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栽培花生遺傳多樣性及產(chǎn)量品質(zhì)性狀的關(guān)聯(lián)分析

發(fā)布時(shí)間:2017-04-07 16:25

  本文關(guān)鍵詞:栽培花生遺傳多樣性及產(chǎn)量品質(zhì)性狀的關(guān)聯(lián)分析,,由筆耕文化傳播整理發(fā)布。


【摘要】:花生核心種質(zhì)蘊(yùn)含著全部種質(zhì)最為豐富的遺傳多樣性,是研究栽培種花生遺傳和進(jìn)化、發(fā)掘優(yōu)異基因資源、實(shí)現(xiàn)品種遺傳改良的物質(zhì)基礎(chǔ)。但是,迄今對(duì)栽培花生的表型和基因型變異的特征及相互關(guān)系尚缺乏深入分析,對(duì)數(shù)量性狀QTLs及同一位點(diǎn)的等位基因的遺傳模式也未進(jìn)一步解析。本研究以構(gòu)建的257份栽培種花生核心種質(zhì)為材料,通過對(duì)植物學(xué)性狀、農(nóng)藝性狀及品質(zhì)性狀表型變異的研究,闡明栽培種花生遺傳多樣性的分布規(guī)律,揭示群體演化與地理分化的關(guān)系;基于139個(gè)SSR分子數(shù)據(jù),分析了核心種質(zhì)的遺傳多樣性、群體結(jié)構(gòu)及連鎖不平衡;結(jié)合該群體10個(gè)農(nóng)藝性狀和4個(gè)主要品質(zhì)性狀兩年三點(diǎn)的測定結(jié)果,進(jìn)行標(biāo)記和性狀間的全基因組水平關(guān)聯(lián)分析,獲得與花生產(chǎn)量性狀和主要品質(zhì)性狀關(guān)聯(lián)的位點(diǎn);分析穩(wěn)定關(guān)聯(lián)位點(diǎn)的等位變異表型效應(yīng),發(fā)掘優(yōu)異等位基因。主要結(jié)果如下:1.確定了中國栽培種花生的遺傳多樣性分布規(guī)律。Shannon-Weaver指數(shù)H′和變異系數(shù)CV%比較發(fā)現(xiàn),植物學(xué)類型中,以普通型的變異最為豐富(CV%=219.26%,H′=20.96),其次為龍生型(CV%=216.71%,H′=19.97);7大栽培區(qū)中,EZ2的遺傳多樣性最豐富(CV%=215.27%,H′=23.53);亞區(qū)sEZ6即皖、蘇淮河以北及黃河以南的魯東南、豫東交界區(qū)域?yàn)檫z傳多樣性的主要中心(CV%=234.45%,H′=19.70),sEZ10四川盆地、sEZ17浙江沿海和sEZ22廣東沿海為次生中心。2.利用PCA分析了栽培種花生群體的遺傳演化關(guān)系。根據(jù)主成分PC1和PC2對(duì)全部種質(zhì)進(jìn)行了類群關(guān)系分析,結(jié)果表明多粒型種質(zhì)可能是由珍珠豆型演化而來的、中間型可能是由普通型種質(zhì)發(fā)展演變而來的;龍生型與普通型的親緣關(guān)系較近。EZ1~EZ7相互重疊表明種質(zhì)的傳播與演化是一個(gè)從主要中心或次生中心逐步推進(jìn)的過程。3.篩選出60份品質(zhì)優(yōu)異種質(zhì)。利用傅里葉光譜儀的“近紅外折射率光譜學(xué)模型”對(duì)三個(gè)試驗(yàn)點(diǎn)種植的169份核心種質(zhì)材料進(jìn)行測定,篩選出22份蛋白質(zhì)含量在31%以上的高蛋白種質(zhì),20份含油量在53%以上的高油種質(zhì),18份油酸含量超過55%的高油酸種質(zhì)。4.分析了花生核心種質(zhì)DNA水平的遺傳多樣性。139個(gè)SSR標(biāo)記共檢測到1571個(gè)等位變異,單個(gè)標(biāo)記的等位變異數(shù)平均為11.08個(gè);多樣性指數(shù)PIC值范圍為0.023~0.912,平均0.778;種質(zhì)間遺傳距離為0.261~0.937,平均0.805。聚類分析和Structure軟件的群體結(jié)構(gòu)分析均將全部材料劃分為3個(gè)亞群,亞群間分化系數(shù)為0.0152~0.0254,平均0.0195;6.97%的共線性SSR位點(diǎn)對(duì)存在顯著的LD(P0.01),非共線性位點(diǎn)對(duì)r2范圍為0.014~0.116,平均0.011;群體LD衰減距離是10.1925。5.獲得了與花生產(chǎn)量性狀和主要品質(zhì)性狀顯著關(guān)聯(lián)的位點(diǎn)。檢測出169個(gè)與產(chǎn)量性狀顯著(P0.001)關(guān)聯(lián)的位點(diǎn),43個(gè)與主要品質(zhì)性狀顯著(P0.001)關(guān)聯(lián)的位點(diǎn),單個(gè)關(guān)聯(lián)位點(diǎn)對(duì)表型變異的解釋率R2范圍為6.04%~62.35%,共涉及80個(gè)SSR標(biāo)記;24個(gè)位點(diǎn)在≥2個(gè)環(huán)境或均值下被重復(fù)驗(yàn)證,48個(gè)位點(diǎn)同時(shí)與≥2個(gè)性狀相關(guān)聯(lián)。19個(gè)極顯著關(guān)聯(lián)(P≤5.88E-08)、解釋率R2≥24.74%的關(guān)聯(lián)標(biāo)記,為主效關(guān)聯(lián)位點(diǎn)。6.發(fā)掘了一批產(chǎn)量或品質(zhì)性狀相關(guān)的優(yōu)異等位變異。對(duì)24個(gè)穩(wěn)定關(guān)聯(lián)SSR位點(diǎn)的等位變異表型效應(yīng)進(jìn)行分析,獲得了38個(gè)矮株、9個(gè)提高單株產(chǎn)量、19個(gè)提高果重和13個(gè)高蛋白優(yōu)異等位變異;如降低株高的等位變異GA32-A373,提高單株產(chǎn)量的等位變異PD59-A75,提高果重的等位變異Ah3-A208,提高種子蛋白質(zhì)含量的等位變異PM358-A131。
【關(guān)鍵詞】:栽培花生 核心種質(zhì) 遺傳多樣性 關(guān)聯(lián)分析 表型效應(yīng)
【學(xué)位授予單位】:山東農(nóng)業(yè)大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:博士
【學(xué)位授予年份】:2015
【分類號(hào)】:S565.2
【目錄】:
  • 中文摘要9-11
  • Abstract11-14
  • 1 前言14-28
  • 1.1 栽培種花生的研究與利用現(xiàn)狀14-17
  • 1.1.1 栽培種花生的起源與演化14-15
  • 1.1.2 栽培種花生在中國的分化與分布15
  • 1.1.3 栽培種花生種質(zhì)的利用情況15-16
  • 1.1.4 花生核心種質(zhì)和微核心種質(zhì)的構(gòu)建與評(píng)價(jià)16-17
  • 1.2 栽培種花生的遺傳多樣性研究及利用17-20
  • 1.2.1 栽培種花生表型性狀的遺傳多樣性17-18
  • 1.2.2 栽培種花生DNA水平的遺傳多樣性18
  • 1.2.3 栽培種花生遺傳連鎖圖譜構(gòu)建18-19
  • 1.2.4 花生分子標(biāo)記與QTL定位19-20
  • 1.3 花生產(chǎn)量與品質(zhì)性狀的遺傳基礎(chǔ)及QTL分析20-22
  • 1.3.1 花生產(chǎn)量性狀的遺傳基礎(chǔ)及QTL分析20-21
  • 1.3.2 花生主要品質(zhì)性狀的遺傳基礎(chǔ)及QTL分析21-22
  • 1.4 關(guān)聯(lián)分析的原理及其在作物上的應(yīng)用22-26
  • 1.4.1 關(guān)聯(lián)分析的基礎(chǔ)—LD22-23
  • 1.4.2 關(guān)聯(lián)分析的前提—群體結(jié)構(gòu)估計(jì)23-24
  • 1.4.3 全基因組關(guān)聯(lián)分析發(fā)掘作物QTLs24-25
  • 1.4.4 核心種質(zhì)是進(jìn)行關(guān)聯(lián)分析的理想群體25
  • 1.4.5 全基因組關(guān)聯(lián)分析在花生上的應(yīng)用25-26
  • 1.5 本研究的目的意義及主要內(nèi)容26-28
  • 1.5.1 本研究的目的意義26
  • 1.5.2 主要研究內(nèi)容26-27
  • 1.5.3 技術(shù)路線27-28
  • 2 栽培花生遺傳多樣性演化與優(yōu)異種質(zhì)鑒定28-44
  • 2.1 材料與方法28-35
  • 2.1.1 試驗(yàn)材料28-34
  • 2.1.2 數(shù)據(jù)處理34-35
  • 2.1.3 遺傳多樣性分布與群體間遺傳關(guān)系35
  • 2.1.4 品質(zhì)優(yōu)異種質(zhì)的篩選鑒定35
  • 2.2 結(jié)果與分析35-41
  • 2.2.1 植物學(xué)類型間的遺傳變異35-36
  • 2.2.2 七大栽培區(qū)之間的遺傳變異36-37
  • 2.2.3 栽培種花生遺傳多樣性的分布與演化37-38
  • 2.2.4 栽培種花生的主成分分析和群體關(guān)系38-40
  • 2.2.5 品質(zhì)優(yōu)異種質(zhì)的篩選鑒定40-41
  • 2.3 討論41-44
  • 2.3.1 花生品種類型與遺傳多樣性41-42
  • 2.3.2 花生地理來源與遺傳多樣性42-43
  • 2.3.3 優(yōu)異種質(zhì)的篩選與評(píng)價(jià)43-44
  • 3 栽培花生遺傳多樣性與產(chǎn)量、品質(zhì)性狀的關(guān)聯(lián)分析44-99
  • 3.1 材料與方法44-54
  • 3.1.1 試驗(yàn)材料44-49
  • 3.1.2 田間試驗(yàn)設(shè)計(jì)49
  • 3.1.3 產(chǎn)量性狀的調(diào)查與測定49
  • 3.1.3.1 收獲前產(chǎn)量性狀的調(diào)查與測定49
  • 3.1.3.2 收獲后產(chǎn)量性狀的調(diào)查與測定49
  • 3.1.4 SSR標(biāo)記的分析49-50
  • 3.1.4.1 基因組DNA的提取與純化49-50
  • 3.1.4.2 多態(tài)性SSR標(biāo)記篩選50
  • 3.1.4.3 PCR擴(kuò)增與產(chǎn)物檢測50
  • 3.1.5 數(shù)據(jù)分析方法50-54
  • 3.1.5.1 表型數(shù)據(jù)的統(tǒng)計(jì)分析50
  • 3.1.5.2 SSR標(biāo)記多態(tài)性分析50-53
  • 3.1.5.3 聚類分析53
  • 3.1.5.4 群體結(jié)構(gòu)與遺傳分化53
  • 3.1.5.5 連鎖不平衡分析53
  • 3.1.5.6 關(guān)聯(lián)分析與等位變異的表型效應(yīng)53-54
  • 3.2 結(jié)果與分析54-93
  • 3.2.1 群體的表型性狀及相關(guān)性分析54-60
  • 3.2.1.1 產(chǎn)量性狀和品質(zhì)性狀的表型變異54-58
  • 3.2.1.2 表型性狀的相關(guān)性分析58-60
  • 3.2.2 SSR標(biāo)記的多態(tài)性分析60-64
  • 3.2.3 群體結(jié)構(gòu)分析64-67
  • 3.2.4 亞群間遺傳關(guān)系分析67-68
  • 3.2.5 連鎖不平衡分析68-69
  • 3.2.6 花生產(chǎn)量性狀的關(guān)聯(lián)分析69-79
  • 3.2.6.1 株高相關(guān)性狀的關(guān)聯(lián)分析69-72
  • 3.2.6.2 植株形態(tài)構(gòu)成性狀的關(guān)聯(lián)分析72-74
  • 3.2.6.3 單株效益性狀的關(guān)聯(lián)分析74-77
  • 3.2.6.4 莢果收益性狀的關(guān)聯(lián)分析77-79
  • 3.2.7 主要品質(zhì)性狀的關(guān)聯(lián)分析79-82
  • 3.2.8 各連鎖群的QTLs分布82-83
  • 3.2.9 穩(wěn)定關(guān)聯(lián)位點(diǎn)的優(yōu)異等位變異發(fā)掘83-93
  • 3.2.9.1 株高關(guān)聯(lián)位點(diǎn)的優(yōu)異等位變異83-88
  • 3.2.9.2 植株形態(tài)關(guān)聯(lián)位點(diǎn)的優(yōu)異等位變異88
  • 3.2.9.3 單株效益關(guān)聯(lián)位點(diǎn)的優(yōu)異等位變異88-89
  • 3.2.9.4 莢果收益關(guān)聯(lián)位點(diǎn)的優(yōu)異等位變異89-90
  • 3.2.9.5 主要品質(zhì)性狀關(guān)聯(lián)位點(diǎn)的優(yōu)異等位變異90-93
  • 3.3 討論93-99
  • 3.3.1 供試材料的遺傳多樣性93-94
  • 3.3.2 LD與群體結(jié)構(gòu)94
  • 3.3.3 標(biāo)記與性狀的關(guān)聯(lián)分析94-96
  • 3.3.4 數(shù)量性狀的“一因多效”96-99
  • 4 結(jié)論99-100
  • 5 創(chuàng)新點(diǎn)100-101
  • 參考文獻(xiàn)101-111
  • 致謝111-112
  • 攻讀學(xué)位期間取得的主要成果112

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7 蔡志遠(yuǎn);新沂地區(qū)花生品種篩選與栽培技術(shù)研究[D];南京農(nóng)業(yè)大學(xué);2012年

8 厲廣輝;花生生長動(dòng)態(tài)與土壤水分的關(guān)系及模擬模型的研究[D];山東農(nóng)業(yè)大學(xué);2008年

9 趙偉;旱澇脅迫對(duì)花生的影響及其機(jī)理研究[D];湖南農(nóng)業(yè)大學(xué);2010年

10 肖宇;花生特異表達(dá)抗病基因的載體構(gòu)建和遺傳轉(zhuǎn)化研究[D];福建農(nóng)林大學(xué);2011年


  本文關(guān)鍵詞:栽培花生遺傳多樣性及產(chǎn)量品質(zhì)性狀的關(guān)聯(lián)分析,由筆耕文化傳播整理發(fā)布。



本文編號(hào):290865

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