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水稻DGP1基因介導(dǎo)的葉綠體發(fā)育與葉綠素合成的分子機理研究

發(fā)布時間:2020-05-28 20:00
【摘要】:光合效率是影響水稻產(chǎn)量的重要因素。在本實驗室前期研究中,發(fā)現(xiàn)一個水稻深綠穗突變體dgp1(dark green panicle1),其穗色和葉色深綠,光合效率顯著增高。通過圖位克隆技術(shù)分離DGP1基因,但是其編碼蛋白功能未知。在此基礎(chǔ)上,本研究通過RNA-Seq及生物信息學(xué)分析,篩選出受DGP1基因調(diào)控的下游基因,并利用RT-qPCR和蛋白免疫印跡(Western blot)方法分別檢測光合相關(guān)基因表達量和蛋白的積累量。然后通過葉綠體自發(fā)熒光及電鏡切片分析葉綠體發(fā)育狀況,并對DGP1啟動子序列進行轉(zhuǎn)錄活性分析。最終闡述DGP1基因介導(dǎo)葉綠體發(fā)育與葉綠素合成的分子機理。首先,通過RNA-Seq分析技術(shù)和生物信息統(tǒng)計學(xué)分析,篩選dgp1突變體相比野生型表達上或下調(diào)的基因與過表達相比野生型表達上或下調(diào)的基因。兩者比較得到190個候選差異表達基因。其中有125個基因的表達量在dgp1中最高、野生型次之、過表達中最低。有65個基因在dgp1中表達量最低、野生型較高,過表達中最高。為了進一步確認候選差異表達基因的功能及參與的生物代謝途徑,進行GO分析,發(fā)現(xiàn)候選差異基因主要集中在光合、光反應(yīng)中心、葉綠體、類囊體等光合相關(guān)的場所;并進行KEGG分析,發(fā)現(xiàn)光合作用有關(guān)基因的富集率最高。然后,利用RT-qPCR對篩選出的光合相關(guān)基因表達情況進行驗證分析,結(jié)果28個光合相關(guān)基因表達量與RNA-Seq分析結(jié)果相同。再利用蛋白免疫印跡檢測光合相關(guān)蛋白的積累量,發(fā)現(xiàn)光合蛋白Lhca1、Lhca3、Lhca4、Lhcb2等在dgp1突變體中蛋白積累量最高,野生型積累量較高,過表達積累量最低。為了研究DGP1基因?qū)θ~綠體發(fā)育的影響,利用激光共聚焦顯微鏡成像檢測技術(shù)觀察水稻原生質(zhì)體形態(tài),發(fā)現(xiàn)dgp1突變體中葉綠體數(shù)量較多、形態(tài)較大,野生型相對較少,過表達中葉綠體數(shù)量只有稀少的幾個且形態(tài)較小。同時葉綠體電鏡切片分析發(fā)現(xiàn),dgp1突變體內(nèi)囊體堆集較厚,野生型內(nèi)囊體堆集較稀疏,過表達內(nèi)囊體堆集較薄。在胚芽鞘中,dgp1突變體相比野生型、過表達,較早形成葉綠體。最后,對DGP1啟動子片段進行轉(zhuǎn)錄活性分析,先對啟動子片段進行分段分析。再分別構(gòu)建分段的DGP1與GFP熒光蛋白融合表達載體,在煙草葉表皮細胞觀察綠色熒光,發(fā)現(xiàn)DGP1啟動子-195至-1352bp具有轉(zhuǎn)錄活性。對后續(xù)篩選DGP1基因的轉(zhuǎn)錄因子奠定基礎(chǔ)。綜上所述,DGP1基因突變或過表達,導(dǎo)致下游光合相關(guān)基因的表達量及蛋白積累量發(fā)生顯著變化,同時葉綠體發(fā)育也受到影響。這些結(jié)果對研究DGP1基因的分子機理及植物的高光效育種奠定了基礎(chǔ)。
【圖文】:

示意圖,光合系統(tǒng),示意圖,輔助因子


第一章文獻綜述逡逑光合系統(tǒng)I以三聚體和單體形式存在于體內(nèi)。它的結(jié)構(gòu)己被確定是最復(fù)雜的逡逑膜蛋白。PS邋I蛋白結(jié)構(gòu)如圖1.1所示I'最顯著的特征是輔助因子約占光合系統(tǒng)逡逑I總分子量的30%以上。輔助因子不僅對蛋白質(zhì)發(fā)揮作用起到?jīng)Q定性的作用,逡逑而且在PS邋I的組裝和結(jié)構(gòu)完整性中起著重要作用。光合系統(tǒng)I的一個單體單元逡逑由127種輔因子和多種不同蛋白質(zhì)(PsaA,邋PsaB,PsaC,PsaD,邋PsaE,邋PsaF,逡逑PsaG,等16個蛋白質(zhì))共價結(jié)合組成,研究表明,,大多數(shù)輔因子和蛋白質(zhì)的結(jié)逡逑合位點是特異性的且保守性較強[28]。逡逑PHOTOSYNTHESIS邐,邋H邋photosyxtlhetu;邋oirganisna邐邐Q3H+邋i邋ATP逡逑NADPHO邋H+JOQNADP+邐h,T邋l邋(7邐\逡逑h'邐CAnt邋henna邋Proteins')邐T邐I邐/邐T邋1邋(邋^邋)邋/逡逑/邋J邋\邐conqDlex邋d逡逑0邋O邋O邐O邐O逡逑HJ0邋T邋—邐2j2H+邐逡逑圖1.1光合系統(tǒng)示意圖逡逑Figl.l邋Photosynthetic邋system邋diagram逡逑大亞基PsaA和PsaB是最重要的亞基,位于PS邋I單體的中心。它們含有大逡逑部分天線系統(tǒng)的葉綠素和類胡蘿卜素以及從P700到第一個FeS簇FX的電子傳逡逑遞鏈的大部分輔助因子[29]。小疏水亞基位于PsaA和PsaB的外圍。PsaL,邋Psal逡逑和PsaM位于單體之間的界面處

氨基酸序列,復(fù)合物,葉綠素,光系統(tǒng)


2.2邋PS邋II復(fù)合物逡逑PSII是一個獨立的復(fù)合體,在葉綠體中含量較多的膜蛋白,能夠吸收光能逡逑分解水。PSII蛋白結(jié)構(gòu)如圖1.1所示;它是由LHC復(fù)合體和光合系統(tǒng)II蛋白二聚逡逑體組成。研究證明,PSII包含至少25個多肽(圖1.2),可分為天線和核心兩逡逑部分[37],其中包括穩(wěn)定結(jié)合的蛋白和瞬時結(jié)合的蛋白。天線系統(tǒng)由Lhca和Lhcb逡逑兩種捕捉色素蛋白復(fù)合物組成;:Lhcb與50個葉綠素a分子結(jié)合并與反應(yīng)中心緊密逡逑結(jié)合成內(nèi)周天線(Inner邋antennas)系統(tǒng)CP43邋和CP47(CP:邋Chi-Protein邋Complex),逡逑它們共同組成了邋ps邋n核心復(fù)合物。與ps邋ii核心具有相互作用的是第二種天線色逡逑素-捕光色素復(fù)合物Lhca,它由20-30KDa的多肽組成,并與葉綠素a、葉綠素b、逡逑葉黃素和胡蘿卜素結(jié)合[38-39]。逡逑PSII復(fù)合物,由又稱外周天線,內(nèi)周天線CP43、CP47和反應(yīng)中心RC復(fù)合逡逑物組成,CP43、CP47分局RC兩側(cè)。光系統(tǒng)II的內(nèi)部觸角CP47和CP43,分別逡逑由葉綠體基因PsbB和PsbC編碼的產(chǎn)物構(gòu)成。每個內(nèi)周天線系統(tǒng)都具有六個跨逡逑膜螺旋,它們的氨基酸序列與光系統(tǒng)I的較大反應(yīng)中心的載脂蛋白片段具有較高逡逑的同源性[40LCP47參與錳與蛋白的結(jié)合。CP29是葉綠素結(jié)合蛋白和核基因McW逡逑6逡逑
【學(xué)位授予單位】:浙江師范大學(xué)
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2018
【分類號】:S511

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本文編號:2685756

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