);肺經(jīng)中藥主要影響應(yīng)激反應(yīng);腎經(jīng)中藥主要影響生物體信號、細(xì)胞、代謝、應(yīng)激的調(diào)節(jié)過程;大腸經(jīng)中藥主要影響信號、細(xì)胞和應(yīng)激的調(diào)節(jié)過程;膀胱經(jīng)中藥主要影響發(fā)育、細(xì)胞、應(yīng)激、移動、細(xì)胞增殖、信號和多細(xì)胞生物過程;胃經(jīng)中藥主要影響通路調(diào)節(jié)活性和催化活性。(4)通過對歸經(jīng)與疾病共同靶點(diǎn)的頻率分析發(fā)現(xiàn):肝經(jīng)中藥蛋白主要分布在精神和行為障礙疾病,血液及造血器官疾病和涉及免疫機(jī)制的某些疾患和妊娠、分娩和產(chǎn)褥期相關(guān)疾病上;心經(jīng)中藥的蛋白靶點(diǎn)主要集中于精神和行為障礙疾病,某些傳染病和寄生蟲病和泌尿生殖系統(tǒng)疾病上;脾經(jīng)中藥的蛋白主要集中在內(nèi)分泌、營養(yǎng)和代謝疾病,眼和附器疾病和耳和乳突疾病;肺經(jīng)中藥的蛋白主要集中在精神和行為障礙,呼吸系統(tǒng)疾病和循環(huán)系統(tǒng)疾病;腎經(jīng)中藥的蛋白主要集中在精神和行為障礙疾病,眼和附器疾病和泌尿生殖系統(tǒng)疾病;大腸經(jīng)中藥的蛋白主要集中在精神和行為障礙疾病,眼和附器疾病和泌尿生殖系統(tǒng)疾病;膀胱經(jīng)中藥的蛋白主要集中在精神和行為障礙疾病,妊娠、分娩和產(chǎn)褥期相關(guān)疾病,血液及造血器官疾病和涉及免疫機(jī)制的某些疾患;胃經(jīng)中藥的蛋白主要集中在精神和行為障礙疾病,妊娠、分娩和產(chǎn)褥期相關(guān)疾病,眼和附器疾病。
【學(xué)位單位】:北京中醫(yī)藥大學(xué)
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位年份】:2018
【中圖分類】:R285
【部分圖文】:

網(wǎng)絡(luò)圖,中藥,靶點(diǎn),數(shù)據(jù)庫


基于網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)研究中藥歸經(jīng)與治療疾病的關(guān)系??如圖3.1.1是利用Cytoscape3.6軟件從Reactome數(shù)據(jù)庫中導(dǎo)入188味肝經(jīng)??中藥的20個共同活性靶點(diǎn)相互作用蛋白網(wǎng)絡(luò),獲得了?419個肝經(jīng)中藥的潛在活??性靶點(diǎn)。??圖3.1.1:肝經(jīng)中藥靶點(diǎn)網(wǎng)絡(luò)圖??*"*W?■??nil?Jews'"0*??::一??-一一?華-?鑛-*麟??r?::二二?二二二二-:-??賴酬灌嫌醬賴偷騰??3.2心經(jīng)中藥-耙點(diǎn)網(wǎng)絡(luò)??如圖3.2.1是利用Cytoscape3.6軟件從Reactome數(shù)據(jù)庫中導(dǎo)入72味心經(jīng)中??藥的23個共同活性靶點(diǎn)相互作用蛋白網(wǎng)絡(luò),獲得了?491個心經(jīng)中藥的潛在活性??靶點(diǎn)。??圖3.2.1?:心經(jīng)中藥靶點(diǎn)網(wǎng)絡(luò)圖??0=z?r;*-.?^??_?猶??—-??祕一?---??-w??3.3脾經(jīng)中藥-耙點(diǎn)網(wǎng)絡(luò)??如圖3.3.1是利用Cytoscape3.6軟件Reactome數(shù)據(jù)庫中導(dǎo)入脾經(jīng)中藥的15??個共同活性靶點(diǎn)相互作用蛋白網(wǎng)絡(luò),獲得了?413個肺經(jīng)中藥的潛在活性靶點(diǎn)。??32??

網(wǎng)絡(luò)圖,肺經(jīng),中藥,數(shù)據(jù)庫


基于網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)研宄中藥歸經(jīng)與治療疾病的關(guān)系??圖3.3.1:脾經(jīng)中藥靶點(diǎn)網(wǎng)絡(luò)圖??nm???<*???峨????????馨t???二??々_??事?篇??髮-藝???%.?"^m0m??_細(xì)??麵??.?_??X-L-??擊?難猜_?賺聰?-??r?嫌?_?***?-??_雜德德—??3.4肺經(jīng)中藥-祀點(diǎn)網(wǎng)絡(luò)??如圖3.4.1是利用Cytoscape3.6軟件從Reactome數(shù)據(jù)庫中導(dǎo)入144味肺經(jīng)??中藥的15個共同活性靶點(diǎn)相互作用蛋白網(wǎng)絡(luò),獲得了?379個肺經(jīng)中藥的潛在活??性靶點(diǎn)??圖3.4.1:肺經(jīng)中藥-靶點(diǎn)網(wǎng)絡(luò)圖??_r>r-—-—-??*2.??麵?mmrnmmm?一*"<">?'?'?wm

網(wǎng)絡(luò)圖,膽經(jīng),數(shù)據(jù)庫,靶點(diǎn)


基于網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)研究中藥歸經(jīng)與治療疾病的關(guān)系??如圖3.5.1是利用Cytoscape3.6軟件從Reactome數(shù)據(jù)庫中導(dǎo)入98味腎經(jīng)中??藥的16個共同活性靶點(diǎn)相互作用蛋白網(wǎng)絡(luò),獲得了?459個腎經(jīng)中藥的潛在活性??靶點(diǎn)。??圖3.5.]:腎經(jīng)中藥靶點(diǎn)網(wǎng)絡(luò)圖??%??.??:?<?1??供?**°?嫌??_?一:??rs.""?一??*??■??:Z-Sr??-?*?供?m你?mm供?jmc供供樣?條??*??嫌?"'m?**??3.6膽經(jīng)中藥-耙點(diǎn)網(wǎng)絡(luò)??如圖3.6.1是利用Cytoscape3.6軟件從Reactome數(shù)據(jù)庫中導(dǎo)入20味膽經(jīng)中??藥的25個共同活性靶點(diǎn)相互作用蛋白網(wǎng)絡(luò),獲得了?522個膽經(jīng)中藥的潛在活性??靶點(diǎn)。??圖3.6.1:膽經(jīng)中藥靶點(diǎn)網(wǎng)絡(luò)圖??.?r?-?-?一?辦?'?????士—-參-:一_^
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本文編號:2884370

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