核糖開關位于RNA(ribonucleic acid)的非編碼區(qū),參與調(diào)控很多重要的生物過程。本文利用已發(fā)展的RNA轉錄折疊預測方法,研究了位于Thermotoga petrophila中的氟離子核糖開關。計算結果表明,該核糖開關在轉錄過程中先折疊成一個包含假結并可以特異性結合配體的適體域結構。當氟離子濃度較低時,隨著RNA序列的延長,轉錄終止子開始成核、延長,最終完全形成,引起轉錄提前終止;當氟離子濃度較高時,配體和適體域結構結合形成一個穩(wěn)定的復合體結構,阻止了轉錄終止子的形成,從而使得下游基因可以正常表達。該核糖開關受轉錄速度和配體濃度的聯(lián)合控制,體現(xiàn)出動力學調(diào)控特性。

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【文章目錄】：
0 引言
1 研究方法
    1.1 計算躍遷速率
    1.2 復性折疊動力學
    1.3 轉錄折疊動力學研究
    1.4 配體結合動力學研究
2 結果
    2.1 氟離子核糖開關的調(diào)控行為
    2.2 轉錄過程對氟離子核糖開關的影響
    2.3 氟離子核糖開關的調(diào)控特性
3 結論



本文編號：3822969