新型冠狀病毒肺炎合并高血壓靶點(diǎn)基因分析以及治療中藥預(yù)測
發(fā)布時間:2021-12-29 15:29
目的:篩選并分析新型冠狀病毒肺炎合并高血壓靶點(diǎn)基因同時探索潛在治療中藥。方法:篩選出新型冠狀病毒肺炎合并高血壓共同靶點(diǎn)基因并進(jìn)行蛋白互作,分析出高度值和血管緊張素轉(zhuǎn)換酶2(ACE2)相關(guān)的兩個模塊的重要靶點(diǎn)基因。根據(jù)兩個模塊的重點(diǎn)靶點(diǎn)基因預(yù)測相關(guān)中醫(yī)癥狀以及中藥;根據(jù)兩個模塊的重要靶點(diǎn)基因進(jìn)行GO功能分析和KEGG通路分析。結(jié)果:獲得新型冠狀病毒肺炎合并高血壓共同靶點(diǎn)基因197個,獲得高度值靶點(diǎn)基因18個和ACE2及其相關(guān)靶點(diǎn)基因共14個兩個重要靶點(diǎn)基因模塊,獲得發(fā)熱、頭痛等中醫(yī)癥狀和鉤藤、麻黃、苦杏仁、青蒿、葛根等中藥。兩個模塊的GO功能分析的細(xì)胞組分的前5個過程中的4個過程具有明顯的一致性,KEGG通路分析有共同的8個信號通路。結(jié)論:獲得了新型冠狀病毒肺炎合并高血壓靶點(diǎn)基因,并篩選和分析出重要靶點(diǎn)基因,同時也預(yù)測了具有潛在治療作用的中藥,為臨床用藥提供了參考。
【文章來源】:中國醫(yī)院藥學(xué)雜志. 2020,40(13)北大核心
【文章頁數(shù)】:8 頁
【部分圖文】:
COVID-19與高血壓靶點(diǎn)基因交集韋恩圖
交集靶點(diǎn)基因蛋白互作網(wǎng)絡(luò)圖
將兩個模塊的COVID-19合并高血壓的重要靶點(diǎn)基因去除3個重復(fù)靶點(diǎn)基因后,獲得29個靶點(diǎn)基因,分別輸入SymMap數(shù)據(jù)庫,獲得了P<0.05的中藥3 999項(xiàng)(未去重),對其歸類統(tǒng)計(jì),含有≥80項(xiàng)中藥的中藥分類見圖5。通過圖可以看出大部分中藥集中歸類于化濕藥、清熱解毒藥、清熱瀉火藥、活血祛瘀藥、補(bǔ)益藥、化痰藥、止咳平喘藥等藥;將3 999項(xiàng)中藥條目按中藥名稱篩選,中藥出現(xiàn)頻率≥10的獲得了197味,進(jìn)一步篩選出常用常見的中藥100味,見圖6。此外,在SymMap數(shù)據(jù)庫中還獲得了ACE2靶點(diǎn)基因?qū)?yīng)的中藥,為柴胡、川牛膝、葛根、葛花、貫眾、海桐皮、松子仁、委陵菜、萱草根。同時獲得P<0.05的中醫(yī)癥狀426項(xiàng),出現(xiàn)頻率≥7的中醫(yī)癥狀見圖7。通過圖可以看出中醫(yī)癥狀集中于發(fā)熱、發(fā)燒、頭痛、頭項(xiàng)痛、肌肉痛等癥狀。此外,載脂蛋白E(apolipoprotein E,APOE)等9個靶點(diǎn)基因所對應(yīng)的癥狀未能統(tǒng)計(jì)在圖7中,但這個9靶點(diǎn)基因?qū)?yīng)的中醫(yī)癥狀也同等重要,其對應(yīng)癥狀見圖8。圖4 14個靶點(diǎn)基因蛋白互作圖
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]托珠單抗在新型冠狀病毒治療中的臨床藥學(xué)指引[J]. 張建紅,朱立勤,劉子艷,劉玉媛. 中國醫(yī)院藥學(xué)雜志. 2020(10)
[2]指南推薦中藥注射劑在新型冠狀病毒肺炎治療的應(yīng)用及藥學(xué)監(jiān)護(hù)[J]. 王曉陽. 中國醫(yī)院藥學(xué)雜志. 2020(08)
[3]肝脾辨治在新型冠狀病毒肺炎診治中的思考[J]. 杜宏波,張耀圣,王彤,梁騰霄,孟捷,吳華陽,楊先照,吳崢嶸,葉永安. 世界中醫(yī)藥. 2020(03)
[4]苦參多路徑抗冠狀病毒的機(jī)制探究[J]. 李振,俞科賢. 中草藥. 2020(04)
[5]中西醫(yī)結(jié)合治療新型冠狀病毒肺炎作用的思考[J]. 劉清泉,夏文廣,安長青,李旭成,王玉光,苗青,楊豐文,張伯禮. 中醫(yī)雜志. 2020(06)
[6]Clinical and biochemical indexes from 2019-nCoV infected patients linked to viral loads and lung injury[J]. Yingxia Liu,Yang Yang,Cong Zhang,Fengming Huang,Fuxiang Wang,Jing Yuan,Zhaoqin Wang,Jinxiu Li,Jianming Li,Cheng Feng,Zheng Zhang,Lifei Wang,Ling Peng,Li Chen,Yuhao Qin,Dandan Zhao,Shuguang Tan,Lu Yin,Jun Xu,Congzhao Zhou,Chengyu Jiang,Lei Liu. Science China(Life Sciences). 2020(03)
[7]Evolution of the novel coronavirus from the ongoing Wuhan outbreak and modeling of its spike protein for risk of human transmission[J]. Xintian Xu,Ping Chen,Jingfang Wang,Jiannan Feng,Hui Zhou,Xuan Li,Wu Zhong,Pei Hao. Science China(Life Sciences). 2020(03)
[8]盧尚嶺對高血壓的病機(jī)認(rèn)識與臨證經(jīng)驗(yàn)總結(jié)[J]. 丁元慶. 山東中醫(yī)雜志. 2020(01)
[9]SARS冠狀病毒對血液系統(tǒng)的影響及可能的機(jī)制(英文)[J]. 楊默,韓錦倫,李桂霞,霍泰輝,李志光. 中國實(shí)驗(yàn)血液學(xué)雜志. 2003(03)
本文編號:3556400
【文章來源】:中國醫(yī)院藥學(xué)雜志. 2020,40(13)北大核心
【文章頁數(shù)】:8 頁
【部分圖文】:
COVID-19與高血壓靶點(diǎn)基因交集韋恩圖
交集靶點(diǎn)基因蛋白互作網(wǎng)絡(luò)圖
將兩個模塊的COVID-19合并高血壓的重要靶點(diǎn)基因去除3個重復(fù)靶點(diǎn)基因后,獲得29個靶點(diǎn)基因,分別輸入SymMap數(shù)據(jù)庫,獲得了P<0.05的中藥3 999項(xiàng)(未去重),對其歸類統(tǒng)計(jì),含有≥80項(xiàng)中藥的中藥分類見圖5。通過圖可以看出大部分中藥集中歸類于化濕藥、清熱解毒藥、清熱瀉火藥、活血祛瘀藥、補(bǔ)益藥、化痰藥、止咳平喘藥等藥;將3 999項(xiàng)中藥條目按中藥名稱篩選,中藥出現(xiàn)頻率≥10的獲得了197味,進(jìn)一步篩選出常用常見的中藥100味,見圖6。此外,在SymMap數(shù)據(jù)庫中還獲得了ACE2靶點(diǎn)基因?qū)?yīng)的中藥,為柴胡、川牛膝、葛根、葛花、貫眾、海桐皮、松子仁、委陵菜、萱草根。同時獲得P<0.05的中醫(yī)癥狀426項(xiàng),出現(xiàn)頻率≥7的中醫(yī)癥狀見圖7。通過圖可以看出中醫(yī)癥狀集中于發(fā)熱、發(fā)燒、頭痛、頭項(xiàng)痛、肌肉痛等癥狀。此外,載脂蛋白E(apolipoprotein E,APOE)等9個靶點(diǎn)基因所對應(yīng)的癥狀未能統(tǒng)計(jì)在圖7中,但這個9靶點(diǎn)基因?qū)?yīng)的中醫(yī)癥狀也同等重要,其對應(yīng)癥狀見圖8。圖4 14個靶點(diǎn)基因蛋白互作圖
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]托珠單抗在新型冠狀病毒治療中的臨床藥學(xué)指引[J]. 張建紅,朱立勤,劉子艷,劉玉媛. 中國醫(yī)院藥學(xué)雜志. 2020(10)
[2]指南推薦中藥注射劑在新型冠狀病毒肺炎治療的應(yīng)用及藥學(xué)監(jiān)護(hù)[J]. 王曉陽. 中國醫(yī)院藥學(xué)雜志. 2020(08)
[3]肝脾辨治在新型冠狀病毒肺炎診治中的思考[J]. 杜宏波,張耀圣,王彤,梁騰霄,孟捷,吳華陽,楊先照,吳崢嶸,葉永安. 世界中醫(yī)藥. 2020(03)
[4]苦參多路徑抗冠狀病毒的機(jī)制探究[J]. 李振,俞科賢. 中草藥. 2020(04)
[5]中西醫(yī)結(jié)合治療新型冠狀病毒肺炎作用的思考[J]. 劉清泉,夏文廣,安長青,李旭成,王玉光,苗青,楊豐文,張伯禮. 中醫(yī)雜志. 2020(06)
[6]Clinical and biochemical indexes from 2019-nCoV infected patients linked to viral loads and lung injury[J]. Yingxia Liu,Yang Yang,Cong Zhang,Fengming Huang,Fuxiang Wang,Jing Yuan,Zhaoqin Wang,Jinxiu Li,Jianming Li,Cheng Feng,Zheng Zhang,Lifei Wang,Ling Peng,Li Chen,Yuhao Qin,Dandan Zhao,Shuguang Tan,Lu Yin,Jun Xu,Congzhao Zhou,Chengyu Jiang,Lei Liu. Science China(Life Sciences). 2020(03)
[7]Evolution of the novel coronavirus from the ongoing Wuhan outbreak and modeling of its spike protein for risk of human transmission[J]. Xintian Xu,Ping Chen,Jingfang Wang,Jiannan Feng,Hui Zhou,Xuan Li,Wu Zhong,Pei Hao. Science China(Life Sciences). 2020(03)
[8]盧尚嶺對高血壓的病機(jī)認(rèn)識與臨證經(jīng)驗(yàn)總結(jié)[J]. 丁元慶. 山東中醫(yī)雜志. 2020(01)
[9]SARS冠狀病毒對血液系統(tǒng)的影響及可能的機(jī)制(英文)[J]. 楊默,韓錦倫,李桂霞,霍泰輝,李志光. 中國實(shí)驗(yàn)血液學(xué)雜志. 2003(03)
本文編號:3556400
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