乙肝病毒S蛋白是病毒的包膜蛋白,與病毒進(jìn)入細(xì)胞有關(guān),它存在逆轉(zhuǎn)錄過程并且具有極強(qiáng)的潛伏性。本論文應(yīng)用生物信息學(xué)分析乙肝病毒S蛋白的序列特征,利用在線分析軟件預(yù)測乙肝病毒S蛋白的理化性質(zhì)和親疏水性、跨膜區(qū)域、信號肽特征、磷酸化位點、二級結(jié)構(gòu)以及乙肝病毒S蛋白的最佳抗原表位形成位置等。結(jié)果顯示了乙肝病毒S蛋白由226個氨基酸組成,理論等電點是8.21,為不穩(wěn)定蛋白,總平均親水性為0.649,是疏水蛋白質(zhì),并且該蛋白存在信號肽,有4個跨膜區(qū),有30個潛在的磷酸化位點,主要二級結(jié)構(gòu)為α螺旋和無規(guī)則卷曲,同時,結(jié)合乙型肝炎病毒S蛋白的序列可及性、線性表位、β轉(zhuǎn)角、柔性、抗原性的預(yù)測結(jié)果,可以找到潛在的抗原表位區(qū)域,為乙型肝炎的表位疫苗研制提供重要的參考依據(jù),有利于進(jìn)一步對乙型肝炎S蛋白的抗原性進(jìn)行研究。

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圖1S蛋白中各個氨基酸含量Fig．1ContentofeachaminoacidinSprotein

)、脯氨酸(Pro)、蘇氨酸(Thr)含量較高，分別占氨基酸總數(shù)的35%、25%、22%、19%。脂肪系數(shù)是99．60。理論等電點是8．21，原子總數(shù)是3569。帶負(fù)電荷殘基的Asp(天冬氨酸)和Glu(谷氨酸)的數(shù)目是27，帶正電荷殘基的Arg(精氨酸)和Lys(賴氨酸)的總數(shù)....

圖2S蛋白疏水性預(yù)測結(jié)果Fig．2HydrophobicitypredictionresultsforSprotein

2．2乙肝病毒S蛋白的親水性(疏水性)乙肝病毒S蛋白的總平均親水性為0．649，可能是疏水蛋白質(zhì)。該蛋白質(zhì)的組成成分氨基酸的側(cè)鏈大部分或者全部由碳原子和氫原子組成，不太可能與水分子形成氫鍵。圖2疏水性的測試結(jié)果集中反映了不同氨基酸位置的親疏水性分布情況，閾值線為0，閾值線以上部分....

圖3S蛋白二級結(jié)構(gòu)Fig．3SecondarystructureofSprotein

圖4S蛋白信號肽預(yù)測結(jié)果Fig．4SignalpeptidepredictionresultsforSprotein

2．4乙肝病毒S蛋白的信號肽、跨膜區(qū)及磷酸化位點分析信號肽的本質(zhì)是一段氨基酸序列，一般位于多肽鏈的末端，在蛋白質(zhì)跨膜轉(zhuǎn)運過程中起作用。如圖4所示，S經(jīng)常被用于預(yù)測信號肽的剪切位點［8］，該預(yù)測結(jié)果中S分值最大為0．606，大于信號肽閾值0．5，S分值與閾值線的交點處的氨基酸位點為....

本文編號：4036033