發(fā)布時間：2017-05-15 13:17

  本文關鍵詞：一株利福平依賴的北京型結核分枝桿菌的變異分析，，由筆耕文化傳播整理發(fā)布。

【摘要】：結核分枝桿菌是世界上最普遍存在的病原體之一。結核病是嚴重危害人類健康的一種傳染性疾病,利福平是重要的一線抗結核藥物。近年來,耐藥結核,多耐藥結核,乃至廣泛耐藥結核的出現,特別是耐利福平菌株的出現,對全球公眾健康構成了嚴重威脅。在利福平耐藥基礎上,鐘敏等人報道利福平依賴現象。我們課題組前期在蘭州市肺科醫(yī)院分離了一株結核分枝桿菌菌株1034,1034不僅對利福平(RIF)耐藥,它的生長還依賴RIF。為了研究利福平依賴的機制,我們對1034菌株進行連續(xù)傳代,1034菌株現已傳代培養(yǎng)至49代,這種RIF依賴現象依然存在。進一步,為了探討1034株與RIF依賴相關的遺傳特征,我們對1034菌株做了全基因組測序(WGS)。我們將1034基因組序列和已經公布的結核分枝桿菌標準株H37Rv(序列NC_000962)及臨床菌株CDC1551(NC_002755)做了比對,尋找1034株特異的突變基因,發(fā)現1034中與H37Rv和CDC1551都不同的突變基因共有371個,其中63個為非同義突變(nsSNPs)基因,包括68個nsSNP位點。我們進一步分析了上述68個非同義突變位點在其它3株利福平依賴菌株(859、1216、1353)中的變異情況,發(fā)現4株RIF依賴菌株(1034、859、1216、1353)共有31個nsSNPs基因(32個nsSNP位點)但進一步的分析發(fā)現這31個突變基因也存在于利福平耐藥菌株和利福平敏感菌株中。此外,我們在菌株1034發(fā)現了RpoB基因的3個突變位點,包括H526R(A76867G)、K1115(G78635A)和A1156(A78758G),其中H526R為非同義突變,K1115和A1156為同義突變。非同義突變H526R存在于2株RIF依賴菌株(1034、1353)中,同義突變A1156存在于4株RIF依賴菌株(1034、859、1216、1353)中。我們推測RIF依賴現象可能是在RpoB等基因突變基礎上進一步發(fā)生的表型變異。我們研究說明臨床結核分枝桿菌的利福平依賴現象雖然存在,但不太穩(wěn)定；利福平依賴的機制有待于進一步研究；及時監(jiān)測臨床利福平依賴菌株對結核病的治療有指導意義。 結核分枝桿菌北京基因型是在中國最流行、在全球第二流行的基因型[1]。北京基因型菌株與其他基因型相比是否在獲得性耐藥和高致病性基因上有選擇性優(yōu)勢有待回答。北京型結核分枝桿菌在世界各地的不同人群中出現增長趨勢。它可進一步用基因分型方法劃分,如結核分枝桿菌散在重復單位(MIRU)分型。MIRU223325173533型在俄羅斯,中國和其他亞洲國家是最常見的北京基因型,我們實驗室前期分離了一株MIRU基因型為223325173533的北京型結核分枝桿菌菌株1034,并在華大基因對其進行了全基因組測序。為了尋找高度流行的北京株的特異及共同突變基因,我們將1034的全基因組序列與H37Rv株和臨床菌株CDC1551做了比較,分析了與H37Rv、CDC1551相比較它的特異突變,并進一步分析了1034株與其他北京型菌株的共同突變。我們利用全基因組測序技術及生物信息學手段,找到與H37Rv、CDC1551相比1034株特異的63個非同義突變基因(nsSNPs),并從7株北京型結核分枝桿菌中篩選出它們共有的23個nsSNPs。單個基因的錯義突變可能影響菌株的表型,提高其對環(huán)境的適應能力,如免疫逃逸等,調查在基因水平北京株之間的差異可能有助于了解北京基因型菌株流行的原因。分析在基因編碼區(qū)的北京型特異的單核苷酸多態(tài)性,將有助于了解這些非同義SNP位點在北京株流行中的作用。
【關鍵詞】：結核分枝桿菌 全基因組測序 利福平依賴 RpoB 表型變異 基因型變異 結核分枝桿菌 全基因組測序 北京型 基因型變異
【學位授予單位】：蘭州大學
【學位級別】：碩士
【學位授予年份】：2013
【分類號】：R378.911
【目錄】：

• 目錄3-4
• 第一部分 結核分枝桿菌利福平依賴菌株的表型與基因型變異4-45
• 中文摘要4-5
• Abstract5-7
• 前言7-9
• 一 材料與方法9-19
• 1. 實驗材料9-11
• 2. 實驗方法11-19
• 二 實驗結果19-38
• 三 討論38-41
• 四 結論41-42
• 參考文獻42-45
• 第二部分 結核分枝桿菌北京型流行菌株的基因型變異45-63
• 中文摘要45-46
• Abstract46-47
• 前言47-48
• 一 材料與方法48-54
• 二 實驗結果54-57
• 三 討論57-60
• 四 結論60-61
• 參考文獻61-63
• 附錄63-64
• 在學期間的研究成果64-65
• 致謝65-66
• 出師表66

【參考文獻】

中國期刊全文數據庫 前10條

1 羅春明;蔡杏珊;劉志輝;;藥物依賴性肺結核30例臨床分析[J];廣東醫(yī)學;2009年01期

2 李大為,肖春玲;結核桿菌耐藥性的分子機制研究進展[J];國外醫(yī)藥(抗生素分冊);2003年05期

3 董梅;孟祥紅;匡鐵吉;雷紅;何菊芳;佟愛華;;結核分枝桿菌異煙肼依賴性的初步調查[J];解放軍醫(yī)學雜志;2007年04期

4 W.W.Yew;徐彩紅;何廣學;;結核分枝桿菌耐藥機制[J];國際結核病與肺部疾病雜志(中文版);2009年04期

5 孟祥紅;匡鐵吉;董梅;雷紅;梁艷;何菊芳;佟愛華;肖漓;;結核分支桿菌依賴鏈霉素的實驗觀察[J];軍醫(yī)進修學院學報;2006年03期

6 劉愛梅;韋一;;耐異煙肼結核分支桿菌分子生物學研究進展[J];檢驗醫(yī)學與臨床;2008年13期

7 黃文焰;結核分枝桿菌126株藥敏結果分析[J];臨床肺科雜志;2004年02期

8 徐麟,羅維林,郝永存;結核分枝桿菌實驗室藥敏結果的分析[J];寧夏醫(yī)學雜志;2005年07期

9 梁慶福;陳求揚;趙永;張加元;許麗瓊;王傳耀;林建;鄭金鳳;;福建寧德市少數民族地區(qū)結核病分子流行病學研究[J];中國熱帶醫(yī)學;2009年02期

10 張向暉;李奇鳳;楊堅;王遠志;吳萬貴;王仙;邢建新;袁俐;;乙胺丁醇耐藥結核分枝桿菌embB基因分析[J];石河子大學學報(自然科學版);2007年06期

  本文關鍵詞：一株利福平依賴的北京型結核分枝桿菌的變異分析，由筆耕文化傳播整理發(fā)布。

本文編號：367896