目的 14-3-3基因家族廣泛存在于真核生物體內(nèi),參與重要的生命活動過程,且與多種疾病的發(fā)生密切相關(guān),本研究旨在進(jìn)一步了解豬帶絳蟲14-3-3蛋白家族的序列特征和分類情況。方法采用生物信息學(xué)方法對豬帶絳蟲全基因組的14-3-3基因進(jìn)行序列分析,包括外顯子和內(nèi)含子組成情況及其編碼氨基酸基本特性、并進(jìn)行蛋白二級結(jié)構(gòu)和三級結(jié)構(gòu)特征、亞細(xì)胞定位與系統(tǒng)進(jìn)化樹分析。結(jié)果對豬帶絳蟲全基因組蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫進(jìn)行搜索,獲得6個14-3-3蛋白序列。序列分析顯示,所有14-3-3基因均具有典型14-3-3結(jié)構(gòu)域,蛋白分子質(zhì)量介于26.88×103～29.33×10～3之間,等電點范圍為4.76～5.12;基因結(jié)構(gòu)分析表明其中1個蛋白基因具有1個內(nèi)含子,3個蛋白基因具有2個內(nèi)含子,2個蛋白基因具有3個內(nèi)含子;系統(tǒng)進(jìn)化分析顯示,豬帶絳蟲14-3-3蛋白系統(tǒng)進(jìn)化樹主要分為4個進(jìn)化枝,其中第Ⅱ進(jìn)化枝包含3個蛋白成員,其它3個蛋白分別位于不同的進(jìn)化枝上;三級結(jié)構(gòu)預(yù)測6個14-3-3蛋白具有較為相似的蛋白結(jié)構(gòu),均以二聚體的形式存在,每個單體都包含9個反向平行的α-螺旋。結(jié)論生物信息學(xué)預(yù)測豬帶絳蟲含有6個位于不同進(jìn)化枝的1...

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圖１豬帶絳蟲１４－３－３基因編碼氨基酸序列比對Ｆｉｇ．１ＭｕｌｔｉｐｌｅａｌｉｇｎｍｅｎｔｓｏｆｔｈｅＴ．ｓｏｌｉｕｍ１４－３－３ａｍｉｎｏａｃｉｄｓｅｑｕｅｎｃｅｓ

（ｐＩ）均顯酸性，為酸性蛋白特征，等電點的范圍在４．７６～５．１２之間。ＴｓＭ＿００１１６２７００和ＴｓＭ＿０００７４７５００的不穩(wěn)定指數(shù)（Ｉｎｓｔａｂｉｌｉｔｙｉｎｄｅｘ）＜４０，為穩(wěn)定蛋白；其他４個蛋白不穩(wěn)定指數(shù)均＞４０，為不穩(wěn)定蛋白。５個蛋白的脂溶指數(shù)均＜１００，為親水蛋白....

圖２豬帶絳蟲１４－３－３家族基因結(jié)構(gòu)Ｆｉｇ．２ＧｅｎｅｓｔｒｕｃｔｕｒｅｄｉａｇｒａｍｏｆｔｈｅＴ．ｓｏｌｉｕｍ１４－３－３ｇｅｎｅｆａｍｉｌｙ

性為１９．９３％。在Ｎ－端和Ｃ－端均具有較高的變異性，ＴｓＭ＿０００２６００００與其它蛋白的差異性較大，在其結(jié)構(gòu)域的中間位置有１１個氨基酸的片段插入。５基因結(jié)構(gòu)利用在線分析軟件ＧＳＤＳ分析豬帶絳蟲１４－３－３基因結(jié)構(gòu)，結(jié)果見圖２。該基因家族均由外顯子和內(nèi)含子組成，符合真核生物１４....

本文編號：4013811