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LBD21-31基因調控楊樹莖干次生生長的功能分析

發(fā)布時間:2020-12-10 13:56
  木材資源對于整個人類社會具有不可缺少的重要意義。木材作為燃燒能源以及在造紙和建筑方面具有不可缺少的重要地位,樹木的大部分生物量是木材,木材也稱次生木質部。次生生長過程中維管形成層向內分化產生次生木質部,向外分化產生次生韌皮部,后續(xù)經歷細胞膨脹擴增,次生壁沉積,細胞程序性死亡等一系列復雜發(fā)育過程使樹干增粗,因此植物次生生長的基因調控網絡具有重要的科研價值。本研究通過分析前期的基因表達數據選定LBD基因家族中的LBD21-31(Potri.010G186000)基因為研究對象,以雜交楊樹84K為實驗材料,克隆得到楊樹LBD21-31基因片段,并成功構建35S::LBD21-31過表達載體,使用農桿菌介導的葉盤侵染轉化技術侵染得到LBD21-31過表達轉基因植株,通過RT-qPCR檢測了LBD21-31在不同轉基因植株中的表達量,后續(xù)通過表型分析和植株莖段切片觀察分析了LBD21-31對楊樹愈傷發(fā)育、根系發(fā)育及次生木質部發(fā)育的影響,使用DAP-seq分析了與LBD21-31直接作用的靶基因,為LBD基因家族研究和楊樹良種選育提供了重要的理論依據,現有主要研究結果如下:(1)LBD21-31基... 

【文章來源】:山東農業(yè)大學山東省

【文章頁數】:66 頁

【學位級別】:碩士

【部分圖文】:

LBD21-31基因調控楊樹莖干次生生長的功能分析


楊樹木材形成過程中次生細胞壁轉錄調控網絡Fig.1-1Thetranscriptionalnetworkregulatingsecondarywallbiosynthesisduringwoodformationinpoplar

序列,載體,圖譜,品牌


山東農業(yè)大學碩士學位論文11qPCRMasterMix:購自南京諾唯贊生物科技有限公司;RNA提取試劑盒、DNaseI酶、RNaseI酶:購自寶日醫(yī)生物技術有限公司;DNA產物純化試劑盒、瓊脂糖凝膠DNA回收試劑盒、高純度質粒小提試劑盒:購自北京康為世紀生物科技有限公司;限制性內切酶KpnI,XbaI、T4連接酶:購自于賽默飛世爾科技公司(ThermoFisherScientific)。光照培養(yǎng)箱型號GXZ-500C,品牌:寧波江南;小型冷凍高速離心機型號5424R,品牌:Eppendor;PCR儀型號LabcyclerGradient96,品牌:SENSOQUEST;凝膠成像分析儀型號TANON1600R,品牌:上海天能。2.2實驗方法2.2.1LBD21-31過表達載體的構建2.2.1.1LBD21-31基因序列和載體圖譜通過毛果楊基因數據庫(https://phytozome.jgi.doe.gov/pz/portal.html)輸入LBD21-31基因號Potri.010G186000查詢得到毛果楊LBD21-31的CDS序列。選取的過表達載體為PzP211+35s+PolyA,載體大小9014bp,其中啟動子為CaMV35S,菌體培養(yǎng)過程中抗性為大觀霉素(Spe),在轉基因植株中抗性為卡那霉素(Kana)。圖2-1PzP211+35S載體圖譜Fig.2-1PzP211+35Svector

載體,圖譜,條件,蛋白


山東農業(yè)大學碩士學位論文27IPTG(異丙基-β-D-硫代半乳糖苷)誘導目的蛋白的表達,在離心管中加入2mlLB和2μLAMP抗生素,混合均勻后加入200μL轉化成功的大腸桿菌(DE3)菌液,搖床恒溫37℃條件下180rpm培養(yǎng)24h。準備無菌錐形瓶,在錐形瓶中加入250mlLB和250μLAMP抗生素,混合均勻后加入2ml菌液。搖床恒溫37℃條件下180rpm培養(yǎng)至OD600值約為0.5,15℃條件下靜置30min,加IPTG至0.5mM,15℃條件下誘導24h。將誘導24h之后的蛋白菌液分裝在50ml離心管中,離心機4℃條件下12000g離心5min,離心過程中將錐形瓶置于冰上。離心結束后吸干凈離心管內壁附著的的LB液體,把離心后的菌體連同離心管一同放入-80℃冰箱保存。(3)基因蛋白互作使用磁珠(BeaverBeadsGSH)對蛋白菌液進行純化,詳細步驟見說明書。使用第一步提取的DNA,根據其濃度取100ngDNA加水至40μL。再取定量蛋白磁珠加PBS溶液至40μL,與40μL的DNA溶液混勻后制成80μL反應液。在20℃恒溫150rpm條件下晃動1h。結合完成后將離心管置于磁力架上,等待吸附完成后棄上清液,保留沉淀。將沉淀使用PBST緩沖液洗五遍后,更換新的離心管,使用27μLEB懸浮沉淀,水浴鍋98℃水浴10min。水浴完成后置于冰上冷卻5min,離心機3000g條件下離心5s,離心管放置磁力架上,吸附完成后吸出上清液,取約25μL作為模板用于PCR擴增。割膠回收DNA后,提交DAP-seq文庫,使用illumina方法進行高通量測序,每個樣品準備了三個重復。圖2-2pCold-GST載體圖譜Fig.2-2pCold-GSTvector

【參考文獻】:
期刊論文
[1]擬南芥LBD15互作蛋白的篩選和鑒定[J]. 郭兆來,孫旭東,楊永平,徐慧妮.  華北農學報. 2019(05)
[2]植物NAC轉錄因子的生物學功能[J]. 張慧珍,白雪芹,曾幼玲.  植物生理學報. 2019(07)
[3]LBD基因家族研究進展[J]. 石玉,沈詩雅,張倩茹,孫振美,鄔榮領,郭允倩.  中國細胞生物學學報. 2019(04)
[4]毛果楊LBD基因家族的全基因組分析[J]. 蘆強,邵芬娟,邱德有.  基因組學與應用生物學. 2018(01)
[5]84K楊愈傷組織再生體系和直接分化再生體系遺傳轉化的比較性研究[J]. 王麗娜,王玉成,楊傳平.  植物研究. 2017(04)
[6]植物MYB轉錄因子功能及調控機制研究進展[J]. 左然,徐美玲,柴國華,周功克.  生命科學. 2012(10)
[7]植物的次生生長及其分子調控[J]. 田敏,夏瓊梅,李紀元.  遺傳. 2007(11)
[8]84K楊再生和遺傳轉化體系的優(yōu)化[J]. 李科友,樊軍鋒,趙忠,周永學,高建社.  西北農林科技大學學報(自然科學版). 2007(07)
[9]84K楊葉片再生系統的建立[J]. 王樹耀,田宗城,黃白紅,徐艷.  湖南文理學院學報(自然科學版). 2004(04)

碩士論文
[1]84K楊再生和遺傳轉化體系的研究[D]. 周熙瑩.東北林業(yè)大學 2013



本文編號:2908808

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