本文選題：HN型禽流感　切入點：系統(tǒng)進化樹　出處：《中國生物工程雜志》2014年11期 　論文類型：期刊論文

【摘要】：活禽貿(mào)易和H7N9禽流感病毒傳播之間存在關(guān)聯(lián),應用大數(shù)據(jù)技術(shù)分析活禽交易網(wǎng)絡(luò)數(shù)據(jù),可進行疫情溯源并預測未來傳播趨勢。從流感研究數(shù)據(jù)庫中獲取了截止至2013年分離得到的H7N9毒株的血凝素基因核酸序列,構(gòu)建系統(tǒng)進化樹推斷2013年上半年疫情中H7N9在各省及城市間的傳播情況,并與大數(shù)據(jù)推斷結(jié)果進行對比分析。結(jié)果表明,系統(tǒng)進化樹推斷結(jié)果更為準確,但大數(shù)據(jù)分析能夠提供更多地區(qū)的信息且具有更好的時效性,同時推斷的傳播模型準確度較高,在H7N9疫情的應對中具有較高的應用價值。
[Abstract]:There is a link between live poultry trade and the spread of H7N9 avian influenza virus. Big data technology is used to analyze live poultry trade network data. The hemagglutinin gene nucleic acid sequence of H7N9 strain isolated as of 2013 was obtained from the influenza research database. A phylogenetic tree was constructed to infer the transmission of H7N9 between provinces and cities in the first half of 2013, and the results were compared with those of big data. The results showed that the phylogenetic tree was more accurate. However, big data analysis can provide more information and has better timeliness, at the same time, the accuracy of the inferred transmission model is higher, and it has a higher application value in the response to H7N9 epidemic situation.
【作者單位】： 中國疾病預防控制中心傳染病預防控制所傳染病預防控制國家重點實驗室;感染性疾病診治協(xié)同創(chuàng)新中心;北京市計算中心;北京市理化分析測試中心;
【基金】：國家“863”計劃(2014AA021505) 國家自然科學基金(81201322,81301402)資助項目
【分類號】：R181

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本文編號：1578259