光照抑制稻曲病菌菌絲生長的轉(zhuǎn)錄組分析及其光受體基因的克隆
發(fā)布時間:2021-08-10 05:52
近年來稻曲病發(fā)生日漸增多,已由水稻上的次要病害上升為主要病害之一。稻曲病可造成水稻減產(chǎn)、稻米品質(zhì)下降、產(chǎn)生毒素危害人畜健康等問題,因此其病原稻曲病菌(Villosiclava virens)亦已成為研究熱點。實驗表明光照能顯著抑制稻曲病菌菌絲的生長,但對于這一抑制作用的分子機理目前尚無相關(guān)報道。本研究將稻曲病菌(ZJ09菌株)分別在黑暗和白光條件下培養(yǎng),采集兩組菌絲并利用Illumina高通量測序技術(shù)對其進行轉(zhuǎn)錄組測序,比較兩組菌絲的基因表達情況,獲得695個差異表達基因(Differentially expressed genes,DEGs),其中359上調(diào),336個下調(diào)。選取6個基因用qRT-PCR進行驗證,結(jié)果與轉(zhuǎn)錄組測序的結(jié)果一致,證實了轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)的可信度及有效度。對DEGs進行基因本體(Gene Ontology,GO)富集分析,結(jié)果生物過程、細胞成分和分子功能這三大類Term都有DEGs富集,說明光照抑制稻曲病菌菌絲的生長涉及復(fù)雜的機理。對DEGs進行京都基因與基因組百科全書(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)通路注釋...
【文章來源】:浙江大學(xué)浙江省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:72 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
田間水稻穗上形成的稻曲球Fig.1.1Thefalsesmutballsonriceearsinfield
浙江大學(xué)碩士學(xué)位論文光照抑制稻曲病菌菌絲生長的轉(zhuǎn)錄組分析19圖2.1光照對PSA平板上稻曲病菌菌落生長速率的影響Fig.2.1EffectoflightonthegrowthrateofV.virenscolonyculturedonPSAplatesA:培養(yǎng)時長分別為7天、15天、20天時的稻曲病菌菌落正面形態(tài),對照組為黑暗培養(yǎng),處理組為每天24h光照(白光,強度為4000Lux)條件下培養(yǎng),溫度均為28℃。B:培養(yǎng)時長分別為7天、15天、20天時的稻曲病菌菌落背面色素積累程度,對照組為黑暗培養(yǎng),處理組為光照培養(yǎng),培養(yǎng)條件同A。C:7d、15d及20d時對照組與處理組中PSA平板上稻曲病菌菌落的直徑。**代表統(tǒng)計差異水平為極顯著(P<0.01),差異顯著性分析是利用Excel軟件的數(shù)據(jù)分析模塊實現(xiàn)。A:TheobversepicturesoftheV.virenscoloniesafterbeingculturedfor7days,15daysand20daysrespectively.Thecontrolgroupwasculturedindark,whilethelighttreatmentgroupwasculturedunderlight(withwhitelight,4000Lux)for24hourseveryday;thetemperatureofbothwas28℃.B:ThereversepicturesoftheV.virenscoloniesafterbeing
浙江大學(xué)碩士學(xué)位論文光照抑制稻曲病菌菌絲生長的轉(zhuǎn)錄組分析20culturedfor7days,15daysand20daysshowingthepigmentaccumulation.ThefungalsampleswereculturedindarkorunderlightasdescribedforA.C:TheaveragediametersofV.virenscoloniesafterbeingculturedonPSAmediumindarkorunderlightfor7days,15daysand20daysrespectively.**:extremelysignificantdifference(P<0.01)圖2.2黑暗組與光照組稻曲病菌菌落狀態(tài)的比較Fig.2.2ComparisonofthestatesofV.virenscoloniesculturedindarkandunderlight稻曲病菌在PSA平板上培養(yǎng)20d后拍照。菌落內(nèi)部照片放大100倍,菌落邊緣照片放大208倍。ImagesweretakenwithV.virensculturedonPSAplatesfor20d.Theimagesofcolonyinsideweremagnified100timesandthoseofcolonymarginweremagnified208times.2.3.2光照強度對光照抑制稻曲病菌菌絲生長的影響在培養(yǎng)的第10及第18天用十字交叉法對四組光照強度下培養(yǎng)的稻曲病菌菌落直徑進行測量記錄,結(jié)果顯示:在人工氣候箱條件下(可控的四個檔位的光照強度),與黑暗對照組相比,稻曲病菌的生長速率均被抑制,抑制程度雖略有微小差別,但總體浮動變化不大(圖2.3)。因此接下來選取培養(yǎng)箱能達到的中等強度光照4000Lux來探究光照影響稻曲病菌菌絲生長的機理。
【參考文獻】:
期刊論文
[1]轉(zhuǎn)錄組學(xué)主要研究技術(shù)及其應(yīng)用概述[J]. 劉偉,郭光艷,秘彩莉. 生物學(xué)教學(xué). 2019(10)
[2]稻曲病菌毒素對水稻幼根轉(zhuǎn)錄組的影響[J]. 武斌,溫雪瑋,李衫衫,胡東維,梁五生. 農(nóng)業(yè)生物技術(shù)學(xué)報. 2018(07)
[3]稻曲病菌成災(zāi)機制與防控技術(shù)研究進展[J]. 胡東維,梁五生,賴朝暉. 植物保護. 2018(01)
[4]水稻稻曲病研究現(xiàn)狀及展望[J]. 徐偉東,李冠,陸強,黎菊,蔡金洋. 作物研究. 2018(01)
[5]水稻稻曲病氣象等級預(yù)報模型及集成方法[J]. 徐敏,高蘋,劉文菁,任義方,李玉佩. 江蘇農(nóng)業(yè)科學(xué). 2017(17)
[6]水稻稻曲病抗性育種研究進展[J]. 黃桃翠,范玉剛,李賢勇. 農(nóng)業(yè)科技通訊. 2017(05)
[7]8個水稻稻曲病藥劑防治試驗[J]. 黎菊,陸強,嚴引芬. 浙江農(nóng)業(yè)科學(xué). 2016(12)
[8]不同殺菌劑對單季水稻稻曲病的防效比較試驗[J]. 葉愷軒. 安徽農(nóng)學(xué)通報. 2016(12)
[9]乙酰輔酶A合成酶的酶學(xué)性質(zhì)及其在甲羥戊酸合成中的應(yīng)用[J]. 胡紅,張汝兵,秦杰明,咸漠. 應(yīng)用與環(huán)境生物學(xué)報. 2016(03)
[10]國內(nèi)外水稻稻曲病研究進展[J]. 伏榮桃,王劍,盧代華,龔學(xué)書,張鴻. 中國農(nóng)學(xué)通報. 2016(12)
碩士論文
[1]稻曲病菌生防菌的篩選[D]. 李衫衫.浙江大學(xué) 2019
本文編號:3333595
【文章來源】:浙江大學(xué)浙江省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:72 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
田間水稻穗上形成的稻曲球Fig.1.1Thefalsesmutballsonriceearsinfield
浙江大學(xué)碩士學(xué)位論文光照抑制稻曲病菌菌絲生長的轉(zhuǎn)錄組分析19圖2.1光照對PSA平板上稻曲病菌菌落生長速率的影響Fig.2.1EffectoflightonthegrowthrateofV.virenscolonyculturedonPSAplatesA:培養(yǎng)時長分別為7天、15天、20天時的稻曲病菌菌落正面形態(tài),對照組為黑暗培養(yǎng),處理組為每天24h光照(白光,強度為4000Lux)條件下培養(yǎng),溫度均為28℃。B:培養(yǎng)時長分別為7天、15天、20天時的稻曲病菌菌落背面色素積累程度,對照組為黑暗培養(yǎng),處理組為光照培養(yǎng),培養(yǎng)條件同A。C:7d、15d及20d時對照組與處理組中PSA平板上稻曲病菌菌落的直徑。**代表統(tǒng)計差異水平為極顯著(P<0.01),差異顯著性分析是利用Excel軟件的數(shù)據(jù)分析模塊實現(xiàn)。A:TheobversepicturesoftheV.virenscoloniesafterbeingculturedfor7days,15daysand20daysrespectively.Thecontrolgroupwasculturedindark,whilethelighttreatmentgroupwasculturedunderlight(withwhitelight,4000Lux)for24hourseveryday;thetemperatureofbothwas28℃.B:ThereversepicturesoftheV.virenscoloniesafterbeing
浙江大學(xué)碩士學(xué)位論文光照抑制稻曲病菌菌絲生長的轉(zhuǎn)錄組分析20culturedfor7days,15daysand20daysshowingthepigmentaccumulation.ThefungalsampleswereculturedindarkorunderlightasdescribedforA.C:TheaveragediametersofV.virenscoloniesafterbeingculturedonPSAmediumindarkorunderlightfor7days,15daysand20daysrespectively.**:extremelysignificantdifference(P<0.01)圖2.2黑暗組與光照組稻曲病菌菌落狀態(tài)的比較Fig.2.2ComparisonofthestatesofV.virenscoloniesculturedindarkandunderlight稻曲病菌在PSA平板上培養(yǎng)20d后拍照。菌落內(nèi)部照片放大100倍,菌落邊緣照片放大208倍。ImagesweretakenwithV.virensculturedonPSAplatesfor20d.Theimagesofcolonyinsideweremagnified100timesandthoseofcolonymarginweremagnified208times.2.3.2光照強度對光照抑制稻曲病菌菌絲生長的影響在培養(yǎng)的第10及第18天用十字交叉法對四組光照強度下培養(yǎng)的稻曲病菌菌落直徑進行測量記錄,結(jié)果顯示:在人工氣候箱條件下(可控的四個檔位的光照強度),與黑暗對照組相比,稻曲病菌的生長速率均被抑制,抑制程度雖略有微小差別,但總體浮動變化不大(圖2.3)。因此接下來選取培養(yǎng)箱能達到的中等強度光照4000Lux來探究光照影響稻曲病菌菌絲生長的機理。
【參考文獻】:
期刊論文
[1]轉(zhuǎn)錄組學(xué)主要研究技術(shù)及其應(yīng)用概述[J]. 劉偉,郭光艷,秘彩莉. 生物學(xué)教學(xué). 2019(10)
[2]稻曲病菌毒素對水稻幼根轉(zhuǎn)錄組的影響[J]. 武斌,溫雪瑋,李衫衫,胡東維,梁五生. 農(nóng)業(yè)生物技術(shù)學(xué)報. 2018(07)
[3]稻曲病菌成災(zāi)機制與防控技術(shù)研究進展[J]. 胡東維,梁五生,賴朝暉. 植物保護. 2018(01)
[4]水稻稻曲病研究現(xiàn)狀及展望[J]. 徐偉東,李冠,陸強,黎菊,蔡金洋. 作物研究. 2018(01)
[5]水稻稻曲病氣象等級預(yù)報模型及集成方法[J]. 徐敏,高蘋,劉文菁,任義方,李玉佩. 江蘇農(nóng)業(yè)科學(xué). 2017(17)
[6]水稻稻曲病抗性育種研究進展[J]. 黃桃翠,范玉剛,李賢勇. 農(nóng)業(yè)科技通訊. 2017(05)
[7]8個水稻稻曲病藥劑防治試驗[J]. 黎菊,陸強,嚴引芬. 浙江農(nóng)業(yè)科學(xué). 2016(12)
[8]不同殺菌劑對單季水稻稻曲病的防效比較試驗[J]. 葉愷軒. 安徽農(nóng)學(xué)通報. 2016(12)
[9]乙酰輔酶A合成酶的酶學(xué)性質(zhì)及其在甲羥戊酸合成中的應(yīng)用[J]. 胡紅,張汝兵,秦杰明,咸漠. 應(yīng)用與環(huán)境生物學(xué)報. 2016(03)
[10]國內(nèi)外水稻稻曲病研究進展[J]. 伏榮桃,王劍,盧代華,龔學(xué)書,張鴻. 中國農(nóng)學(xué)通報. 2016(12)
碩士論文
[1]稻曲病菌生防菌的篩選[D]. 李衫衫.浙江大學(xué) 2019
本文編號:3333595
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