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抗生物被膜多肽的設(shè)計(jì)及活性機(jī)理研究

發(fā)布時(shí)間:2020-08-09 02:32
【摘要】:目前,醫(yī)學(xué)臨床上有超過(guò)65-80%的疾病都是由生物被膜感染引起,主要包括:慢性疾病、植入醫(yī)學(xué)器械的導(dǎo)管感染等,這些都是臨床上很難徹底治療的疾病。細(xì)菌聚集發(fā)展成群體,隨后形成的生物被膜,能夠使細(xì)菌的抗藥性增加10-1000倍不等,使得臨床治療更加棘手。雖然已經(jīng)有抗生素協(xié)同聯(lián)合抗生物被膜的治療方法,但是抗生素協(xié)同的機(jī)制不明確使得協(xié)同效果不穩(wěn)定。因此,具有高效廣譜抗菌的抗菌肽是目前公認(rèn)的最具有抗生物被膜潛力的新型藥物。本課題中,通過(guò)對(duì)有廣譜高效抗菌活性的抗菌肽ZXR-2序列的優(yōu)化,主要包括疏水力矩提升、帶電量變化、序列長(zhǎng)短等方面的優(yōu)化,最終通過(guò)多肽二級(jí)結(jié)構(gòu)的確定和生物活性的測(cè)定,得到有抗成熟生物被膜活性的多肽ZXR-2.3(FKILRFIKKLWRSLLA)。通過(guò)結(jié)晶紫染色法測(cè)定殘留生物被膜和生物被膜中細(xì)菌致死實(shí)驗(yàn)判斷ZXR-2.3的降解生物被膜能力及殺死生物被膜中細(xì)菌的能力,實(shí)驗(yàn)發(fā)現(xiàn):ZXR-2.3在MIC濃度時(shí)殺菌和分解生物被膜的活性很明顯,但是對(duì)生物被膜中細(xì)菌的致死能力強(qiáng)于其分解生物被膜的能力。同時(shí),將作用機(jī)制不同的IDR-1018(VRLIVAVRIWRR-NH2)和KT2(NGVQPKYKWWKWWKKWW-NH2)分別與ZXR-2.3協(xié)同降解生物被膜,其中加入環(huán)丙沙星抗生素進(jìn)行協(xié)同實(shí)驗(yàn)的比較,因?yàn)橛形恼轮赋鯥DR-1018與環(huán)丙沙星抗生素的協(xié)同效果最好。其中,IDR-1018能夠通過(guò)刺激誘導(dǎo)第二信號(hào)分子(p)ppGpp降解,導(dǎo)致生物被膜的完整性被破壞,從而使成熟生物被膜被降解。而KT2可以穿過(guò)細(xì)胞膜與胞內(nèi)的DNA或其他小分子結(jié)合,以殺死細(xì)菌的方式降解成熟生物被膜。隨后,通過(guò)結(jié)晶紫染色實(shí)驗(yàn)、成熟生物被膜MTT實(shí)驗(yàn)、生物被膜厚度變化,甚至動(dòng)態(tài)培養(yǎng)成熟生物被膜實(shí)驗(yàn)發(fā)現(xiàn):能在低濃度誘導(dǎo)生物被膜降解的IDR-1018與ZXR-2.3的協(xié)同性最好,可以同時(shí)降解分離生物被膜和殺死生物被膜細(xì)菌。研究分析發(fā)現(xiàn):兩種多肽降解生物被膜的作用機(jī)制能彌補(bǔ)協(xié)同多肽的不足,IDR-1018主要承擔(dān)解離生物被膜的作用,而ZXR-2.3通過(guò)裂解破壞細(xì)胞膜殺死細(xì)菌,所以兩者的協(xié)同性最好。多肽之間協(xié)同降解生物被膜是一種新的組合方式,將通過(guò)不同作用機(jī)制來(lái)降解生物被膜的多肽協(xié)同降解生物被膜,能更快速的找到降解生物被膜的有效方法。最終,通過(guò)化學(xué)連接、linker連接等多種方法將ZXR-2.3和IDR-1018兩條多肽連接成一條多肽,可同時(shí)具有降解成熟生物被膜和殺死生物被膜細(xì)菌的能力。通過(guò)本課題的實(shí)驗(yàn)研究,不僅通過(guò)多肽序列設(shè)計(jì)獲得了有降解成熟生物被膜能力的ZXR-2.3序列,而且繼續(xù)通過(guò)多肽協(xié)同降解生物被膜實(shí)驗(yàn)發(fā)現(xiàn):將降解成熟生物被膜作用機(jī)制不同且互補(bǔ)的兩種多肽協(xié)同反應(yīng),是一種新的快速高效降解生物被膜的方法,為針對(duì)生物被膜引起的疾病進(jìn)行臨床治療具有很大潛力。
【學(xué)位授予單位】:北京化工大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2018
【分類號(hào)】:R914
【圖文】:

生物被膜


膠凝糖,支鏈淀粉和黃原膠,來(lái)構(gòu)造不同生物菌種的生物被膜[8]。EPS中大逡逑量的陽(yáng)離子和陰離子分子,如:糖醛酸、胞外蛋白、糖蛋白、糖脂、eDNA等,能夠逡逑吸附外界帶電物質(zhì),給生物被膜中微生物提供庇護(hù)生物被膜結(jié)構(gòu)組成如圖1-1所逡逑示,圖中黃色方塊代表的是包裹的細(xì)菌,①類似蘑菇形狀的顯示綠色的部分是生物被逡逑膜基質(zhì),綠色的深淺代表了營(yíng)養(yǎng)物質(zhì)與含氧量的多少,顏色越淺就說(shuō)明含量越少;②逡逑代表了基質(zhì)中的胞外多糖;③表明胞外DNA;④說(shuō)明了細(xì)菌的應(yīng)激反應(yīng);⑤從遺傳基逡逑因產(chǎn)物表達(dá)等多種機(jī)制決定了生物被膜易感性的特征;⑥代表了藥物的外排泵;⑦說(shuō)逡逑明了生物被膜內(nèi)細(xì)菌之間的交流;⑧代表著持續(xù)程序細(xì)胞,幾乎處于休眠的狀態(tài)。逡逑1逡逑k.逡逑

抗菌肽,作用機(jī)制,模式,水桶


性會(huì)被破壞,因?yàn)樾枰灤┘?xì)胞膜,所以有許多作用模式的假說(shuō),比如水桶模式、孔逡逑隙模式、地毯模式和聚集模式_。例如,Magainin邋11[31],Alamethicin[32】和Polymyxin逡逑B[@的作用機(jī)制分別為水桶模式,孔隙模式和地毯模式(分別為圖1-3的A、B、C)。逡逑許多的抗菌肽被發(fā)現(xiàn)是通過(guò)胞質(zhì)細(xì)胞膜轉(zhuǎn)移進(jìn)入細(xì)胞內(nèi)以其他物質(zhì)作為目標(biāo)[3()],比如逡逑Buforin邋II是與DNA結(jié)合[34],PR-39是抑制DNA/RNA/蛋白質(zhì)合成[35]。逡逑4逡逑

序列,多肽,二級(jí)結(jié)構(gòu),序列


疏水環(huán)境中多肽二級(jí)結(jié)構(gòu),其中親水環(huán)境懫用NaAc溶液進(jìn)行模擬,而疏水環(huán)境用SDS逡逑溶液模擬。逡逑圖3-2所示為多肽的二級(jí)結(jié)構(gòu),圖A為ZXR-2.1、ZXR-2.2、ZXR-2.3三條多肽在逡逑兩種環(huán)境中的二級(jí)結(jié)構(gòu),圖B為ZXR-2.4、ZXR-2.5、ZXR-2.6三條多肽在兩種環(huán)境中逡逑的二級(jí)結(jié)構(gòu),圖C為ZXR-2.7和ZXR_2.8兩條多肽在兩種環(huán)境中的二級(jí)結(jié)構(gòu),圖D逡逑為ZXR-2.3-1和ZXR-2.3-2兩條多肽在兩種環(huán)境中的二級(jí)結(jié)構(gòu)?梢詮闹邪l(fā)現(xiàn),當(dāng)多逡逑肽在親水環(huán)境中時(shí),在198邋nm有一負(fù)峰,根據(jù)特征峰的結(jié)果分析,表明此時(shí)多肽的逡逑二級(jí)結(jié)構(gòu)以無(wú)規(guī)卷曲為主。而當(dāng)多肽處于疏水環(huán)境(SDS溶液)中時(shí),在198邋nm處逡逑的負(fù)峰消失,卻在208nm處有一明顯負(fù)峰,在222nm處有輕微的負(fù)峰,說(shuō)明當(dāng)多肽逡逑處于類似于細(xì)胞膜一樣的疏水環(huán)境中時(shí),兩者都形成了邋a-螺旋結(jié)構(gòu)。逡逑從實(shí)驗(yàn)結(jié)果表明

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5 胡丹丹;紫檀

本文編號(hào):2786470


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