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基于代謝組學(xué)與轉(zhuǎn)錄組學(xué)結(jié)合的方法研究刺五加治療腦缺血再灌注損傷的作用機(jī)制

發(fā)布時(shí)間:2023-04-03 22:26
  缺血性腦損傷是世界范圍內(nèi)致死和致殘的主要原因之一,針對(duì)該疾病的藥物開發(fā)也引起了越來越多的關(guān)注。腦缺血通常是由血栓或血栓栓塞性動(dòng)脈閉塞引起的短暫或永久性的腦血流減少引起的。及時(shí)得恢復(fù)腦部血液的灌注而設(shè)計(jì)的溶栓治療被認(rèn)為是缺血性腦損傷的主要合理治療策略。然而,溶栓治療后再灌注往往導(dǎo)致病灶周邊一系列的細(xì)胞、生化和代謝后果,包括細(xì)胞內(nèi)活性氧(ROS)生成、鈣超載、興奮性細(xì)胞損傷和炎癥,最終導(dǎo)致不可逆性腦損傷。腦缺血再灌注損傷的發(fā)病機(jī)制十分復(fù)雜,單一藥物的治療效果不佳,而聯(lián)合給藥很容易導(dǎo)致交叉反應(yīng)和未知的副作用。中藥保護(hù)劑的開發(fā)是腦缺血再灌注損傷及相關(guān)神經(jīng)退行性疾病治療的一個(gè)很有前途的方向。但因中藥成分復(fù)雜導(dǎo)致其用傳統(tǒng)研究方式難以闡明其作用機(jī)制及作用靶點(diǎn)。代謝組學(xué)和轉(zhuǎn)錄組學(xué)的結(jié)合是一種強(qiáng)有力的分析工具,通過鑒定出一系列的基因及代謝產(chǎn)物,可以揭示表型相關(guān)的基因功能和代謝途徑。因此,本文旨在通過代謝組與轉(zhuǎn)錄組結(jié)合的方式揭示兩種組學(xué)結(jié)果之間的聯(lián)系和聯(lián)合后的功能信息,從而闡明刺五加提取物治療腦缺血再灌注損傷的機(jī)制。1.刺五加提取物治療大鼠腦缺血再灌注的藥效學(xué)研究為了研究研究刺五加提取物(ASE)對(duì)wis...

【文章頁數(shù)】:95 頁

【學(xué)位級(jí)別】:碩士

【文章目錄】:
致謝
中文摘要
abstract
引言
縮略詞表
文獻(xiàn)綜述
    1.單一組學(xué)概述
        1.1 基因組學(xué)
        1.2 轉(zhuǎn)錄組學(xué)
        1.3 代謝組學(xué)
        1.4 蛋白組學(xué)
        1.5 組學(xué)技術(shù)的延伸
    2.多組學(xué)數(shù)據(jù)處理與分析發(fā)展現(xiàn)狀
        2.1 數(shù)據(jù)處理方面
        2.2 數(shù)據(jù)處理平臺(tái)
        2.3 在線數(shù)據(jù)庫
    3 應(yīng)用
        3.1 生物功能的開發(fā)利用
        3.2 新藥研發(fā)
        3.3 疾病診斷與防治
        3.4 精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)
    4 多基因組技術(shù)面臨的挑戰(zhàn)與機(jī)遇
第一章 刺五加提取物對(duì)腦缺血再灌注損傷的藥效學(xué)研究
    1 實(shí)驗(yàn)材料與方法
        1.1 藥物的提取與制備
        1.2 實(shí)驗(yàn)材料與設(shè)備
    2 腦缺血再灌注模型建立方法
    3 樣品處理方法
        3.1 行為學(xué)評(píng)分標(biāo)準(zhǔn)與梗死面積計(jì)算
        3.2 HE染色與TUNEL檢測(cè)
        3.3 生化指標(biāo)測(cè)定
        3.4 統(tǒng)計(jì)學(xué)方法
    4 實(shí)驗(yàn)結(jié)果
        4.1 ASE治療后對(duì)大鼠行為學(xué)評(píng)分和腦梗死面積百分比的影響
        4.2 ASE治療后大鼠腦切片組織病理學(xué)變化
        4.3 ASE治療作用對(duì)大鼠腦組織中SOD,GSH-Px活性和MDA含量的影響
        4.4 ASE治療作用對(duì)大鼠腦組織中IL-6,IL-1β和 TNF-α水平的影響
    5 討論
第二章 刺五加提取物治療大鼠腦缺血再灌注損傷的血漿代謝組學(xué)研究
    1.實(shí)驗(yàn)材料
        1.1 實(shí)驗(yàn)儀器
        1.2 實(shí)驗(yàn)試劑
        1.3 提取物制備
    2.實(shí)驗(yàn)方法
        2.1 實(shí)驗(yàn)動(dòng)物處理與樣本收集
        2.2 血漿樣本前處理及LC-MS條件
        2.3 數(shù)據(jù)處理及模式識(shí)別方法
        2.4 代謝通路的富集分析
    3.實(shí)驗(yàn)結(jié)果
        3.1藥效實(shí)驗(yàn)
        3.2 代謝組學(xué)方法驗(yàn)證
        3.3 代謝輪廓分析
        3.4 潛在生物標(biāo)志物的篩選與鑒定
        3.5 代謝通路富集分析
    4.討論
第三章 刺五加提取物治療大鼠腦缺血再灌注損傷的轉(zhuǎn)錄組學(xué)研究
    1.材料與儀器
        1.1 實(shí)驗(yàn)材料與試劑
        1.2 實(shí)驗(yàn)樣品采集與前處理
    2.實(shí)驗(yàn)方法
        2.1 Total RNA提取、質(zhì)檢
        2.2 序列分析文庫的構(gòu)建
        2.3 RNA-seq樣品測(cè)序與篩選
        2.4 參考序列比對(duì)分析
        2.5 基因表達(dá)水平分析
        2.6 基因表達(dá)差異分析與差異表達(dá)基因功能分析
        2.7 代謝組學(xué)與轉(zhuǎn)錄組學(xué)數(shù)據(jù)聯(lián)合分析
    3.實(shí)驗(yàn)結(jié)果
        3.1 大鼠腦組織中RNA質(zhì)檢結(jié)果
        3.2 RNA-seq樣品篩選后結(jié)果
        3.3 參考序列比對(duì)分析
        3.4 基因表達(dá)水平分析
        3.5 基因表達(dá)差異分析與篩選
        3.6 差異表達(dá)基因聚類分析
        3.7 差異表達(dá)基因功能分析
        3.8 代謝組學(xué)與轉(zhuǎn)錄組學(xué)聯(lián)合分析結(jié)果
    4.討論
總結(jié)
參考文獻(xiàn)
附錄
    附錄1
    附錄2
學(xué)位論文答辯委員會(huì)成員名單
作者簡(jiǎn)介



本文編號(hào):3781259

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