以人工種植的商品松茸子實(shí)體為對(duì)象,利用Illumina Novaseq 6000測(cè)序平臺(tái)對(duì)松茸子實(shí)體進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組測(cè)序,并通過(guò)生物信息學(xué)手段對(duì)松茸轉(zhuǎn)錄組進(jìn)行注釋和分析.基于9個(gè)松茸樣品的測(cè)序共獲得76.38 Gb的數(shù)據(jù)量,組裝得到的轉(zhuǎn)錄本和unigene個(gè)數(shù)分別為26 285和87 174.將獲得的unigene與6大功能數(shù)據(jù)庫(kù)進(jìn)行比對(duì),共有19 964個(gè)unigene得到注釋.基于GO和KEGG數(shù)據(jù)庫(kù)的注釋和分析,松茸子實(shí)體unigene被注釋和劃分為45個(gè)和28個(gè)功能類別.在松茸子實(shí)體中,涉及unigene數(shù)量最多的生理過(guò)程包括碳水化合物代謝、運(yùn)輸和分解代謝、氨基酸代謝等.結(jié)果表明,松茸子實(shí)體中代謝旺盛,應(yīng)采取合理措施以延緩其品質(zhì)下降.松茸子實(shí)體的轉(zhuǎn)錄組測(cè)序?qū)槠涔δ芑虻耐诰蛞约安珊笃焚|(zhì)變化機(jī)制的研究提供重要遺傳數(shù)據(jù)和參考. 

【文章來(lái)源】：成都大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2020,39(02)

【文章頁(yè)數(shù)】：6 頁(yè)

【文章目錄】：
0 引 言
1 材料與方法
    1.1 材 料
    1.2 儀 器
    1.3 方 法
        1.3.1 松茸子實(shí)體總RNA提取
        1.3.2 松茸子實(shí)體RNA測(cè)序
        1.3.3 轉(zhuǎn)錄組測(cè)序數(shù)據(jù)處理
        1.3.4 unigene功能注釋
2 結(jié)果與分析
    2.1 松茸子實(shí)體RNA測(cè)序數(shù)據(jù)質(zhì)量檢測(cè)
    2.2 松茸子實(shí)體轉(zhuǎn)錄組的從頭組裝
    2.3 松茸子實(shí)體unigene的功能注釋及分類
        2.3.1 同源物種比對(duì)分析
        2.3.2 GO功能注釋和分類
        2.3.3 KOG功能分類
        2.3.4 KEGG通路注釋
3 結(jié) 論


【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
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碩士論文
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本文編號(hào)：3170170