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熒光原位雜交基因探針診斷Xp11.2易位性腎癌和ASPL-TFE3腎癌

發(fā)布時間:2021-04-13 04:06
  Xp11.2易位/TFE3基因融合相關(guān)性腎癌(簡稱Xp11.2易位性腎癌)是2004年WHO新分類的一種腎癌亞型,它是以TFE3基因斷裂,并與ASPL、PRCC、 CLTC、PSF、NonO等相關(guān)基因發(fā)生平衡易位,形成TFE3融合基因為特征。其主要好發(fā)于青少年,約占兒童腎癌的1/3,45歲以下腎癌的15%,占成年腎癌患者的1%左右。該腎癌預后總體較差,對于常規(guī)的放化療均不敏感,手術(shù)治療是主要方式,但多數(shù)患者易出現(xiàn)遠處轉(zhuǎn)移,靶向治療部分有效。Xp11.2易位性腎癌的準確診斷對判斷患者的預后以及術(shù)后的輔助治療至關(guān)重要。但是,目前Xp11.2易位性腎癌的診斷主要是停留在組織學水平和免疫組化水平,相關(guān)研究提示這些方法存在誤診和漏診的可能。在Xp11.2易位性腎癌所有融合基因類型中,ASPL-TFE3腎癌是發(fā)病率最高的一種,也是預后最差的一種,目前仍沒有適合于臨床的方法診斷該腎癌。因此進一步準確診斷Xp11.2易位性腎癌和ASPL-TFE3腎癌,值得進一步的研究與探索。為此,我們設計了TFE3分離探針用于診斷Xp11.2易位性腎癌以及ASPL-TFE3雙融合探針用于診斷ASPL-TFE3腎癌。目... 

【文章來源】:南京大學江蘇省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校

【文章頁數(shù)】:51 頁

【學位級別】:碩士

【部分圖文】:

熒光原位雜交基因探針診斷Xp11.2易位性腎癌和ASPL-TFE3腎癌


圖2-1:?TFE3分離探針設計模式圖??

設計模式,探針,日化,名稱


RPll-?RPll-?RPll-??63?化?10?日化16?475F12??國2-2;?ASPL^E3雙融合探針中ASPL段設計模式圖??表2-3?ASPLTFE3雙諫合探針TFE3基因處BAC克隆的基本信息??克隆名稱?定位?片段大小??CTD-2516D6?chrX:4826%3?6-48484403?218Kb??CTD-2522M13?chrX:48420425-4%02847?182Kb??RP11-416B14?chrX:48580872-48763I98?182Kb??CTD-2311N12?XPl?1:48713289-48923401?210Kb??CTD-2312C1?chrX:48959513-49170367?210Kb??CTD-2248C21?chrX:49154756-4?>242991?88Kb??RPH-9?巧?H17?chrX:4?犯93025-49440119?147Kb??

片段,信息學,生物信息學分析,生物學


3.2對所選BAC克隆進行生物信息學分析??(1)通過Ensemble數(shù)據(jù)庫了解所選克隆在染色體中的位置,W及周圍基因??情況。??口)通過http://projects.tcag.ca/efi油網(wǎng)站對所選的BAC克隆的恃異性分析進??行生物學信息學分析,明確其所選克隆的特異性。確定BAC克隆,從invitrogen??公司訂購該克隆。??eFISH?Result??

【參考文獻】:
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本文編號:3134583

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