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食管癌細胞敲減LncRNA BC200后的基因表達譜芯片數(shù)據(jù)分析

發(fā)布時間:2022-07-14 20:25
  目的分析食管癌細胞敲減LncRNA BC200后的基因表達改變,并對差異表達基因(differentially expressed genes,DEGs)進行生物信息學(xué)分析,以探討B(tài)C200在食管癌細胞中的功能及作用機制。方法將食管癌細胞系EC9706細胞分為BC200敲減組、陰性對照組和空白對照組。構(gòu)建的BC200慢病毒干擾載體和無關(guān)序列載體分別感染前兩組EC9706細胞。分別應(yīng)用熒光顯微鏡和實時定量聚合酶鏈式反應(yīng)(quantitative real time polymerase chain reaction,qRT-PCR)檢測慢病毒載體感染比率和干擾效率;利用DNA微陣列技術(shù)分析敲減BC200后的EC9706細胞的基因表達改變;采用通路分析軟件(Ingenuity Pathway Analysis,IPA)分析DEGs所富集的經(jīng)典信號通路、疾病與功能以及基因相互作用網(wǎng)絡(luò),應(yīng)用qRT-PCR技術(shù)驗證從癌癥相關(guān)的基因相互作用網(wǎng)絡(luò)圖中篩選出來的差異倍數(shù)(Fold Change,FC)較高的DEGs。結(jié)果本研究中慢病毒介導(dǎo)的靶向BC200的干擾序列和無關(guān)序列均可成功感染EC9706細胞... 

【文章頁數(shù)】:70 頁

【學(xué)位級別】:碩士

【部分圖文】:

食管癌細胞敲減LncRNA BC200后的基因表達譜芯片數(shù)據(jù)分析


慢病毒介導(dǎo)的靶向BC200的干擾序列和無關(guān)序列轉(zhuǎn)染EC9706細胞(100×)

食管癌細胞敲減LncRNA BC200后的基因表達譜芯片數(shù)據(jù)分析


BC200-shRNA可顯著降低EC9706細胞BC200的表達(***P<0.001)

食管癌細胞敲減LncRNA BC200后的基因表達譜芯片數(shù)據(jù)分析


DNA微陣列數(shù)據(jù)信號值分布曲線圖

【參考文獻】:
期刊論文
[1]Updates on esophageal and gastric cancers[J]. Amy Gallo,Charles Cha.  World Journal of Gastroenterology. 2006(20)

碩士論文
[1]長鏈非編碼RNA BCYRN1在食管鱗癌中的表達水平及其生物學(xué)功能的研究[D]. 劉青青.鄭州大學(xué) 2018



本文編號:3661819

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