本文選題：分子動力學(xué)模擬 + 數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu)��； 參考：《計算機科學(xué)與探索》2017年03期

【摘要】：分子動力學(xué)模擬是研究材料輻照效應(yīng)下微觀結(jié)構(gòu)演化的重要工具。對4款主流材料計算大規(guī)模分子動力學(xué)開源軟件LAMMPS、Ls1-MarDyn、IMD和CoMD進行了詳細的介紹,從數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu)、計算方法、并行分解方式、原子存儲等多個方面進行了橫向分析比較。通過設(shè)計算例測試了各軟件的計算效率、并行性能和內(nèi)存使用情況。針對壓力容器關(guān)鍵材料輻照缺陷演化計算特點,提出了設(shè)計節(jié)省存儲空間的面向單晶的新型數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu)的設(shè)想,為后續(xù)實現(xiàn)大時空尺度分子動力學(xué)模擬研究提供了研究基礎(chǔ)。
[Abstract]:The molecular dynamics simulation is an important tool to study the evolution of microstructure evolution under the irradiation effect of material . The calculation efficiency , parallel performance and memory usage of each software are compared from data structure , calculation method , parallel decomposition method and atom storage .

【作者單位】： 中國科學(xué)院計算機網(wǎng)絡(luò)信息中心;北京科技大學(xué)計算機與通信工程學(xué)院;中國科學(xué)院計算技術(shù)研究所;中國原子能科學(xué)研究院;
【基金】：國家自然科學(xué)基金No.61303050 國家高技術(shù)研究發(fā)展計劃(863計劃)No.2015AA01A303 中國科學(xué)院青年創(chuàng)新促進會項目No.2015375;中國科學(xué)院信息化專項No.XXH2503-02~~
【分類號】：TB303;TP319

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本文編號：1864940