唐魚（Tanichthys albonubes）是為數(shù)不多的幾種原產(chǎn)中國的世界性觀賞魚類之一。自2003年以來,多個唐魚野生種群相繼被發(fā)現(xiàn),其瀕危狀態(tài)和等級由野外滅絕降為極危。為研究唐魚養(yǎng)殖種群與廣州附近野生種群之間的遺傳關(guān)系,本文分析了唐魚3個代表性養(yǎng)殖種群和4個野生種群,共計186個樣本的Cytb基因、2個核基因（ENC1和RAG1）以及13個微衛(wèi)星位點數(shù)據(jù)�；贙2P模型的遺傳距離結(jié)果顯示,唐魚野生種群間的遺傳距離在0.005–0.015之間,養(yǎng)殖種群間的遺傳距離為0.001–0.009。系統(tǒng)發(fā)育分析表明,唐魚養(yǎng)殖種群包含4個單倍型譜系分支,其中2個分別與廣州附近2個野生種群聚在一起,另外2個分別獨立成支。單倍型網(wǎng)絡(luò)親緣關(guān)系分析顯示,清遠種群只有1個單倍型且與芳村養(yǎng)殖種群共享,芳村養(yǎng)殖種群擁有最多的單倍型�；谖⑿l(wèi)星數(shù)據(jù)的STRUCTURE分析表明,所有種群最佳分簇數(shù)為2,清遠種群與養(yǎng)殖種群聚為一簇,良口和石門種群聚為另一簇。主成分分析結(jié)果顯示,養(yǎng)殖種群高度重疊并能與野生種群分開,清遠種群與養(yǎng)殖種群存在部分重疊。利用IMa3的基因流分析表明,存在清遠種群至芳村養(yǎng)殖種群的單向基因流... 

【文章來源】：生物多樣性. 2020,28(04)北大核心CSCD

【文章頁數(shù)】：11 頁

【部分圖文】：

本研究中唐魚4個野生種群的采樣地點(種群代號同表1)

開展魚類養(yǎng)殖種群的遺傳來源和遺傳結(jié)構(gòu)的研究對于人工繁育、增殖放流、防范基因污染等方面均具有重要意義(Glover et al,2017)。作為華南地區(qū)的特有魚類之一,唐魚在被廣泛引入全球觀賞魚市場之前據(jù)信只分布于廣州白云山、清遠、深圳、香港等少數(shù)幾個地區(qū)(Lin et al,1932;Weitzman&Chan,1966;鄭慈英,1989;潘炯華,1990)。因此,世界范圍內(nèi)唐魚養(yǎng)殖種群的野生來源應(yīng)僅限于上述幾個地點。隨著諸多野生種群的重新發(fā)現(xiàn),是否存在部分野生種群混雜到養(yǎng)殖種群,這是一個非常重要的科學(xué)問題。另外,十多年前在廣州各區(qū)廣泛開展的唐魚增殖放流活動是否對野生種群的遺傳多樣性和種群結(jié)構(gòu)產(chǎn)生影響,是另外一個值得探討的問題。Zhao等(2018)雖然指出唐魚養(yǎng)殖種群為單一起源,但未能提供更多證據(jù)。同時,對于芳村養(yǎng)殖種群比幾乎所有野生種群遺傳多樣性高的現(xiàn)象也缺乏合理解釋。Weitzman和Chan(1966)提出,美國市場上的養(yǎng)殖唐魚存在2種表型,1種來自廣州白云山,另1種來源于香港。另外,他們認為舊金山的養(yǎng)殖唐魚已經(jīng)被香港表型完全替代。這為唐魚養(yǎng)殖種群的起源提供了一種可能的解釋,即唐魚養(yǎng)殖種群可能是混合種群,而非單一起源。圖4 唐魚養(yǎng)殖種群和野生種群間的基因流估算(種群代號同表1)。

利用貝葉斯推斷和最大似然法構(gòu)建分子系統(tǒng)發(fā)育樹得到的拓撲結(jié)構(gòu)一致,因此將兩種樹合并為一種樹,結(jié)果見圖2A。從系統(tǒng)發(fā)育樹中可以看出,29個單倍型可以分為5支:深圳種群的所有單倍型構(gòu)成最外面的一支,其余4支均至少包含1個芳村(FC)養(yǎng)殖種群的單倍型。需要特別注意的是,FC支僅由芳村養(yǎng)殖種群的單倍型組成且位于系統(tǒng)樹中內(nèi)群的基部(圖2A);清遠種群的單倍型與3個養(yǎng)殖種群的單倍型聚在一起構(gòu)成FC QY SIG CA支;剩余2支分別由石門和芳村、良口和芳村的單倍型組成。另外,2個野生種群石門和良口的單倍型各自形成單系并獲得了非常高的支持率(PP≥0.90且BS≥90)。為了更好地闡明唐魚29個單倍型之間的關(guān)系,將本研究獲得Cyt b基因的29個單倍型進行了單倍型網(wǎng)絡(luò)親緣關(guān)系分析,用各單倍型之間基于堿基個數(shù)差異的遺傳距離繪制了單倍型網(wǎng)絡(luò)圖,結(jié)果見圖2B。從圖可知,各單倍型之間的變異步數(shù)在1–10之間,表明唐魚養(yǎng)殖種群和野生種群之間的遺傳分化不明顯。單倍型網(wǎng)絡(luò)圖分支結(jié)構(gòu)與系統(tǒng)發(fā)育樹基本一致。芳村養(yǎng)殖種群擁有最多的單倍型且其單倍型位于單倍型網(wǎng)絡(luò)圖的中心位置(如H19);清遠種群只有1個單倍型且與芳村養(yǎng)殖種群共享(H7);新加坡養(yǎng)殖種群的單倍型突變自芳村養(yǎng)殖種群的單倍型(H7);而加拿大養(yǎng)殖種群的單倍型則突變自新加坡養(yǎng)殖種群的單倍型(H21)。良口、石門和深圳種群的單倍型均為特有單倍型并且位于單倍型網(wǎng)絡(luò)圖的外圍。相較于深圳種群,良口和石門種群的單倍型數(shù)量更少。

【參考文獻】：
期刊論文
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本文編號：3311215