墨吉明對(duì)蝦是中國(guó)東南沿海生態(tài)系統(tǒng)的關(guān)鍵種和重要的漁業(yè)經(jīng)濟(jì)種。隨著近幾年來(lái)南美白對(duì)蝦養(yǎng)殖的大力發(fā)展,出現(xiàn)的難題也逐漸增多,例如進(jìn)口親蝦越來(lái)越貴、種質(zhì)資源降低、病害加劇等嚴(yán)重影響其效益。因此尋找替代品種來(lái)保證對(duì)蝦行業(yè)的產(chǎn)出量,是當(dāng)務(wù)之急。而從70年代開(kāi)始,我國(guó)就開(kāi)始了對(duì)墨吉明對(duì)蝦的胚胎發(fā)育、育苗等養(yǎng)殖技術(shù)的研究。墨吉明對(duì)蝦養(yǎng)殖曾在我國(guó)對(duì)蝦養(yǎng)殖中占重要地位,墨吉明對(duì)蝦野生種質(zhì)資源也可從我國(guó)自然海區(qū)捕獲,且又具有價(jià)格相對(duì)便宜、抗病性較強(qiáng)等優(yōu)點(diǎn),已受到養(yǎng)殖戶(hù)的廣泛關(guān)注。但是截止目前,我們對(duì)于墨吉明對(duì)蝦自然種群在中國(guó)東南沿海的種群組成、遺傳結(jié)構(gòu)等遺傳學(xué)屬性的了解還是空白。因此,我們采集了覆蓋墨吉明對(duì)蝦在中國(guó)近海主要分布地區(qū)的自然群體樣品,選用當(dāng)下比較流行的線粒體標(biāo)記和微衛(wèi)星分子標(biāo)記,對(duì)這個(gè)自然物種的種群遺傳結(jié)構(gòu)進(jìn)行了進(jìn)一步的分析,以期對(duì)其能有更好的理解。首先利用RAD測(cè)序的方法,開(kāi)發(fā)了墨吉明對(duì)蝦多態(tài)性微衛(wèi)星標(biāo)記。結(jié)果共獲得多態(tài)性墨吉明對(duì)蝦微衛(wèi)星標(biāo)記23個(gè),各標(biāo)記等位基因分布范圍為3-16,各標(biāo)記的觀測(cè)雜合度(HO)和期望雜合度(HE)的分布范圍分別為0.2188-1.0000和0.4430-0.8819,而各標(biāo)記的“哈迪溫伯格”平衡測(cè)試的結(jié)果表明,5個(gè)位點(diǎn)背離了哈迪溫伯格平衡。其中只有4個(gè)位點(diǎn)顯示出中多態(tài)性(0.25PIC0.5),其余全是高度多態(tài)性(PIC0.5)。采集覆蓋墨吉明對(duì)蝦在中國(guó)沿海分布范圍的9個(gè)墨吉明對(duì)蝦自然群體,使用線粒體Control Region標(biāo)記,對(duì)中國(guó)沿海墨吉明對(duì)蝦種群遺傳結(jié)構(gòu)進(jìn)行了分析。所有的樣本共檢測(cè)到191個(gè)多態(tài)性位點(diǎn)(S),共定義181個(gè)單倍型(Nh)。墨吉明對(duì)蝦總體反映出非常高的單倍型多樣性(0.9958±0.0010)和較高的核苷酸多樣性(0.021798±0.010897)。通過(guò)構(gòu)建群體間的系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)(NJ樹(shù))發(fā)現(xiàn),來(lái)自北部灣的臨高群體(LG)、北海群體(BH)、企沙群體(QS)單獨(dú)據(jù)為一支(GOT),剩下6個(gè)群體(Clade I)成分散態(tài)勢(shì),沒(méi)有形成與地理群體對(duì)應(yīng)的分支,與地理位置沒(méi)有明顯的相關(guān)性。以組(GOT)和組(Clade I)為依據(jù),進(jìn)行組間、組內(nèi)群體間和群體的內(nèi)部的分級(jí)分子方差分析,分析結(jié)果表明,墨吉明對(duì)蝦Control Region區(qū)序列幾乎所有的遺傳差異(99.22%)均來(lái)源于群體內(nèi)部,組內(nèi)群體間和組間的遺傳差異分別占0.37%和0.41%。核苷酸不配對(duì)分布曲線分析和中性檢驗(yàn)分析均表明墨吉明對(duì)蝦群體在中國(guó)海域歷史上發(fā)生過(guò)擴(kuò)張。由此可以推算出墨吉明對(duì)蝦群體擴(kuò)張事件發(fā)生在距今115559-39518年前。屬于更新紀(jì)晚期。上述分析都說(shuō)明墨吉明對(duì)蝦群體,兩個(gè)組(GOT和Clade I)之間存在明顯的遺傳差異,組內(nèi)部各群體間遺傳差異非常微弱。采集覆蓋墨吉明對(duì)蝦在中國(guó)沿海分布范圍的9個(gè)墨吉明對(duì)蝦自然群體,使用16對(duì)微衛(wèi)星標(biāo)記,對(duì)中國(guó)沿海墨吉明對(duì)蝦種群遺傳結(jié)構(gòu)進(jìn)行了分析。所有的群體顯示出高度的基因多樣性廈門(mén)群體(He=0.5557~0.6870)。計(jì)算各自然群體對(duì)間的FST值,僅有34個(gè)群體對(duì)之間的FST值高于0.01,最高值僅為0.06049,這表明群體對(duì)之間的遺傳分歧程度普遍很低。顯著性檢驗(yàn)的結(jié)果顯示,有25個(gè)群體對(duì)之間的FST值通過(guò)了檢驗(yàn),其中,企沙群體(QS)與其他9個(gè)群體分別存在顯著性的遺傳分歧,表明企沙群體(QS)其他群體的遺傳分歧程度較大。AMOVA結(jié)果顯示,全部自然群體中僅有2.25%的遺傳變異來(lái)自于群體間,而97.75%的遺傳變異來(lái)自于群體內(nèi)部(P=0.00000),將9個(gè)群體分為北部灣組和剩余群體組兩個(gè)組,來(lái)對(duì)組間的遺傳差異程度進(jìn)行評(píng)價(jià),2個(gè)組間(P=0.00000)和組內(nèi)群體間(P=0.00000)存在微弱但是顯著性的遺傳分歧。但群體內(nèi)部雖存在較大的遺傳變異,但是不顯著(P=0.42424)。Structure軟件的分析結(jié)果表明:將種群數(shù)(K)設(shè)定為3時(shí),9個(gè)自然墨吉明對(duì)蝦群體除了處于北部灣地區(qū)的北海群體和企沙群體帶有特異的假定種群的特征外,剩余7個(gè)群體都基本帶有幾乎相同程度的各個(gè)假定種群的特征。這些結(jié)果說(shuō)明9個(gè)自然群體間存在兩個(gè)與地理位置有相關(guān)性的兩個(gè)種群。
【學(xué)位單位】：上海海洋大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】：碩士
【學(xué)位年份】：2016
【中圖分類(lèi)】：S917.4
【部分圖文】：

上海海洋大學(xué)碩士學(xué)位論文地理格局狀況，以期為墨吉明對(duì)蝦資源的開(kāi)發(fā)、保護(hù)、管理和可持續(xù)利用提供科學(xué)依據(jù)。2.1 材料與方法2.1.1 材料2.1.1.1 樣品采集根據(jù)墨吉明對(duì)蝦在中國(guó)沿海的分布范圍，設(shè)計(jì)采樣地點(diǎn)，采集我國(guó)東南沿海周邊的 9 個(gè)墨吉明對(duì)蝦群體的 250 個(gè)個(gè)體，樣品信息見(jiàn)圖（圖 2-1）和表（表2-1）。

上海海洋大學(xué)碩士學(xué)位論文2.2.2 系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系分析基于 NJ 樹(shù)以 Tamura 3-parameter 距離構(gòu)建的墨吉明對(duì)蝦 Control Region 區(qū)的系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)見(jiàn)圖（圖 2-2）。當(dāng) 9 個(gè)群體單獨(dú)聚類(lèi)時(shí)，如圖 2-2（左）所示，除北海群體（BH）與剩余 8 個(gè)群體聚類(lèi)較遠(yuǎn)，有地理分布相關(guān)外，剩余 8 個(gè)群體呈分散態(tài)勢(shì)，而將位于北部灣的三個(gè)群體（臨高群體、北海群體、企沙群體）合并為一個(gè)群體（GOT）聚類(lèi)時(shí)，如圖 2-2（右），發(fā)現(xiàn)來(lái)自北部灣的臨

圖 2-3 基于線粒體 Control Region 序列構(gòu)建的單倍型網(wǎng)絡(luò)圖Fig 2-3 Median-Network showing phylogenetic relationship among Control Regionhaplotypes of Fenneropenaeus merguiensis表 2-3 墨吉明對(duì)蝦的群體遺傳結(jié)構(gòu)Table 2-3 Genetic structuring for populations of Fenneropenaeus merguiensis variation d.f Sum of squares Variance components % variatio間 1 10.110 0.02664 Va 0.41體內(nèi)部 7 49.866 0.02411 Vb 0.37內(nèi)部 241 1557.515 6.46272 Vc 99.22

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1 胡賢德;孫成波;李鎮(zhèn)泉;陳科光;王平;李義軍;徐安敏;;北部灣墨吉明對(duì)蝦和斑節(jié)對(duì)蝦形態(tài)性狀對(duì)體質(zhì)量的影響分析[J];海南大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版);2009年01期

2 俞開(kāi)康;養(yǎng)殖對(duì)蝦病毒病的診斷和防治[J];齊魯漁業(yè);2005年01期

3 ;[J];;年期

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本文編號(hào)：2820750