目的:分析異基因造血干細胞移植(allo-HSCT)后T細胞免疫組庫的基本特征和動態(tài)演變,在TCR免疫組庫水平理解移植后T細胞免疫重建的規(guī)律,分析其對移植后復(fù)發(fā)、Gv HD、病毒感染等主要并發(fā)癥產(chǎn)生的影響,探索其對臨床工作的指導(dǎo)作用和應(yīng)用前景。方法:入組進行allo-HSCT的惡性血液病病人30例,分別對其移植物(d0)、移植后1個月(d28)和移植后2個月(d61)的外周血進行高通量測序,得到的TCRβ鏈CDR3免疫組庫結(jié)合患者隨訪1年的臨床數(shù)據(jù)進行分析�；诮M庫數(shù)據(jù)特征和研究目的,創(chuàng)造性地設(shè)計T細胞響應(yīng)指數(shù)(TCRI),分析其特性后將其運用到數(shù)據(jù)的統(tǒng)計分析中。結(jié)果:1.allo-HSCT后TCR免疫組庫的反Simpson多樣性指數(shù)不斷下降(僅d0和d61之間p=0.01),克隆性指數(shù)不斷上升(p=0.001),非復(fù)發(fā)組d28克隆性指數(shù)顯著高于復(fù)發(fā)組(p=0.018),急性Gv HD組和無急性Gv HD組、CMV激活組和無CMV激活組之間均無顯著差異。2.半相合移植組的TCRI在第一個月(TCRI200ab)、第二個月(TCRI200bc)和前兩個月(TCRI200ac)均顯著高于非半...

【文章頁數(shù)】：109 頁

【學(xué)位級別】：博士

【文章目錄】：
縮略語表
摘要
Abstract
前言
第一章 研究背景
    1.1 造血干細胞移植
        1.1.1 造血干細胞移植的發(fā)展過程
        1.1.2 造血干細胞移植的分類
        1.1.3 造血干細胞移植的過程
        1.1.4 造血干細胞采集物的成分
        1.1.5 造血干細胞移植后的主要并發(fā)癥
    1.2 移植后免疫重建
        1.2.1 allo-HSCT后免疫細胞數(shù)量和功能重建
        1.2.2 allo-HSCT后患者T細胞來源和重建
        1.2.3 allo-HSCT后抗原提呈與識別
    1.3 TCR免疫組庫
        1.3.1 TCR
        1.3.2 T細胞免疫組庫
        1.3.3 下一代測序技術(shù)
        1.3.4 相關(guān)研究進展
    1.4 本研究的主要目的和研究思路
第二章 實驗與數(shù)據(jù)可靠性分析
    2.1 實驗流程和倫理申報
        2.1.1 實驗流程圖
        2.1.2 倫理申報
        2.1.3 臨床試驗注冊
    2.2 提取單個核細胞RNA
        2.2.1 實驗材料
        2.2.2 實驗方法
        2.2.3 實驗注意事項
    2.3 免疫組庫高通量測序
        2.3.1 測序的流程
        2.3.2 TCR免疫組庫高通量測序
    2.4 測序數(shù)據(jù)規(guī)律分析
        2.4.1 測序數(shù)據(jù)重復(fù)性
        2.4.2 測序數(shù)據(jù)代表性
        2.4.3 測序數(shù)據(jù)偏倚
第三章 新指數(shù)的設(shè)計與特點
    3.1 新指數(shù)的設(shè)計
        3.1.1 本研究的指導(dǎo)思想
        3.1.2 數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu)
        3.1.3 新指數(shù)的設(shè)計過程
    3.2 新指數(shù)的特點
        3.2.1 新指數(shù)的特征
        3.2.2 新指數(shù)的優(yōu)缺點
        3.2.3 應(yīng)用新指數(shù)的注意事項
    3.3 新指數(shù)與常用指數(shù)對比
        3.3.1 分析免疫組庫的常用指數(shù)
        3.3.2 新指數(shù)與傳統(tǒng)常用指數(shù)對比
第四章 結(jié)果分析與討論
    4.1 移植后早期TCR組庫特征
        4.1.1 統(tǒng)計分析方法
        4.1.2 患者的臨床數(shù)據(jù)
        4.1.3 患者的測序數(shù)據(jù)
        4.1.4 移植后TCR免疫組庫多樣性和克隆性變化趨勢
        4.1.5 討論
    4.2 TCR組庫動態(tài)變化與移植后主要并發(fā)癥
        4.2.1 移植后TCR組庫中的主要克隆
        4.2.2 移植后免疫組庫不平行擴增與臨床并發(fā)癥的關(guān)系
        4.2.3 VDJ片段使用率及氨基酸組成與臨床并發(fā)癥
        4.2.4 討論
    4.3 GvL相關(guān)克隆共性分析
        4.3.1 GvL相關(guān)克隆的共性分析
        4.3.2 患者間共享特異性的GvL相關(guān)克隆特征
        4.3.3 討論
第五章 結(jié)論與展望
參考文獻
作者在學(xué)期間取得的學(xué)術(shù)成果
主要簡歷
致謝



本文編號：4006445