發(fā)布時間：2021-12-02 00:55

　　目的探討太赫茲（terahertz,THz）輻射暴露后視網(wǎng)膜組織基因表達變化的整體情況,揭示THz暴露所致視覺系統(tǒng)損傷效應的關鍵信號通路及關鍵基因。方法通過平均功率密度80 mW/cm²的THz輻射暴露小鼠眼部,暴露時長2 min,取暴露后視網(wǎng)膜組織,采用RNA-seq測序分析基因表達變化的整體差異,采用聚類分析及富集分析揭示差異基因富集的信號通路和所揭示的生物功能;并進一步通過Real-time PCR揭示THz輻射暴露對視網(wǎng)膜損傷關鍵基因表達影響的時效關系。結(jié)果以P<0.05、|logFC|≥1為篩選條件對差異表達基因進行篩選,共篩選出上調(diào)基因625個,下調(diào)基因9個。GO分析差異基因主要分布于細胞外成分,分子功能主要為影響蛋白結(jié)合等,生物功能主要為細胞應激反應與細胞增殖等。KEGG信號通路分析結(jié)果顯示,差異基因主要影響PPAR信號通路、癌癥相關信號通路、鈣離子信號通路及PI3K-Akt信號通路。通過Real-time PCR對視網(wǎng)膜損傷相關基因進行驗證發(fā)現(xiàn),在暴露后5 min及24 h,THz輻射暴露均上調(diào)Krt12、Cfd、Wnt3a及Adipoq表達... 

【文章來源】：第三軍醫(yī)大學學報. 2020,42(23)北大核心CSCD

【文章頁數(shù)】：8 頁

【部分圖文】：

太赫茲輻射暴露后眼部升溫曲線

為深入分析太赫茲輻射暴露所致差異基因主要影響細胞哪些功能,將全部差異基因進行了GO富集分析。GO富集分析結(jié)果按照分子功能、生物過程和細胞組分進行GO 分類,圖3所示為每個GO分類中富集最顯著的前10個GO子集條目。從該結(jié)果可以看出,細胞組分分類中主要是細胞外成分(細胞外區(qū)域部分、細胞外區(qū)域),表明強太赫茲暴露所影響的基因主要是編碼細胞外成分的蛋白;分子功能分類中變化最為顯著的子集主要包括蛋白結(jié)合(同型蛋白結(jié)合、蛋白結(jié)合)、鈣離子通道蛋白結(jié)合以及蛋白二聚體活性等;生物過程分類中變化最為顯著的為發(fā)育相關子集(組織發(fā)育、發(fā)育過程、系統(tǒng)發(fā)育)、與外界有害因素刺激反應相關子集(細胞外刺激反應、應激系統(tǒng))、細胞增殖、細胞黏附等(圖3)。圖3 太赫茲輻射暴露后差異基因GO分析

太赫茲輻射暴露后差異基因GO分析


本文編號：3527397