本文關(guān)鍵詞： 根結(jié)線蟲 根際細(xì)菌 真菌 宏基因組學(xué) 種群多樣性變化　出處：《云南大學(xué)》2015年碩士論文　論文類型：學(xué)位論文

【摘要】：根結(jié)線蟲是一類植物寄生性線蟲,會引起植物根形成根結(jié),并更容易讓植物感染其他病害,造成我國農(nóng)業(yè)損失慘重。而根結(jié)線蟲病的發(fā)生與作物根際微生物有密不可分的關(guān)系。本文以根結(jié)線蟲病害土壤為研究對象,用高通量測序方法研究根結(jié)線蟲不同病害程度土壤的微生物群落結(jié)構(gòu)和動態(tài)演變規(guī)律,挖掘不同時間、地點的優(yōu)勢菌群,為探索預(yù)防根結(jié)線蟲危害作物新策略提供理論基礎(chǔ)。 結(jié)果如下： 1、比較分析根結(jié)線蟲病害土壤的細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)。主要優(yōu)勢細(xì)菌門主要有變形菌門、綠彎菌門、泉古菌門、放線菌門。主要優(yōu)勢細(xì)菌科有Nitrososphaeraceae、 Gaiellaceae、Xanthomonadaceae、Nocardioidaceae、Gemmataceae、Pseudomonadaceae、主要優(yōu)勢細(xì)菌屬有Candidatus Nitrososphaera、Acinetobacter、Rubrobacter、 Pseudomonas。與元謀其他土壤相比,元謀病重土壤中變形菌門、放線菌門所占比例增加,泉古菌門、Nitrososphaeraceae、Candidatus Nitrososphaera Xanthomonadaceae和Pseudomonadaceae所占比例降低。根結(jié)線蟲的種群密度影響了土壤細(xì)菌種類,健康土壤比患病土壤含有更多的細(xì)菌種類,病重土壤比病輕土壤含有更豐富的細(xì)菌種類。隨著根結(jié)線蟲的種群密度變化,有較大變化的細(xì)菌種類是變形菌門、放線菌門、Pseudomonadaceae、Nitrososphaeraceae、Candidatus Nitrososphaera、Pseudomonas。 2、比較分析了根結(jié)線蟲病害土壤不同時段細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)。玉溪土壤的優(yōu)勢細(xì)菌門有變形菌門、泉古菌門、放線菌門、綠彎菌門。優(yōu)勢細(xì)菌科有Nitrososphaeraceae、Xanthomonadaceae、Micrococcaceae、Comamonadaceae、 Chitinophagaceae.Nocardioidaceae.優(yōu)勢細(xì)菌屬有Candidatus Nitrososphaera、 Kaistobacter、Rhodoplanes、Hydrogenophaga、Nitrospira。隨著時間變化,根結(jié)線蟲種群密度降低,細(xì)菌種類更豐富,泉古菌門、Nitrososphaeraceae、Candidatus Nitrososphaera所占比例降低,而綠彎菌門增加。根結(jié)線蟲數(shù)目的變化程度影響著細(xì)菌種類和所占比例。 3、比較分析根結(jié)線蟲病害土壤的真菌群落結(jié)構(gòu)。優(yōu)勢真菌門主要有子囊菌門、接合菌門、擔(dān)子菌門。優(yōu)勢真菌科有Mucoraceae、Pleosporaceae、Incertae_sedis、 Mycosphaerellaceae。優(yōu)勢真菌屬有Alternaria、Myrothecium、Cladosporium、 Rhizopus、Volvopluteus。隨著根結(jié)線蟲種群密度增加,真菌種類更加豐富,子囊菌門、Pleosporaceae、Incertae_sedis、Alternaria和Myrothecium所占比例增加。在根結(jié)線蟲數(shù)目較少的土壤中Rhizopus、Aspergillus、Cladosporium和Volvopluteus所占比例較大。 4、通過分離純化培養(yǎng),我們得到353株細(xì)菌、113株放線菌和54株真菌。對得到的細(xì)菌、放線菌和真菌測定根結(jié)線蟲校正致死率。分別挑選出每份土壤中校正致死率較高的10株細(xì)菌,10株放線菌和10株真菌,提取DNA, PCR擴(kuò)增,送到華大基因測序,測序后進(jìn)行BLAST比對。共鑒定了3株真菌、12株放線菌和7株細(xì)菌。真菌屬于子囊菌門下的曲霉屬和木霉屬。放線菌屬于鏈霉菌屬。兩株細(xì)菌屬于變形菌門下的不動桿菌屬。其他的細(xì)菌屬于厚壁菌門下的芽孢桿菌屬。 本論文的創(chuàng)新點有： 1.運(yùn)用宏基因組學(xué)技術(shù),比較研究了隨時間變化,根結(jié)線蟲患病土壤的細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)的變化。 2.運(yùn)用宏基因組學(xué)技術(shù),比較研究了根結(jié)線蟲患病土壤和健康土壤的真菌群落結(jié)構(gòu)的異同點。
[Abstract]:Root knot nematode is a kind of plant parasitic nematode , which causes root knot of plant root and makes it easier for plant to infect other diseases , which causes heavy agricultural loss in our country . The results are as follows : 1 . The bacterial community structure of soil with root knot nematode disease was analyzed . The main dominant bacteria were as follows : The main dominant bacteria were as follows : 1 . Nitrososphaeraceae , Gaiellaceae , Pseudomonas monadaceae , Nocardioidaceae , Gemmataceae , Pseudomonadaceae . 2 . The bacterial community structure of root knot nematode disease was analyzed . The dominant bacterial door of Yuxi soil was deformed bacteria door , spring ancient fungus door , actinomyces door , and green bending fungus door . The dominant bacteria were Nitrososphaeraceae , Neisseria monadaceae , Micrococcaceae , Comamonadaceae , Chitinaceae , Nocardioidaceae . 3 . Comparative analysis of the fungal community structure of root knot nematode disease soil . The dominant fungus door is mainly composed of ascomycete , zygotic and basidiomycoporaceae . The dominant fungi are Mucoraceae , Pleosporaceae , Incertae _ sedis , Mycosphaerellaceae . 4 . We obtained 353 bacteria , 113 actinomyces and 54 fungi by isolation and purification . Ten strains of bacteria , 10 strains of actinomyces and 10 fungi were isolated from each soil , 10 strains of actinomyces and 10 fungi were selected , DNA was extracted , 12 strains of actinomyces and 7 bacteria were obtained . The innovation points of this paper are as follows : 1 . Using macro - genomics to compare the changes of bacterial community structure with time - varying and root - knot nematode disease . 2 . Using the technique of macro - genomics , the similarities and differences of fungal community structure of root - knot nematode affected soil and healthy soil were compared .

【學(xué)位授予單位】：云南大學(xué)
【學(xué)位級別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2015
【分類號】：S432.45

【參考文獻(xiàn)】

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本文編號：1467394