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雜種三葉草多葉型與標準型的轉錄組比較分析

發(fā)布時間:2021-03-17 19:24
  三葉草的多葉型與標準型是以蒙農(nóng)三葉草1號為母本和白三葉為父本進行遠緣雜交及胚拯救技術而獲得的Fi代株系。自2005年以來,經(jīng)過對Fi代的胚離體培養(yǎng)、莖段離體培養(yǎng)器官發(fā)生和胚萌發(fā)適應條件等一系列研究,得到可以在溫室和田間栽培的F1代植株。在雜交培育的研究過程中,部分三葉草植株出現(xiàn)4~5小葉的多葉型性狀。通過對這些植株的根蘗進行營養(yǎng)擴繁,形成一系列多葉型株系。這一發(fā)現(xiàn)對于新品種的培育具有重要意義。為探索三葉草多葉現(xiàn)象的分子機制,本研究選擇其中一個多葉型三葉草株系(1-1)和標準型三葉草株系(2-2)為研究對象,分別作為試驗組和對照組,每組設立三個生物學重復。T1、T2、T3為試驗組樣品,T4、T5、T6為對照組樣品,基于RNA-Seq技術,對6個樣品進行轉錄組測序分析。主要研究結果如下:(1)轉錄組數(shù)據(jù)分析得到多葉型三葉草與標準型三葉草的差異表達基因共1985個,包括794個上調基因與1191個下調基因。GO功能注釋表明差異表達基因主要富集在蛋白質磷酸化(Protein phosphorylation)、防御反應(Defense response)、核(Nucleus)、細胞質(Cytos... 

【文章來源】:內蒙古農(nóng)業(yè)大學內蒙古自治區(qū)

【文章頁數(shù)】:67 頁

【學位級別】:碩士

【部分圖文】:

雜種三葉草多葉型與標準型的轉錄組比較分析


圖2?Unigene長度分布圖??Fig.2?Unigene?length?distribution?map??

雜種三葉草多葉型與標準型的轉錄組比較分析


圖3?Mapped?Reads在mRNA上的位置分布圖??Fig.3?Map?distribution?of?Mapped?Reads?on?mRNA??

雜種三葉草多葉型與標準型的轉錄組比較分析


圖5轉錄組測序數(shù)據(jù)飽和度模擬圖??Fig.5?Transcriptome?sequencing?data?saturatio?

【參考文獻】:
期刊論文
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[5]甘蔗脫葉性的評價及其分子基礎[D]. 商賀陽.廣西大學 2016
[6]高加索三葉草、白三葉及其F1代株系的遺傳特征[D]. 李曉秀.內蒙古農(nóng)業(yè)大學 2015
[7]低溫脅迫下西葫蘆轉錄組分析與SSR分子標記開發(fā)[D]. 張宏亮.山西農(nóng)業(yè)大學 2015
[8]β-葡萄糖苷酶基因的篩選及性質分析[D]. 夏玉林.廣東藥科大學 2016
[9]紫花苜蓿耐鹽生理特性及轉錄組分析[D]. 江超.山東農(nóng)業(yè)大學 2014
[10]高加索三葉草與白三葉雜交BC1胚培養(yǎng)及F1育性分析[D]. 任尚佳.內蒙古農(nóng)業(yè)大學 2014



本文編號:3087592

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