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基于網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)的小兒肺熱咳喘顆?构跔畈《咀饔脵C制探討

發(fā)布時間:2024-03-01 18:28
  目的探索小兒肺熱咳喘顆?构跔畈《镜臐撛谧饔脵C制。方法在TCMIP數(shù)據(jù)庫中查找小兒肺熱咳喘顆粒的各藥材-成分-靶點信息,同時檢索全方的候選靶基因,在Genecards數(shù)據(jù)庫中以"coronavirus"為關(guān)鍵詞搜索冠狀病毒相關(guān)靶點,與小兒肺熱咳喘顆粒全方活性靶點映射篩選出共同靶點作為研究靶點。將篩選出的共同靶點在已經(jīng)總結(jié)的各藥材-成分-靶點數(shù)據(jù)庫中查找到對應(yīng)的成分及所屬藥材。將共同靶點導(dǎo)入STRING數(shù)據(jù)庫中構(gòu)建靶點相互作用網(wǎng)絡(luò)圖,利用Cytoscape3.3.0軟件進行可視化處理,篩選出核心靶點。借助OmicsBean分析平臺與STRING數(shù)據(jù)庫對靶點進行基因本體(geneontology,GO)分析和KEGG信號通路富集分析。結(jié)果總結(jié)得到小兒肺熱咳喘顆粒342個化學(xué)成分,全方靶基因共有737個。Venny映射后的共同靶點48個,對應(yīng)173個化合物,核心靶點19個,主要化合物27個。GO生物過程(BP)條目3420個,細(xì)胞組成(CC)條目239個,分子功能(MF)條目343個。KEGG富集分析得到與小兒肺熱咳喘顆粒治療作用相關(guān)的信號通路160條。構(gòu)建了小兒肺熱咳喘顆粒核心靶點的"藥材...

【文章頁數(shù)】:8 頁

【部分圖文】:

圖1小兒肺熱咳喘顆粒相關(guān)蛋白靶點的PPI網(wǎng)絡(luò)

圖1小兒肺熱咳喘顆粒相關(guān)蛋白靶點的PPI網(wǎng)絡(luò)

將小兒肺熱咳喘顆粒48個冠狀病毒相關(guān)靶點蛋白輸入至STRING數(shù)據(jù)庫,構(gòu)建靶蛋白PPI網(wǎng)絡(luò)。該網(wǎng)絡(luò)共有47個節(jié)點,276條相互作用關(guān)系,平均度值為11.7。將在STRING平臺中構(gòu)建的PPI網(wǎng)絡(luò)數(shù)據(jù)導(dǎo)入Cytoscape3.3.0中(圖1),度值降序排列篩選出大于平均度值12的....


圖2小兒肺熱咳喘顆粒相關(guān)蛋白靶點的GO富集分析

圖2小兒肺熱咳喘顆粒相關(guān)蛋白靶點的GO富集分析

分析富集的通路發(fā)現(xiàn),主要有腫瘤壞死因子信號通路(TNFsignalingpathway)、乙型肝炎病毒(HepatitisB)、阿米巴類感染(Amoebiasis)、查加斯。绹F蟲。–hagasdisease(Americantrypanosomiasis));....


圖3小兒肺熱咳喘顆粒相關(guān)蛋白靶點KEGG通路富集分析的前10條通路

圖3小兒肺熱咳喘顆粒相關(guān)蛋白靶點KEGG通路富集分析的前10條通路

圖2小兒肺熱咳喘顆粒相關(guān)蛋白靶點的GO富集分析2.5小兒肺熱咳喘顆!八幉-成分-靶點-通路”網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建


圖4小兒肺熱咳喘顆!八幉-成分-靶點-通路”網(wǎng)絡(luò)

圖4小兒肺熱咳喘顆!八幉-成分-靶點-通路”網(wǎng)絡(luò)

將“2.3”項得到的19個核心靶點在已經(jīng)總結(jié)的各單味藥材成分-靶基因數(shù)據(jù)庫中查找到對應(yīng)的化學(xué)成分及所屬藥材,在Excel表格中建立藥材-成分、成分-靶點、靶點-通路的相互對應(yīng)關(guān)系,然后導(dǎo)入Cytoscape3.3.0軟件中構(gòu)建網(wǎng)絡(luò)(圖4)。通過拓?fù)鋵傩苑治霭l(fā)現(xiàn),該網(wǎng)絡(luò)有102....



本文編號:3915643

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