癲癇是臨床上一種常見的慢性疾病,起病年齡跨閾大,以發(fā)作形式多樣、反復發(fā)作為特點,對患者身體、精神、智力等均造成不同程度的影響,臨床上可表現(xiàn)為多種癲癇綜合征,也可演變?yōu)榘d癇持續(xù)狀態(tài),甚至引起癲癇性猝死。癲癇的致病機制復雜,至今仍未闡明,由相關基因突變引起的細胞功能障礙可能為其致病原因之一。此外,近年來,組學技術在醫(yī)學領域被越來越廣泛地使用,作為其重要組成部分的蛋白質(zhì)組學的迅速發(fā)展為臨床上疾病標志物的識別、疾病的早期診斷、靶向干預提供了有力的技術支持。但是目前對癲癇的蛋白質(zhì)組學研究多集中于動物模型或人腦組織標本,對于癲癇血漿蛋白質(zhì)組學的研究仍不多見。本研究一方面應用定量蛋白質(zhì)組學聯(lián)合生物信息學技術對癲癇患者血漿差異蛋白進行篩選,一方面通過體外細胞實驗對癲癇致病基因CACNA1A擴增突變引起細胞凋亡的機制進行研究。本文共分6章,主要內(nèi)容在第3、4章,具體工作如下:⒈兒童Rolandic癲癇血漿TMT定量蛋白質(zhì)組學分析（第3章）目的:應用TMT定量蛋白質(zhì)組學技術對兒童Rolandic癲癇患者血漿中的差異表達蛋白進行分析,同時聯(lián)合生物信息學技術對差異蛋白進行篩選、可視化,以尋求癲癇患者血漿中的可能...

【文章頁數(shù)】：138 頁

【學位級別】：博士

【部分圖文】：

圖2.1 TMT定量蛋白質(zhì)組原理及技術流程

TMT(TandemMassTags)技術是由美國Thermo公司研發(fā)的一種多肽體外標記定量技術。此類技術最多可采用10種穩(wěn)定同位素標簽,通過特異性標記多肽的氨基基團,然后進行串聯(lián)質(zhì)譜分析,可同時比較多達10種不同樣本中蛋白質(zhì)的相對含量。TMT技術是常用的差異蛋白質(zhì)組學技術、....

圖3.1本章的總體流程圖

本章的主要內(nèi)容包括以下四個方面:⑴入組病人及對照組的臨床信息采集;⑵各組血漿標本的收集;⑶蛋白的提取及鑒定;⑷差異表達蛋白的生物信息學分析。本章的總體流程圖,如圖3.1所示。3.2實驗材料

圖3.2.質(zhì)譜數(shù)據(jù)的質(zhì)控確認

圖3.2中展示的是質(zhì)譜數(shù)據(jù)的質(zhì)控檢測結果。首先,我們檢測了所有鑒定到的肽段的質(zhì)量偏移(masserror)(圖3.2A)。質(zhì)量誤差以0為中軸并且集中在低于10ppm的范圍內(nèi),說明質(zhì)量誤差符合要求。其次,絕大部分的肽段長度分布在8-20個氨基酸殘基之間(圖3.2B),符合胰酶消....

圖3.2.質(zhì)譜數(shù)據(jù)的質(zhì)控確認

圖3.2.質(zhì)譜數(shù)據(jù)的質(zhì)控確認3.3.11生物信息學分析

本文編號：4042609