肺癌中Hsa-miR-98靶基因生物信息學分析
發(fā)布時間:2018-06-05 05:06
本文選題:肺鱗癌 + Hsa-miR-; 參考:《生物技術(shù)》2017年04期
【摘要】:[目的]分析肺鱗癌中Hsa-miR-98的靶基因及參與的生物學過程和信號通路。[方法]分析TCGA中收錄的肺鱗癌患者的Hsa-miR-98及生存數(shù)據(jù),通過4個靶基因數(shù)據(jù)庫和表達數(shù)據(jù)分析Hsa-miR-98靶基因,利用Bi NGO富集分析靶基因功能,通過DAVID數(shù)據(jù)庫富集分析靶基因信號通路。[結(jié)果]高表達Hsa-miR-98延長肺鱗癌患者總生存率和無復發(fā)生存率。綜合4個數(shù)據(jù)庫分析結(jié)果,得到Hsa-miR-98的113個靶基因,其中82個在肺鱗癌患者癌與癌旁差異表達。GO分析表明4個基因參與細胞膠原的組成,59個基因參與細胞的生命活動,KEGG通路富集到7條通路,包括腫瘤發(fā)生發(fā)展、阿米巴運動、胞外基質(zhì)的形成等。[結(jié)論]82個Hsa-miR-98靶基因通過7條信號通路,影響細胞生命活動,進而調(diào)控腫瘤發(fā)生發(fā)展,使高表達Hsa-miR-98患者生存期延長。
[Abstract]:Objective : To analyze the target gene of Hsa - miR - 98 in lung squamous cell carcinoma and the biological process and signal pathway involved in lung squamous cell carcinoma .
【作者單位】: 天津醫(yī)科大學腫瘤醫(yī)院天津市腫瘤研究所公共實驗室國家腫瘤臨床醫(yī)學研究中心天津市腫瘤防治重點實驗室天津市惡性腫瘤臨床醫(yī)學研究中心;
【基金】:國家自然科學基金項目(“Anxa2介導IL-6誘導的SHP2/Erk和JAK2/STAT3信號通路激活并促進乳腺癌細胞上皮間質(zhì)轉(zhuǎn)化的分子機制研究”,No.81372844)
【分類號】:Q811.4;R734.2
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本文編號:1980671
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