南寧市朝陽溪污水中諾如病毒檢測及其基因型分布
發(fā)布時間:2018-04-27 06:05
本文選題:污水 + 諾如病毒; 參考:《中國熱帶醫(yī)學》2017年04期
【摘要】:目的了解南寧市朝陽溪污水中諾如病毒(Norovirus,NV)污染狀況及其基因分布。方法應用實時熒光逆轉錄-聚合酶鏈(Realtime RT-PCR)方法對2011年采集的72份朝陽溪污水進行NV檢測,陽性標本進行基因克隆和序列測定,并進行親緣關系分析。結果 72份污水均能檢出NV,基因Ⅰ組(GenogroupⅠ,GⅠ)NV、基因Ⅱ組(GenogroupⅡ,GⅡ)NV陽性率分別為70.83%和100.00%。經親緣關系樹分析發(fā)現,測序成功的239株陽性克隆,共包含有16種不同亞型的NV,GⅠ(GⅠ.1、GⅠ.3、GⅠ.4、GⅠ.6、GⅠ.9、GⅠ.10、GⅠ.13、GⅠ.14、)、GⅡ(GⅡ.1、GⅡ.2、GⅡ.3、GⅡ.4、GⅡ.5、GⅡ.6、GⅡ.12、GⅡ.14)各8種。污水中GⅠ和GⅡNV代表株與廣西急性腹瀉病例的各亞型代表株的親緣關系密切。在污水中還檢測到37株在廣西腹瀉病例中未檢測到的基因亞型NV,占總NV檢出株數的15.48%(37/239),其中GⅠ有6個亞型、GⅡ有2個亞型。NV各亞型中檢出比例最高的是GⅡ.14,占31.80%(76/239)、GⅠ.4次之,占18.83%(45/239)。在污水中同時檢出GⅡ.4 2006年變異株與2010年變異株。結論污水監(jiān)測能從側面反映有多個基因亞型NV在南寧市人群中流行,但一些基因亞型的NV可能以隱性感染為主。
[Abstract]:Objective to investigate the pollution of Norovirus NVV and its gene distribution in the sewage of Chaoyang River in Nanning City. Methods NV was detected by real-time fluorescence reverse transcriptase-polymerase chain reaction (RT PCR) in 72 samples of Chaoyang stream sewage collected in 2011. The positive samples were cloned and sequenced. Results NVN could be detected in 72 samples of sewage. The positive rates of NV in GenogGroup 鈪,
本文編號:1809500
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