基于癌癥基因組圖譜挖掘丙酮酸脫氫酶激酶1在腦膠質(zhì)瘤中的表達(dá)及臨床意義
發(fā)布時(shí)間:2021-11-17 18:39
目的 利用癌癥基因組圖譜(TCGA)分析丙酮酸脫氫酶激酶1(PDK1)在腦膠質(zhì)瘤中的表達(dá)和臨床意義。方法 回顧性分析TCGA數(shù)據(jù)庫中641例腦膠質(zhì)瘤患者的臨床資料。采用GEPIA(http://gepia.cancer-pku.cn/)在線分析網(wǎng)站分析PDK1在腦膠質(zhì)瘤患者中的表達(dá)情況。之后采用Pearson相關(guān)分析法創(chuàng)建與PDK1相關(guān)的基因列表,再利用STRING在線分析工具對差異基因進(jìn)行互作網(wǎng)絡(luò)分析,根據(jù)可信度大小篩選出關(guān)鍵蛋白。進(jìn)一步通過基因本體分析(GO)獲得PDK1相關(guān)差異基因的功能及與京都基因和基因組百科全書(KEGG)通路的關(guān)系。根據(jù)PDK1蛋白表達(dá)量將所有患者分為PDK1蛋白低表達(dá)組(380例)和PDK1蛋白高表達(dá)組(261例),采用Kaplan-Meier生存曲線比較兩組患者的生存期差異。進(jìn)一步采用單因素和多因素Cox回歸分析法判斷PDK1蛋白表達(dá)對腦膠質(zhì)瘤患者預(yù)后的作用。結(jié)果 PDK1蛋白在世界衛(wèi)生組織(WHO)Ⅳ級膠質(zhì)瘤中的表達(dá)明顯高于Ⅱ、Ⅲ級(均P<0.05),且Ⅱ、Ⅲ級間的差異無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(Ⅱ、Ⅲ、Ⅳ級的蛋白相對表達(dá)量分別為7.24±0.60、7.34±...
【文章來源】:中華神經(jīng)外科雜志. 2020,36(03)
【文章頁數(shù)】: 頁
本文編號:3501464
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