發(fā)布時間：2017-07-19 10:27

  本文關鍵詞：微小RNA miR-449a在不同分子亞型乳腺癌中的表達及生物信息學分析

  更多相關文章： 乳腺癌 miR-449a 靶基因 Bcl-2 分子亞型

【摘要】：目的：探討miR-449a和其潛在靶蛋白抗凋亡蛋白(Bcl-2)在不同分子亞型乳腺癌組織中的表達情況及其臨床應用價值；采用生物信息學方法對miR-449a靶基因進行提取和富集分析,進一步探究其生物學功能及調(diào)控機制；探討miR-449a和其潛在靶蛋白抗凋亡蛋白(Bcl-2)在不同分子亞型乳腺癌組織中的表達情況及其臨床應用價值；系統(tǒng)評價Bcl-2在乳腺癌中的表達水平及其與臨床病理特征的關系。方法：腫瘤基因圖譜(The Cancer Genome Atlas,TCGA)數(shù)據(jù)庫中下載505例存在臨床參數(shù)信息的miR-449a的表達數(shù)據(jù),統(tǒng)計miR-449a的表達與臨床參數(shù)的關系。選取58例不同分子亞型乳腺癌石蠟標本以及兩株乳腺癌細胞系,采取qRT-PCR檢測miR-449a在不同亞型中的相對表達量以及與臨床病理參數(shù)的關系。進一步利用靶基因預測軟件預測miR-449a的靶基因,通過DAVID數(shù)據(jù)庫進行GO功能注解,I KEGG通路分析以及編碼蛋白相互作用網(wǎng)絡分析。收集女性乳腺癌及相應癌旁組織石蠟標本123例,其中Luminal A型30例,Luminal B型31例,HER2過表達型33例,三陰性(TNBC)29例。采用免疫組織化SP法檢測Bcl-2蛋白的表達情況。通過計算機檢索中國知網(wǎng)、維普中文科技期刊、萬方等中文數(shù)據(jù)庫,并輔以手工檢索,評價質(zhì)量及提取資料后采用Stata11.0軟件對數(shù)據(jù)庫進行系統(tǒng)評價。結果：TCGA數(shù)據(jù)統(tǒng)計分析結果顯示：miR-449a的表達與淋巴結轉(zhuǎn)移、ER、PR、HER2狀態(tài)存在相關性,差異有統(tǒng)計學意義(P0.05)。實驗結果顯示：較癌旁正常組織相比,miR-449a在乳腺癌組織中表達下調(diào)(P0.05),其相對表達量為0.36±0.35。其表達水平在四種不同分子亞型之間沒有明顯差異(P0.05)。miR-449a的表達量與腫瘤的TNM分期和淋巴結轉(zhuǎn)移有明顯相關(P0.05),而與年齡,腫瘤直徑,組織學分級,病理類型,ER、PR、HER2的狀態(tài)無相關性(P0.05)。生物信息學結果表明：miR-449a靶基因主要富集在細胞增殖、轉(zhuǎn)錄調(diào)控和代謝、DNA特異性結合和酶結合、細胞骨架等分子過程上。KEGG通路分析涉及MAPK信號通路、P53信號通路、慢性粒細胞白血病、小細胞肺癌等疾病通路,此外還與細胞周期、內(nèi)吞作用等有關。靶基因編碼蛋白網(wǎng)絡分析結果顯示核心基因BCL2、SRC、 NOTCH1、HDAC1、CCND1、CDK6在相互作用網(wǎng)絡中起到穩(wěn)定結構的作用。在123例乳腺癌組織中,Bcl-2的陽性率77.2%(95/123),癌旁組織的陽性率為60.2%(74/123),Luminal A型、Luminal B型、HER2過表達型和三陰性癌組織中的表達率分別為86.7%(26/30)、90.3%(28/31)、72.7%(24/33)和58,6%(17/29)。乳腺癌組織中,Bcl-2陽性率較癌旁組織高,P0.05(χ2=8.337)。各分子亞型之間的差異顯著(χ2=8.337,P0.05),Bcl-2蛋白在Luminal A、Luminal B型中的表達較三陰性高。Bcl-2的表達與腫瘤TNM分期有關(P0.05),與年齡、腫瘤直徑、組織學分級、淋巴結轉(zhuǎn)移等臨床病理特征無明顯相關性。Spearman's相關分析顯示,Bcl-2的表達與miR-449a表達具有負相關性(r=-0.299,P0.05)。Meta分析結果顯示：Bcl-2在乳腺癌組及正常對照組[比值比(odds ratio,OR)=0.956,95%可信區(qū)間(confidence interval, CI)=0.469-1.950]的表達差異無統(tǒng)計學意義(P0.05)。臨床病理結果顯示：Bcl-2在乳腺癌表達水平與患者年齡、腫瘤直徑、有無淋巴結轉(zhuǎn)移、TNM分期無關(P0.05),而與組織學分級有關。Spearman等級相關分析顯示Bcl-2與ER、PR陽性率在乳腺癌中表達具有相關性(P0.05),相關系數(shù)(r)分別為0.363,0.254。結論：miR-449a在乳腺癌組織中表達下調(diào),其靶基因參與調(diào)控多個生物學過程和信號轉(zhuǎn)導通路,提示其異常表達可能在乳腺癌的發(fā)生發(fā)展中發(fā)揮重要作用。Bcl-2在不同分子亞型乳腺癌中表達有差異,且與ER, PR表達存在相關性,與miR-449a的表達存在負相關。miR-449a可能潛在靶向Bcl-2參與乳腺癌的進程。
【關鍵詞】：乳腺癌 miR-449a 靶基因 Bcl-2 分子亞型
【學位授予單位】：廣西醫(yī)科大學
【學位級別】：碩士
【學位授予年份】：2016
【分類號】：R737.9
【目錄】：

• 個人簡歷3-5
• 中文摘要5-8
• 英文摘要8-11
• 前言11-17
• 參考文獻14-17
• 第一部分 微小RNA miR-449a在乳腺癌組織中的表達及臨床意義17-40
• 前言17-18
• 材料與方法18-29
• 結果29-35
• 討論35-37
• 結論37-38
• 參考文獻38-40
• 第二部分 miR-449a潛在靶基因的生物信息學分析40-54
• 前言40-41
• 材料與方法41-43
• 結果43-49
• 討論49-51
• 結論51-52
• 參考文獻52-54
• 第三部分 miR-449a與其潛在靶蛋白Bcl-2的關系研究54-84
• 前言54-55
• 材料與方法55-59
• 結果59-63
• 討論63-75
• 結論75-76
• 參考文獻76-84
• 全文總結84-86
• 綜述86-101
• 參考文獻93-101
• 附錄101-103
• 致謝103-105
• 攻讀學位期間發(fā)表的學術論文105

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本文編號：562430