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OsMsh6突變體的自發(fā)和誘發(fā)點(diǎn)突變的研究

發(fā)布時(shí)間:2021-01-18 06:13
  錯(cuò)配修復(fù)(Mismatch Repair,MMR)系統(tǒng)是DNA修復(fù)的重要途徑之一,負(fù)責(zé)識(shí)別和校正單堿基錯(cuò)配和未配對(duì)核苷酸,在生物體中高度保守,對(duì)于維護(hù)DNA復(fù)制的高保真度、高準(zhǔn)確度和基因組穩(wěn)定性至關(guān)重要。水稻是世界上最重要的糧食作物之一,也是單子葉模式植物。水稻OsMsh6基因是與擬南芥AtMsh6同源的錯(cuò)配修復(fù)基因,但迄今為止,對(duì)其功能及其突變體對(duì)誘變處理的反應(yīng)尚無報(bào)道。為此,本研究分析了OsMsh 純合插入突變體自發(fā)與誘發(fā)點(diǎn)突變的發(fā)生頻率與特點(diǎn),并建立了簡(jiǎn)便、快速、不經(jīng)測(cè)序即可確定單堿基突變的檢測(cè)方法。主要結(jié)果如下:(1)OsMsh6突變體的自發(fā)點(diǎn)突變。利用簡(jiǎn)化基因組測(cè)序技術(shù)對(duì)OsMsh6突變體的自發(fā)點(diǎn)突變進(jìn)行研究。從3個(gè)OsMsh6(LOCOs09g24220)純合插入突變體NF9010、NF7784和ND6011中檢測(cè)到994個(gè)堿基突變,平均每個(gè)突變株系上的單核苷酸突變密度約為1/136.72Kb。這些點(diǎn)突變相對(duì)平均地分布在各條染色體上,并隨著世代累積。所有可能的堿基轉(zhuǎn)換和顛換的類型都能看到,且堿基轉(zhuǎn)換與顛換的比例大約是3.12。突變位點(diǎn)側(cè)翼的堿基組成存在... 

【文章來源】:浙江大學(xué)浙江省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校

【文章頁(yè)數(shù)】:70 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】:碩士

【部分圖文】:

OsMsh6突變體的自發(fā)和誘發(fā)點(diǎn)突變的研究


圖2.1?SLAF標(biāo)簽在基因組中的分布:每個(gè)黃色長(zhǎng)條代表一條水稻染色體

顏色標(biāo)識(shí),染色體,條染,突變體


其中一種突變體中,有278和46個(gè)突變則出現(xiàn)在兩個(gè)或三個(gè)突變體中。分別從??染色體來看,這些自發(fā)突變?nèi)缤cSLAF標(biāo)簽在基因組中分布一樣,相對(duì)隨機(jī)地??分布于12條染色體上(圖2.2),無明顯的突變熱點(diǎn)。但不同染色體上的突變數(shù)??并不完全均勻,其中8號(hào)染色體上發(fā)生的突變數(shù)最高(299),其次是12號(hào)染色??體(178),這兩者之和占所有突變數(shù)目的近一半,另外10條染色體上的突變數(shù)??均少于100個(gè)(圖2.3)。??0Mb?5Mb?9Mb?14Mb?18Mb?23Mb?27Mb?32Mb?36Mb?41Mb??iiiiiiiiii??III?_l—國(guó)?III?II11???I?—BP?I?III?11____?l_l?III??如—————??-mi?i?in?in?H?i?i?mmam??你..?t.itt?華i?■?i??-?i?hi?i?n?111?mm??-ii?ii?mimmmm?n?

染色體,數(shù)目,條染,突變體


其中一種突變體中,有278和46個(gè)突變則出現(xiàn)在兩個(gè)或三個(gè)突變體中。分別從??染色體來看,這些自發(fā)突變?nèi)缤cSLAF標(biāo)簽在基因組中分布一樣,相對(duì)隨機(jī)地??分布于12條染色體上(圖2.2),無明顯的突變熱點(diǎn)。但不同染色體上的突變數(shù)??并不完全均勻,其中8號(hào)染色體上發(fā)生的突變數(shù)最高(299),其次是12號(hào)染色??體(178),這兩者之和占所有突變數(shù)目的近一半,另外10條染色體上的突變數(shù)??均少于100個(gè)(圖2.3)。??0Mb?5Mb?9Mb?14Mb?18Mb?23Mb?27Mb?32Mb?36Mb?41Mb??iiiiiiiiii??III?_l—國(guó)?III?II11???I?—BP?I?III?11____?l_l?III??如—————??-mi?i?in?in?H?i?i?mmam??你..?t.itt?華i?■?i??-?i?hi?i?n?111?mm??-ii?ii?mimmmm?n?


本文編號(hào):2984437

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