豬MYOD/PPAR-γ2轉(zhuǎn)基因鼠外源基因的插入位點(diǎn)效應(yīng)的研究
發(fā)布時(shí)間:2021-03-17 19:49
外源基因在轉(zhuǎn)基因動(dòng)物體內(nèi)的表達(dá)既受到表達(dá)載體的啟動(dòng)子影響,又受到外源基因在插入過程中所引起的插入位點(diǎn)效應(yīng)的影響。本實(shí)驗(yàn)室采用原核顯微注射法制備了可以穩(wěn)定遺傳的MyoD和PPAR-γ2轉(zhuǎn)基因鼠。為了研究影響外源基因在轉(zhuǎn)基因動(dòng)物體內(nèi)表達(dá)的因素,本試驗(yàn)將實(shí)驗(yàn)室保留的F3代的MyoD和PPAR-γ2轉(zhuǎn)基因鼠經(jīng)世代純繁建系,檢測(cè)轉(zhuǎn)基因鼠中外源基因在DNA、RNA和蛋白水平的表達(dá);通過熱不對(duì)稱交錯(cuò)式PCR(TAIL-PCR)法對(duì)轉(zhuǎn)基因鼠中的外源基因MyoD和PPAR-γ2進(jìn)行定位,確定外源基因的插入位點(diǎn),再分析外源基因整合過程中產(chǎn)生的插入位點(diǎn)效應(yīng),為日后應(yīng)用于生產(chǎn)實(shí)踐奠定理論基礎(chǔ)。主要研究結(jié)果如下:1、測(cè)定PPAR-γ2轉(zhuǎn)基因鼠和野生型鼠后腿肌肉組織中的甘油三酯含量和PPAR-γ蛋白的表達(dá)情況,檢測(cè)的結(jié)果表明PPAR-γ2陽(yáng)性轉(zhuǎn)基因鼠肌內(nèi)甘油三酯的含量高于野生型鼠(p<0.05),PPAR-γ蛋白在轉(zhuǎn)基因鼠中的表達(dá)高于野生型鼠;2、用RT-qPCR法檢測(cè)MyoD轉(zhuǎn)基因鼠各組織中外源基因的表達(dá)量,結(jié)果表明外源基因MyoD在肌肉組織中的表達(dá)量高于其他組織,且后腿肌肉組織中MyoD蛋白的表達(dá)量My...
【文章來源】:華中農(nóng)業(yè)大學(xué)湖北省 211工程院校 教育部直屬院校
【文章頁(yè)數(shù)】:76 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
縮略詞表
第一章 文獻(xiàn)綜述
1 引言
2 轉(zhuǎn)基因動(dòng)物建系
3 外源基因定位的方法及研究進(jìn)展
3.1 熱不對(duì)稱交錯(cuò)式PCR法
3.2 反向PCR法
3.3 熒光原位雜交法
3.4 連接介導(dǎo)PCR法
4 插入位點(diǎn)效應(yīng)的研究進(jìn)展
4.1 甲基化的檢測(cè)方法及研究進(jìn)展
4.1.1 限制性酶切PCR
4.1.2 甲基化特異性PCR
4.1.3 變性高效液相色譜法
4.1.4 亞硫酸鹽測(cè)序PCR
4.1.5 亞硫酸鹽PCR-SSCP
4.2 拷貝數(shù)的檢測(cè)方法及研究進(jìn)展
4.2.1 絕對(duì)定量PCR法
4.2.2 Southern Blot
4.2.3 CGH芯片
4.2.4 高密度SNP芯片
4.3 其他插入位點(diǎn)效應(yīng)及研究進(jìn)展
5 研究的目的與意義
第二章 材料方法
1 試驗(yàn)材料
1.1 試驗(yàn)動(dòng)物
1.2 載體和質(zhì)粒
1.3 主要儀器與設(shè)備
1.4 主要試劑及試劑盒
1.5 主要溶液的配制
2 試驗(yàn)方法
2.1 后代陽(yáng)性轉(zhuǎn)基因鼠的鑒定
2.1.1 小鼠基因組DNA的提取
2.1.2 陽(yáng)性鼠的鑒定
2.2 轉(zhuǎn)基因鼠基因組外源基因拷貝數(shù)的鑒定
2.2.1 小鼠單拷貝基因重組質(zhì)粒的檢測(cè)
2.2.2 PCR擴(kuò)增產(chǎn)物的檢測(cè)
2.2.3 重組質(zhì)粒的轉(zhuǎn)化
2.2.4 陽(yáng)性克隆的檢測(cè)及測(cè)序
2.2.5 將連接目的片段的pGL3-Basic的重組質(zhì)粒小量提取
2.2.6 轉(zhuǎn)基因鼠基因組內(nèi)拷貝數(shù)的鑒定
2.3 轉(zhuǎn)基因鼠目的基因在RNA水平表達(dá)情況的驗(yàn)證
2.3.1 轉(zhuǎn)基因鼠不同組織RNA的提取
2.3.2 RNA的反轉(zhuǎn)錄
2.3.3 實(shí)時(shí)熒光定量PCR分析MyoD轉(zhuǎn)基因鼠不同組織中MyoD基因的表達(dá)情況
2.4 轉(zhuǎn)基因鼠目的基因在蛋白水平表達(dá)情況的驗(yàn)證
2.4.1 轉(zhuǎn)基因鼠與野生型鼠肌肉組織蛋白的提取
2.4.2 Western blot檢測(cè)目的蛋白質(zhì)的表達(dá)量
2.5 轉(zhuǎn)基因鼠肌肉組織甘油三酯的測(cè)定
2.6 外源基因定位
2.6.1 熱不對(duì)稱交錯(cuò)式PCR
2.6.2 PCR擴(kuò)增產(chǎn)物的檢測(cè)
2.6.3 PCR產(chǎn)物的回收及純化
2.6.4 膠回收產(chǎn)物連接T載體
2.6.5 連接產(chǎn)物的轉(zhuǎn)化
2.6.6 陽(yáng)性克隆的檢測(cè)及測(cè)序
2.7 亞硫酸鹽PCR-SSCP
2.7.1 外源基因CpG島分析
2.7.2 基因組DNA亞硫酸鹽處理
2.7.3 亞硫酸鹽處理產(chǎn)物PCR擴(kuò)增
2.7.4 PCR擴(kuò)增產(chǎn)物的檢測(cè)
2.7.5 PCR產(chǎn)物的回收及純化
2.7.6 膠回收產(chǎn)物連接T載體
2.7.7 連接產(chǎn)物的轉(zhuǎn)化
2.7.8 陽(yáng)性克隆的檢測(cè)及測(cè)序
2.7.9 測(cè)序結(jié)果SSCP檢測(cè)
2.8 統(tǒng)計(jì)學(xué)分析
第三章 研究結(jié)果與分析
1 PPAR-γ2 陽(yáng)性轉(zhuǎn)基因鼠的檢測(cè)
2 PPAR-γ2 轉(zhuǎn)基因鼠中外源基因穩(wěn)定遺傳的判定
3 肌肉組織中外源基因PPAR-γ2 的表達(dá)情況
4 肌肉組織內(nèi)甘油三酯的測(cè)定
5 TAIL-PCR定位外源基因PPAR-γ2 的結(jié)果
6 PPAR-γ2 轉(zhuǎn)基因鼠中外源基因存在的插入位點(diǎn)效應(yīng)
6.1 PPAR-γ2 轉(zhuǎn)基因鼠中外源基因拷貝數(shù)的判定
6.2 PPAR-γ2 轉(zhuǎn)基因鼠中外源基因其他的插入位點(diǎn)效應(yīng)
7 MyoD陽(yáng)性轉(zhuǎn)基因鼠的檢測(cè)
8 MyoD轉(zhuǎn)基因鼠中外源基因穩(wěn)定遺傳的判定
9 MyoD轉(zhuǎn)基因鼠中外源基因MyoD的表達(dá)情況
9.1 MyoD轉(zhuǎn)基因鼠中外源基因MyoD的組織表達(dá)譜分析
9.2 肌肉組織中外源基因MyoD的表達(dá)情況
10 MyoD轉(zhuǎn)基因鼠中外源基因存在的插入位點(diǎn)效應(yīng)
10.1 MyoD轉(zhuǎn)基因鼠外源基因拷貝數(shù)的判定
10.2 MyoD轉(zhuǎn)基因鼠中外源基因啟動(dòng)子區(qū)域的CpG島甲基化的鑒定
10.3 MyoD轉(zhuǎn)基因鼠外源基因其他插入位點(diǎn)效應(yīng)的鑒定
第五章 討論
第六章 結(jié)論
1 本試驗(yàn)取得的結(jié)果
2 后期研究設(shè)想
參考文獻(xiàn)
致謝
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]禽白血病病毒衣殼蛋白p27基因絕對(duì)定量PCR方法的建立及應(yīng)用[J]. 胡海,錢琨,張丹陽(yáng),石亞運(yùn),張杰,邵紅霞,金文杰,秦愛建. 中國(guó)家禽. 2015(20)
[2]榮昌豬雜交群體基因組拷貝數(shù)變異鑒定與分析[J]. 龍熙,邱小田,陳磊,王金勇,李學(xué)偉. 畜牧獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2014(04)
[3]利用連接介導(dǎo)PCR檢測(cè)外源基因整合位點(diǎn)體系的建立[J]. 劉娣,李斌,張冬杰. 東北農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào). 2013(12)
[4]轉(zhuǎn)外源基因(pGH)在豬染色體上整合狀況[J]. 蔣亞軍,吳明明,孫金海. 中國(guó)獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2013(07)
[5]轉(zhuǎn)基因克隆牛外源基因整合位點(diǎn)的研究[J]. 譚貝貝,蘇紅,胡嘉祺,吳茜紅,徐大慶,鞏校東,李世杰. 中國(guó)農(nóng)學(xué)通報(bào). 2012(17)
[6]如皋雞不同時(shí)期肌肉組織生長(zhǎng)相關(guān)基因的表達(dá)譜分析[J]. 欒德琴,常國(guó)斌,盛中偉,黃正洋,周偉,龔琳琳,陳丹艷,劉巖,王克華,竇套存,陳國(guó)宏. 畜牧獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2012(01)
[7]DNA甲基化調(diào)節(jié)轉(zhuǎn)基因動(dòng)物外源基因表達(dá)的研究進(jìn)展[J]. 張國(guó)梁,董煥聲,張西鋒,沈偉. 青島農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2011(04)
[8]拷貝數(shù)變異及其研究進(jìn)展[J]. 劉欣,王立剛,王立賢. 畜牧獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2010(08)
[9]轉(zhuǎn)基因豬中外源基因拷貝數(shù)和整合位點(diǎn)的研究[J]. 孔慶然,武美玲,朱江,格日樂其木格,郇延軍,尹智,牟彥雙,劉忠華. 生物化學(xué)與生物物理進(jìn)展. 2009(12)
[10]hblf廣泛表達(dá)轉(zhuǎn)基因小鼠品系的建立及其組織形態(tài)學(xué)分析[J]. 王水良,賀艷,謝幼華,汪垣,厲建中,王龍,王鑄鋼,傅繼梁. 科學(xué)通報(bào). 2003(23)
博士論文
[1]APOBEC3B基因拷貝數(shù)變異與乙肝相關(guān)性肝細(xì)胞癌易感性[D]. 張彤雯.北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院 2012
[2]1.TIMP-1轉(zhuǎn)基因小鼠純系的建立及體內(nèi)表達(dá)研究 2.TIMP-1轉(zhuǎn)基因小鼠染色體FISH定位[D]. 劉慶鑫.中國(guó)人民解放軍軍醫(yī)進(jìn)修學(xué)院 2002
碩士論文
[1]利用轉(zhuǎn)基因鼠模型驗(yàn)證豬的MYOZ1/MYF6啟動(dòng)子上調(diào)肌肉組織中豬的PPAR-γ2/MYOD基因的表達(dá)[D]. 馬娟娟.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2015
[2]豬骨骼肌特異性表達(dá)基因myoz1/tnnc2啟動(dòng)子的克隆及功能驗(yàn)證[D]. 尚楊楊.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2013
[3]豬肌肉/肝臟特異性表達(dá)MyoD/BGL1載體構(gòu)建及轉(zhuǎn)基因小鼠的研究[D]. 周鵬.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2013
[4]五指山豬KIT基因拷貝數(shù)檢測(cè)暨豬PSME1基因與免疫性狀關(guān)系的研究[D]. 牛玉娜.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2007
本文編號(hào):3087623
【文章來源】:華中農(nóng)業(yè)大學(xué)湖北省 211工程院校 教育部直屬院校
【文章頁(yè)數(shù)】:76 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
縮略詞表
第一章 文獻(xiàn)綜述
1 引言
2 轉(zhuǎn)基因動(dòng)物建系
3 外源基因定位的方法及研究進(jìn)展
3.1 熱不對(duì)稱交錯(cuò)式PCR法
3.2 反向PCR法
3.3 熒光原位雜交法
3.4 連接介導(dǎo)PCR法
4 插入位點(diǎn)效應(yīng)的研究進(jìn)展
4.1 甲基化的檢測(cè)方法及研究進(jìn)展
4.1.1 限制性酶切PCR
4.1.2 甲基化特異性PCR
4.1.3 變性高效液相色譜法
4.1.4 亞硫酸鹽測(cè)序PCR
4.1.5 亞硫酸鹽PCR-SSCP
4.2 拷貝數(shù)的檢測(cè)方法及研究進(jìn)展
4.2.1 絕對(duì)定量PCR法
4.2.2 Southern Blot
4.2.3 CGH芯片
4.2.4 高密度SNP芯片
4.3 其他插入位點(diǎn)效應(yīng)及研究進(jìn)展
5 研究的目的與意義
第二章 材料方法
1 試驗(yàn)材料
1.1 試驗(yàn)動(dòng)物
1.2 載體和質(zhì)粒
1.3 主要儀器與設(shè)備
1.4 主要試劑及試劑盒
1.5 主要溶液的配制
2 試驗(yàn)方法
2.1 后代陽(yáng)性轉(zhuǎn)基因鼠的鑒定
2.1.1 小鼠基因組DNA的提取
2.1.2 陽(yáng)性鼠的鑒定
2.2 轉(zhuǎn)基因鼠基因組外源基因拷貝數(shù)的鑒定
2.2.1 小鼠單拷貝基因重組質(zhì)粒的檢測(cè)
2.2.2 PCR擴(kuò)增產(chǎn)物的檢測(cè)
2.2.3 重組質(zhì)粒的轉(zhuǎn)化
2.2.4 陽(yáng)性克隆的檢測(cè)及測(cè)序
2.2.5 將連接目的片段的pGL3-Basic的重組質(zhì)粒小量提取
2.2.6 轉(zhuǎn)基因鼠基因組內(nèi)拷貝數(shù)的鑒定
2.3 轉(zhuǎn)基因鼠目的基因在RNA水平表達(dá)情況的驗(yàn)證
2.3.1 轉(zhuǎn)基因鼠不同組織RNA的提取
2.3.2 RNA的反轉(zhuǎn)錄
2.3.3 實(shí)時(shí)熒光定量PCR分析MyoD轉(zhuǎn)基因鼠不同組織中MyoD基因的表達(dá)情況
2.4 轉(zhuǎn)基因鼠目的基因在蛋白水平表達(dá)情況的驗(yàn)證
2.4.1 轉(zhuǎn)基因鼠與野生型鼠肌肉組織蛋白的提取
2.4.2 Western blot檢測(cè)目的蛋白質(zhì)的表達(dá)量
2.5 轉(zhuǎn)基因鼠肌肉組織甘油三酯的測(cè)定
2.6 外源基因定位
2.6.1 熱不對(duì)稱交錯(cuò)式PCR
2.6.2 PCR擴(kuò)增產(chǎn)物的檢測(cè)
2.6.3 PCR產(chǎn)物的回收及純化
2.6.4 膠回收產(chǎn)物連接T載體
2.6.5 連接產(chǎn)物的轉(zhuǎn)化
2.6.6 陽(yáng)性克隆的檢測(cè)及測(cè)序
2.7 亞硫酸鹽PCR-SSCP
2.7.1 外源基因CpG島分析
2.7.2 基因組DNA亞硫酸鹽處理
2.7.3 亞硫酸鹽處理產(chǎn)物PCR擴(kuò)增
2.7.4 PCR擴(kuò)增產(chǎn)物的檢測(cè)
2.7.5 PCR產(chǎn)物的回收及純化
2.7.6 膠回收產(chǎn)物連接T載體
2.7.7 連接產(chǎn)物的轉(zhuǎn)化
2.7.8 陽(yáng)性克隆的檢測(cè)及測(cè)序
2.7.9 測(cè)序結(jié)果SSCP檢測(cè)
2.8 統(tǒng)計(jì)學(xué)分析
第三章 研究結(jié)果與分析
1 PPAR-γ2 陽(yáng)性轉(zhuǎn)基因鼠的檢測(cè)
2 PPAR-γ2 轉(zhuǎn)基因鼠中外源基因穩(wěn)定遺傳的判定
3 肌肉組織中外源基因PPAR-γ2 的表達(dá)情況
4 肌肉組織內(nèi)甘油三酯的測(cè)定
5 TAIL-PCR定位外源基因PPAR-γ2 的結(jié)果
6 PPAR-γ2 轉(zhuǎn)基因鼠中外源基因存在的插入位點(diǎn)效應(yīng)
6.1 PPAR-γ2 轉(zhuǎn)基因鼠中外源基因拷貝數(shù)的判定
6.2 PPAR-γ2 轉(zhuǎn)基因鼠中外源基因其他的插入位點(diǎn)效應(yīng)
7 MyoD陽(yáng)性轉(zhuǎn)基因鼠的檢測(cè)
8 MyoD轉(zhuǎn)基因鼠中外源基因穩(wěn)定遺傳的判定
9 MyoD轉(zhuǎn)基因鼠中外源基因MyoD的表達(dá)情況
9.1 MyoD轉(zhuǎn)基因鼠中外源基因MyoD的組織表達(dá)譜分析
9.2 肌肉組織中外源基因MyoD的表達(dá)情況
10 MyoD轉(zhuǎn)基因鼠中外源基因存在的插入位點(diǎn)效應(yīng)
10.1 MyoD轉(zhuǎn)基因鼠外源基因拷貝數(shù)的判定
10.2 MyoD轉(zhuǎn)基因鼠中外源基因啟動(dòng)子區(qū)域的CpG島甲基化的鑒定
10.3 MyoD轉(zhuǎn)基因鼠外源基因其他插入位點(diǎn)效應(yīng)的鑒定
第五章 討論
第六章 結(jié)論
1 本試驗(yàn)取得的結(jié)果
2 后期研究設(shè)想
參考文獻(xiàn)
致謝
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]禽白血病病毒衣殼蛋白p27基因絕對(duì)定量PCR方法的建立及應(yīng)用[J]. 胡海,錢琨,張丹陽(yáng),石亞運(yùn),張杰,邵紅霞,金文杰,秦愛建. 中國(guó)家禽. 2015(20)
[2]榮昌豬雜交群體基因組拷貝數(shù)變異鑒定與分析[J]. 龍熙,邱小田,陳磊,王金勇,李學(xué)偉. 畜牧獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2014(04)
[3]利用連接介導(dǎo)PCR檢測(cè)外源基因整合位點(diǎn)體系的建立[J]. 劉娣,李斌,張冬杰. 東北農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào). 2013(12)
[4]轉(zhuǎn)外源基因(pGH)在豬染色體上整合狀況[J]. 蔣亞軍,吳明明,孫金海. 中國(guó)獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2013(07)
[5]轉(zhuǎn)基因克隆牛外源基因整合位點(diǎn)的研究[J]. 譚貝貝,蘇紅,胡嘉祺,吳茜紅,徐大慶,鞏校東,李世杰. 中國(guó)農(nóng)學(xué)通報(bào). 2012(17)
[6]如皋雞不同時(shí)期肌肉組織生長(zhǎng)相關(guān)基因的表達(dá)譜分析[J]. 欒德琴,常國(guó)斌,盛中偉,黃正洋,周偉,龔琳琳,陳丹艷,劉巖,王克華,竇套存,陳國(guó)宏. 畜牧獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2012(01)
[7]DNA甲基化調(diào)節(jié)轉(zhuǎn)基因動(dòng)物外源基因表達(dá)的研究進(jìn)展[J]. 張國(guó)梁,董煥聲,張西鋒,沈偉. 青島農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2011(04)
[8]拷貝數(shù)變異及其研究進(jìn)展[J]. 劉欣,王立剛,王立賢. 畜牧獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2010(08)
[9]轉(zhuǎn)基因豬中外源基因拷貝數(shù)和整合位點(diǎn)的研究[J]. 孔慶然,武美玲,朱江,格日樂其木格,郇延軍,尹智,牟彥雙,劉忠華. 生物化學(xué)與生物物理進(jìn)展. 2009(12)
[10]hblf廣泛表達(dá)轉(zhuǎn)基因小鼠品系的建立及其組織形態(tài)學(xué)分析[J]. 王水良,賀艷,謝幼華,汪垣,厲建中,王龍,王鑄鋼,傅繼梁. 科學(xué)通報(bào). 2003(23)
博士論文
[1]APOBEC3B基因拷貝數(shù)變異與乙肝相關(guān)性肝細(xì)胞癌易感性[D]. 張彤雯.北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院 2012
[2]1.TIMP-1轉(zhuǎn)基因小鼠純系的建立及體內(nèi)表達(dá)研究 2.TIMP-1轉(zhuǎn)基因小鼠染色體FISH定位[D]. 劉慶鑫.中國(guó)人民解放軍軍醫(yī)進(jìn)修學(xué)院 2002
碩士論文
[1]利用轉(zhuǎn)基因鼠模型驗(yàn)證豬的MYOZ1/MYF6啟動(dòng)子上調(diào)肌肉組織中豬的PPAR-γ2/MYOD基因的表達(dá)[D]. 馬娟娟.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2015
[2]豬骨骼肌特異性表達(dá)基因myoz1/tnnc2啟動(dòng)子的克隆及功能驗(yàn)證[D]. 尚楊楊.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2013
[3]豬肌肉/肝臟特異性表達(dá)MyoD/BGL1載體構(gòu)建及轉(zhuǎn)基因小鼠的研究[D]. 周鵬.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2013
[4]五指山豬KIT基因拷貝數(shù)檢測(cè)暨豬PSME1基因與免疫性狀關(guān)系的研究[D]. 牛玉娜.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2007
本文編號(hào):3087623
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