大口黑鱸PACAP基因SNPs的篩選及其與生長(zhǎng)性狀的關(guān)聯(lián)分析
本文關(guān)鍵詞:大口黑鱸PACAP基因SNPs的篩選及其與生長(zhǎng)性狀的關(guān)聯(lián)分析,由筆耕文化傳播整理發(fā)布。
【摘要】:垂體腺苷酸環(huán)化激酶多肽(pituitary adenylate cyclase-activating polypeptide,PACAP)是一種能夠促進(jìn)生長(zhǎng)激素、促性腺激素和催乳素分泌的多效激素,屬于胰高血糖素/分泌肽家族的成員。為探索PACAP基因多態(tài)性對(duì)大口黑鱸(Micropterus salmoides)生長(zhǎng)性狀的影響,本研究采用直接測(cè)序的方法在PACAP基因上檢測(cè)到一個(gè)單核苷酸多態(tài)性(single nucleotide polymorphism,SNP)位點(diǎn):A-2282C,基因型檢測(cè)共發(fā)現(xiàn)3種基因型:AA、AC和CC,其基因型頻率分別為0.034、0.645和0.321,A等位基因頻率為0.356 3,C等位基因頻率為0.643 7。隨機(jī)選取同批繁殖、同塘養(yǎng)殖的327尾大口黑鱸用Snapshot方法進(jìn)行SNPs位點(diǎn)檢測(cè)和分型,構(gòu)建最小二乘分析模型,分析基因型與生長(zhǎng)性狀的相關(guān)性。χ2檢測(cè)結(jié)果顯示,哈溫-平衡常數(shù)為0.061 5,即該位點(diǎn)在所檢測(cè)大口黑鱸群體中基本處于Hardy-Weinberg平衡狀態(tài),有效等位基因數(shù)(Ne)為1.846 5,期望雜合度(Ho)和觀測(cè)雜合度(He)分別為0.540 9和0.644 2。方差分析結(jié)果顯示,AC基因型群體的平均體質(zhì)量、體高和全長(zhǎng)相對(duì)于AA基因型群體分別增長(zhǎng)了30.6%、10.7%和8.3%,相對(duì)于CC基因型群體分別增長(zhǎng)了10.5%、4.7%和2.7%;且AC基因型群體在體質(zhì)量、體高和全長(zhǎng)上顯著高于AA和CC基因型群體(P0.05)。另外,雖然AA基因型群體的平均體質(zhì)量、體高和全長(zhǎng)相對(duì)于CC基因型群體分別增長(zhǎng)了18.1%、5.8%和5.4%,但AA型群體和CC群體在各生長(zhǎng)性狀上沒有顯著差異(P0.05)。該位點(diǎn)可能是影響大口黑鱸生長(zhǎng)性狀的的主效數(shù)量性狀核苷酸(quantitative trait nucleotides,QTN)或與之緊密連鎖,可作為大口黑鱸選育的候選分子標(biāo)記。
【作者單位】: 中國(guó)水產(chǎn)科學(xué)研究院珠江水產(chǎn)研究所/農(nóng)業(yè)部熱帶亞熱帶水產(chǎn)資源利用與養(yǎng)殖重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室;上海海洋大學(xué)水產(chǎn)與生命學(xué)院;
【關(guān)鍵詞】: 大口黑鱸 垂體腺苷酸環(huán)化激酶多肽(PACAP) SNP 生長(zhǎng)
【基金】:國(guó)家科技支撐計(jì)劃(No.2012BAD26B03) 國(guó)家自然科學(xué)基金(No.31201985) 農(nóng)業(yè)部引進(jìn)國(guó)際先進(jìn)農(nóng)業(yè)科學(xué)技術(shù)計(jì)劃(948計(jì)劃)項(xiàng)目(No.2011-G12)
【分類號(hào)】:S917.4
【正文快照】: 垂體腺苷酸環(huán)化激酶多肽(pituitary adenylatecyclase-activating polypeptide,PACAP)是魚類的一種多效激素,不僅具有刺激和提高生長(zhǎng)激素、促性腺激素、催乳激素和生長(zhǎng)乳素分泌的生物學(xué)功能(Montero et al.,1998;Matsuda et al.,2008),還參與動(dòng)物采食量(Nakata et al.,2004)和
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7 丁建華;,
本文編號(hào):490799
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