發(fā)布時(shí)間：2017-05-24 06:03

  本文關(guān)鍵詞：計(jì)算化學(xué)方法在基于受體結(jié)構(gòu)的藥物分子設(shè)計(jì)中的基礎(chǔ)理論及應(yīng)用，由筆耕文化傳播整理發(fā)布。

【摘要】：近年來生物學(xué)領(lǐng)域的研究進(jìn)展極大地加深了對(duì)疾病密切相關(guān)的靶標(biāo)分子的結(jié)構(gòu)和功能的認(rèn)識(shí)。然而,如何有效地利用生物大分子的結(jié)構(gòu)信息,進(jìn)而合理地設(shè)計(jì)出具有特異性結(jié)合活性的小分子藥物,還需要進(jìn)一步開發(fā)精確計(jì)算受體配體結(jié)合自由能的方法。近年來計(jì)算能力迅猛增長及研究大分子體系的理論和算法日趨成熟,基于物理學(xué)原理的計(jì)算化學(xué)方法在藥物分子設(shè)計(jì)中的重要作用日益凸顯。本文就計(jì)算化學(xué)在基于受體結(jié)構(gòu)的藥物分子設(shè)計(jì)中的方法及典型應(yīng)用實(shí)例進(jìn)行了系統(tǒng)的綜述,包括小分子結(jié)合位點(diǎn)的成藥性評(píng)估、化合物數(shù)據(jù)庫的虛擬篩選、先導(dǎo)化合物的結(jié)構(gòu)優(yōu)化等,同時(shí)對(duì)目前的應(yīng)用方法存在的主要問題進(jìn)行了探討,提出了切實(shí)可行的處理策略。
【作者單位】： 北京生命科學(xué)研究所;
【關(guān)鍵詞】： 基于受體結(jié)構(gòu)的藥物分子設(shè)計(jì) 計(jì)算化學(xué) 分子力學(xué) 分子動(dòng)力學(xué) 結(jié)合自由能 成藥性 分子對(duì)接
【基金】：國家重點(diǎn)基礎(chǔ)研究發(fā)展計(jì)劃(973計(jì)劃)資助項(xiàng)目(2011CB812402)
【分類號(hào)】：R917
【正文快照】： 眾所周知,化學(xué)小分子藥物是通過與體內(nèi)的生物大分子靶點(diǎn)結(jié)合,進(jìn)而影響其生物功能來發(fā)揮藥效[1]。藥物分子的幾何形狀和藥效基團(tuán)配置與其受體蛋白上的結(jié)合位點(diǎn)的空間形狀和功能基團(tuán)分布是互補(bǔ)的,這種互補(bǔ)性的好壞決定了受體和藥物分子的相互識(shí)別和相互結(jié)合的強(qiáng)弱程度。隨著人

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