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常見天然產(chǎn)物以大麻素受體CB2為靶點的同源建模及其分子對接研究

發(fā)布時間:2020-04-16 10:35
【摘要】:背景計算機輔助藥物設計(Computer Aided Drug Design,CADD)日益成為現(xiàn)代藥物研發(fā)過程中重要的工具,它以低成本、高效率及目標集中的巨大優(yōu)勢在國內(nèi)外的藥物設計研究中得到了廣泛的應用,尤其在先導化合物的發(fā)現(xiàn)和優(yōu)化過程中發(fā)揮著越來越重要的作用。大麻素受體是非常重要的藥物靶點,目前研究得知,大麻素受體存在兩種受體亞型CB1和CB2,以CB1受體為作用靶點的藥物雖然在臨床應用上有著不錯的鎮(zhèn)痛效果,但卻容易成癮,產(chǎn)生一系列中樞神經(jīng)性毒副作用;而以CB2受體為靶點的激動劑不僅具有良好的鎮(zhèn)痛效果,而且不會產(chǎn)生依賴、成癮等中樞神經(jīng)性毒副作用。因此,研究以CB2受體為作用靶點的藥物具有更好的臨床應用前景。目的構建CB2受體蛋白晶體結構,通過分子對接方法篩選出具有激動CB2受體活性的化合物,在此基礎上,進行生物活性的實際測試,為新型CB2受體激動劑類藥物的研發(fā)提供幫助。方法1根據(jù)已知的CB1受體蛋白晶體結構,通過同源建模的方式構建出CB2受體的蛋白晶體結構;2以常見的1000個中藥小分子庫為基礎,采用分子對接虛擬篩選的方式,從中篩選出具有大麻素受體CB2激動作用的小分子化合物;3通過實驗室測試所篩選出的小分子化合物對HEK 293細胞cAMP生成的抑制率來檢驗其藥理活性。結果與結論根據(jù)分子對接結果,篩選出了6個可能具有CB2受體激動活性的化合物,實驗室測試結果顯示,木通苯乙醇苷B(CalceolariosideB)和西伯利亞遠志糖A6(SibiricoseA6)具有較高的熒光抑制率,說明這兩種化合物對CB2受體有激動活性。
【圖文】:

流程圖,同源建模,研究概況,流程圖


Fig 8 同源建模的流程圖概況種亞型 CB1 和 CB2 都屬于 G 蛋白膜蛋白,直接得到其蛋白晶體的 X 到 CB2 受體三維結構的實驗數(shù)據(jù)。涂白偶聯(lián)受體,以牛視紫紅質(zhì)的晶體結三維結構進行了模擬,并采用分子動基礎上,分析了活性位點的組成和結對接,明確了 CB1 受體與利莫那班結那班與 CB1 受體殘基 Lys192 形成氫鍵作用基礎。鄺光林在其碩士論文中研藥物設計,利用 CADD 的相關技術對大[37]

3D結構模型,同源建模,分子對接,檢驗模型


Fig 13 大麻素受體 CB2 蛋白晶體 3D 結構模型圖大麻素受體 CB2 的蛋白晶體結構的檢驗模型提交 SAVES 服務器(Structural Analysisand Verif蛋白模型進行檢驗,得到 RamachandranPlot 圖和 E5,結果表明,RamachandranPlot 中 90.51%氨基酸所在合要求,,蛋白晶體結構整體打分為 94.545,說明構建靠,可用于后續(xù)的分子對接研究。
【學位授予單位】:新鄉(xiāng)醫(yī)學院
【學位級別】:碩士
【學位授予年份】:2017
【分類號】:R285

【參考文獻】

相關期刊論文 前6條

1 郭薇薇;姚磊;熊偉;;大麻鎮(zhèn)痛機制[J];中國疼痛醫(yī)學雜志;2015年08期

2 涂國剛;李少華;;大麻素受體CB1三維結構的同源模建及其對接研究[J];化學學報;2011年08期

3 李洪林,沈建華,羅小民,沈旭,朱維良,王希誠,陳凱先,蔣華良;虛擬篩選與新藥發(fā)現(xiàn)[J];生命科學;2005年02期

4 侯廷軍,徐筱杰;遺傳算法在計算機輔助藥物分子設計中的應用[J];化學進展;2004年01期

5 楊永紅;大麻屬植物分類研究史[J];中國麻業(yè);2003年01期

6 于德泉;展望從天然產(chǎn)物創(chuàng)新藥物研究[J];中國醫(yī)學科學院學報;2002年04期



本文編號:2629686

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