發(fā)布時(shí)間：2018-11-04 14:36

【摘要】：南海是位于中國(guó)南部的陸緣海,西太平洋的一部分,屬于印度—西太平洋海洋生物地理區(qū)系,是世界上海洋生物種質(zhì)資源最為豐富的區(qū)域之一。南海蘊(yùn)藏著豐富的魚類資源,是生產(chǎn)供應(yīng)優(yōu)質(zhì)動(dòng)物蛋白,建設(shè)藍(lán)色糧倉(cāng)的重要區(qū)域。已有的研究調(diào)查統(tǒng)計(jì)顯示南海魚類有3000多種,其隸屬于3個(gè)綱、35個(gè)目、236個(gè)科和822屬[1-3]。魚類的種類鑒別需要豐富的專業(yè)知識(shí)和經(jīng)驗(yàn),特別是形態(tài)相似的近緣種,更是從形態(tài)上難以區(qū)分。近年來(lái)發(fā)展起來(lái)的DNA條形碼技術(shù)為魚類物種鑒別提供了一種快速有效的方法,而建立完善的DNA條形碼數(shù)據(jù)庫(kù)是利用DNA條形碼技術(shù)進(jìn)行魚類、魚卵和仔稚魚鑒定的基礎(chǔ)。因此,在國(guó)家基礎(chǔ)性工作專項(xiàng)的支持下,本研究開(kāi)展了南海魚類憑證標(biāo)本的收集保存和DNA條形碼數(shù)據(jù)庫(kù)構(gòu)建工作,并利用建立的DNA條形碼技術(shù)開(kāi)展了魚卵種類鑒別研究,取得的主要結(jié)果如下:1.南海魚類憑證標(biāo)本收集保存和DNA條形碼數(shù)據(jù)庫(kù)構(gòu)建。采集和保存了 518個(gè)樣品,通過(guò)形態(tài)鑒定隸屬于26目,91科,152屬,219種。將518個(gè)樣品分別提取基因組DNA,利用魚類線粒體COI基因通用引物,擴(kuò)增樣品的線粒體COI基因,并進(jìn)行測(cè)序分析,其中419個(gè)樣品獲得了有效的COI序列信息,經(jīng)與BOLD數(shù)據(jù)庫(kù)比對(duì)分析,其中407個(gè)樣品COI條形碼信息在在BOLD數(shù)據(jù)庫(kù)中有相應(yīng)條形碼序列,分別屬于19目,73科,123屬,164種,每個(gè)魚類物種包含1～8個(gè)個(gè)體數(shù),平均每個(gè)物種有2.48個(gè)個(gè)體,包含2個(gè)及2個(gè)以上個(gè)體的有93種;其余12個(gè)樣品隸屬于5個(gè)種,在BOLD數(shù)據(jù)庫(kù)中沒(méi)有相應(yīng)的條形碼序列。利用419個(gè)樣品COI序列進(jìn)行聚類分析,結(jié)果表明未出現(xiàn)堿基的插入和缺失,419條序列的平均堿基組成分別為T:29.7%,C:28.3%,A:23.3%和G:18.3%,其中A+T平均含量(53.0%)明顯高于G+C平均含量(46.6%),表現(xiàn)出AT堿基偏倚性。密碼子第三位點(diǎn)GC含量最高(48.5%),第一位點(diǎn)次之(46.5%),第二位點(diǎn)最低(43.8%)。三個(gè)密碼子A+T含量的差異不大,第一密碼子位點(diǎn)的A+T平均含量最大為53.4%。利用MEGA5.0軟件的K2P模型計(jì)算遺傳距離,種內(nèi)遺傳距離與種間遺傳距離的變化范圍分別為0.0000-0.0208 (平均值 0.0027)和 0.0012-0.4812 (平均值 0.2298),種間遺傳距離為種內(nèi)距離的85倍,土佐灣楔花洦，

本文編號(hào)：2310116