文冠果bZIP轉錄因子家族鑒定和非生物脅迫應答模式分析
發(fā)布時間:2024-06-14 19:31
文冠果是我國特有的珍稀木本糧油樹種,其環(huán)境適應能力極強,具有耐寒、耐旱、耐貧瘠、耐鹽堿等生理特性。由于文冠果基因組信息不完善,其分子機理方面的研究鮮有報道。堿性亮氨酸拉鏈(bZIP)轉錄因子家族是真核生物中分布最廣泛且最保守的轉錄因子家族之一,在調節(jié)植物的生長發(fā)育和響應生物及非生物脅迫中發(fā)揮著至關重要的作用。文冠果全基因組測序的完成為從分子層面揭開文冠果抗逆響應機理奠定了基礎。本研究首次在文冠果全基因組數(shù)據中挖掘bZIP家族基因,并對其進行了系統(tǒng)地分析,得出以下結論:1、根據文冠果全基因組測序信息,從文冠果基因組中鑒定得到64個文冠果bZIP家族轉錄因子。2、基于XsbZIP與AtbZIP、ZmbZIP和GmbZIP轉錄因子家族成員的系統(tǒng)發(fā)育關系構建進化樹,將64個XsbZIP轉錄因子家族成員分為11個亞家族(A至I,S和U)。3、根據bZIP結構域堿性區(qū)和鉸鏈區(qū)內含子數(shù)量、位置和相位,將XsbZIP基因分為五種模式(a、b、c、d和e)。4、共鑒定出XsbZIP轉錄因子中的20個保守基序,某些保守基序可能賦予了基因特定的功能。5、相比于串聯(lián)重復,片段重復在文冠果bZIP基因家族的擴增...
【文章頁數(shù)】:65 頁
【學位級別】:碩士
【部分圖文】:
本文編號:3994324
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圖24A^Z//>基因bZIP結構域堿性區(qū)和鉸鏈區(qū)內含子模式??根據內含子數(shù)量、位置和相位,文冠果6Z/P家族基因可被分為五種模式(a、6、c、d和e)
?東北林業(yè)大學碩士學位論文???堿性區(qū)?鉸鏈區(qū)??內含子模式內含子數(shù)量?^^——^?XsbZIP蛋白數(shù)目?亞家族??-25?-20?-15?-10?-5?+1??P0??17?九?G,U??|P0?|P0???^??b?D??1?19?C,E,H,I,U??|P2?.??0?16....
圖3非生物脅迫和ABA處理后jMZ//5基因表達模式??(a)文冠果6Z/尸基因表達模式熱圖
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