課題組前期以玉米自交系鄭58為輪回親本,以昌7-2為供體親本,通過分子標(biāo)記輔助選擇獲得染色體單片段代換系Z12和W16。Z12和W16在bin2.07區(qū)域均含有1個(gè)來源于昌7-2的染色體片段,株高均顯著高于輪回親本鄭58。利用鄭58和Z12為材料構(gòu)建F2分離群體,基于重測(cè)序和混合分離分析（BSA）策略,將株高主效QTL qPH2.4定位于第2染色體13.95 Mb（201 457 953～215 022 157 bp）的區(qū)域內(nèi)。利用在目標(biāo)區(qū)間內(nèi)篩選出的20對(duì)多態(tài)性分子標(biāo)記對(duì)包含743個(gè)單株的鄭58×Z12 F2分離群體和包含1 720個(gè)單株的鄭58×W16 F2分離群體進(jìn)行基因型分析,結(jié)合田間株高數(shù)據(jù)進(jìn)行QTL定位,將株高主效QTL qPH2.4定位在InDel分子標(biāo)記ph-18和ph-19之間,區(qū)間的遺傳距離為0.57 cM,物理距離為626 kb。參考B73基因組（RefGen_v4）注釋信息,該區(qū)間內(nèi)存在17個(gè)注釋基因,其中,包含可以調(diào)控油菜素內(nèi)酯信號(hào)的基因Zm00001d006677。 

【文章來源】：玉米科學(xué). 2020,28(02)北大核心CSCD

【文章頁數(shù)】：8 頁

【部分圖文】：

圖1 株高性狀相關(guān)區(qū)域的鑒定

2017年于北京昌平調(diào)查表型數(shù)據(jù)，在包含743個(gè)單株的F2分離群體中，株高變異范圍在120～202 cm，平均為160.5 cm，雙向均存在具有超親現(xiàn)象的個(gè)體。由圖2所示，依據(jù)分子標(biāo)記ph-16的3種帶型(鄭58帶型、Z12帶型、雜合帶型)，將743個(gè)單株分為3組，分別統(tǒng)計(jì)每組內(nèi)的株高的次數(shù)分布。Z12帶型的單株偏態(tài)分布于右側(cè)，鄭58帶型的單株偏態(tài)分布于左側(cè)。2.2.3 鄭58×Z12的F2分離群體QTL定位

根據(jù)QTL IciMapping軟件格式要求整理表型數(shù)據(jù)，然后導(dǎo)入該軟件中進(jìn)行遺傳連鎖圖譜構(gòu)建。13個(gè)標(biāo)記在遺傳圖譜中的相對(duì)位置與B73參考基因組的物理位置基本一致。該圖譜全長(zhǎng)16.963 cM，平均遺傳距離為1.41 cM。利用軟件中的ICIM-ADD方法進(jìn)行QTL作圖分析，LOD臨界值為3.0時(shí)，將株高QTL定位于InDel分子標(biāo)記ph-15和ph-19之間，期間的遺傳距離為2.67 cM，物理距離為2475.321 kbp(211 618 757～214 094 078)，最大LOD值為35.13，可解釋株高20.37%的表型變異。該QTL加性效應(yīng)為8.38，顯性效應(yīng)為0.93，其遺傳效應(yīng)表現(xiàn)為加性效應(yīng)，命名為qPH2.4(圖3)。2.2.4 鄭58、W16及其F2分離群體的表型分析

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
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本文編號(hào)：3584125