“白術-茯苓”藥對治療膝骨關節(jié)炎的“中藥-成分-靶點”調(diào)控網(wǎng)絡研究
發(fā)布時間:2021-11-20 00:40
目的:采用網(wǎng)絡藥理學和生物信息學方法探索"白術-茯苓"藥對治療膝骨關節(jié)炎(OA)的"中藥-成分-靶點"調(diào)控網(wǎng)絡和分子機制。方法:在BATMAN-TCM數(shù)據(jù)庫檢索白術(BAI ZHU)及茯苓(FU LING)對應的有效成分和靶點,篩選條件為score≥20且Adjusted P-value <0.05;在Gene數(shù)據(jù)庫中獲得膝骨關節(jié)炎對應的靶點,關鍵詞為"Osteoarthritis";白術-茯苓對應的靶點和骨關節(jié)炎靶點的交集作為"白術-茯苓"藥對干預骨關節(jié)炎的潛在作用靶點;使用DAVID數(shù)據(jù)庫分析靶點的GO和KEGG信號通路富集結果;基于STRING數(shù)據(jù)庫的信息分析蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)互相作用,通過Cytoscape 3.7.0軟件進行PPI網(wǎng)絡可視化構建和關鍵基因篩選。結果:"白術-茯苓"藥對總共篩選出32個有效成分,對應548個靶點;骨關節(jié)炎對應得到626個靶點;通過映射,篩選出交集靶點為71個;中藥-有效成分-靶點調(diào)控網(wǎng)絡包含94個節(jié)點,133條邊;GO功能富集結果主要涉及RNA聚合酶II啟動子轉錄的正調(diào)控、炎癥反應、轉錄的正調(diào)控,DNA模板、信號轉導、凋亡過程的負調(diào)控等,KEG...
【文章來源】:按摩與康復醫(yī)學. 2020,11(16)
【文章頁數(shù)】:6 頁
【部分圖文】:
“白術-茯苓”藥對干預骨關節(jié)炎的作用靶點
通過Cytoscape軟件構建中藥-有效成分-靶點調(diào)控網(wǎng)絡,得知調(diào)控網(wǎng)絡包含94個節(jié)點,133條邊。中藥-有效成分-靶點調(diào)控網(wǎng)絡包含2個中藥,21個有效成分,71個作用靶點。其中白術包含4個有效成分,12個作用靶點;茯苓包含17個有效成分,66個作用靶點。見表1、圖2。2.3 GO和KEGG信號通路富集結果
通過String在線數(shù)據(jù)庫分析作用靶點蛋白相互網(wǎng)絡,通過Cytoscape對PPI網(wǎng)絡進行可視化后得知PPI蛋白互作網(wǎng)絡包括68個節(jié)點,597條邊。借助cytohubba插件中3種不同算法對PPI網(wǎng)絡進行計算分析,得到3個核心網(wǎng)絡,MCC算法核心網(wǎng)絡包括10個節(jié)點,45條邊;MNC算法核心網(wǎng)絡包括10個節(jié)點,44條邊;Degree算法核心網(wǎng)絡包括10個節(jié)點,44條邊。綜合3種算法的前10個核心靶點,得到13個核心靶點,分別為:白介素6(Interleukin.6,.IL-6)、腫瘤壞死因子(Tumor.Necrosis.Factor,.TNF)、白介素1β(Interleukin.1.Beta,.IL-1β)、基質(zhì)金屬肽酶9(Matrix.Metallopeptidase.9,.MMP-9)、前列腺素內(nèi)過氧化物合酶2(Prostaglandin-Endoperoxide.Synthase.2,.PTGS2)、腫瘤蛋白P53(Tumor.Protein.P53,.TP53)、轉化生長因子β1(Transforming.Growth.Factor.Beta.1,.TGF-β1)、過氧化物酶體增殖物激活受體γ(Peroxisome.Proliferator.Activated.Receptor.Gamma,.PPARG)、胰島素樣生長因子1(Insulin.Like.Growth.Factor.1,.IGF-1)、內(nèi)皮素1(Endothelin.1,.EDN1)、Fos原癌基因,AP-1轉錄因子亞基(Fos.Proto-Oncogene,.AP-1.Transcription Factor.Subunit,.FOS)、白介素4(Interleukin.4,.IL-4)、雌激素受體1(Estrogen.Receptor.1,.ESR1),見圖3。3 討論
【參考文獻】:
期刊論文
[1]中藥影響骨代謝分子機制研究進展[J]. 張妍,王健英,邢蘊蘊,劉錕,潘穎宜,袁穎. 中草藥. 2019(20)
[2]基于NF-κB通路探討鹿角壯骨膠囊對兔膝骨關節(jié)炎的保護作用機制[J]. 梁子聰,王恒,胡建山,陸瑞娜,胡先運. 中國老年學雜志. 2019(20)
[3]基于數(shù)據(jù)挖掘的中醫(yī)藥治療骨關節(jié)炎用藥規(guī)律研究[J]. 鮑丙溪,劉健,忻凌,黃旦,孫艷秋. 風濕病與關節(jié)炎. 2019(08)
[4]基于PI3K/Akt信號通路探討電針對膝骨關節(jié)炎模型大鼠軟骨細胞凋亡的影響[J]. 張媛媛,蔣昕鈺,李西海,吳明霞. 康復學報. 2019(04)
[5]基于關聯(lián)規(guī)則挖掘健脾類中藥對骨關節(jié)炎患者免疫炎癥指標的影響[J]. 周巧,劉健,忻凌,宋倩,郭錦晨,黃旦. 時珍國醫(yī)國藥. 2017(04)
[6]辛伐他汀對膝骨關節(jié)炎大鼠MMP-3、MMP-9、TGF-β1表達的影響及作用機制[J]. 孫乃坤,王耀宗,劉志剛,付代杰,尚希福,李旭. 中國老年學雜志. 2017(05)
[7]中藥復方在病證基礎上的網(wǎng)絡藥理學研究[J]. 蔡甜甜,潘華峰,王奇,方堅松,趙金媛,林鐘宇,陳曉東. 中華中醫(yī)藥雜志. 2016(11)
[8]中藥復方新藥組方設計思路與方法[J]. 任鈞國,劉建勛. 中國中藥雜志. 2015(17)
[9]中醫(yī)藥在膝骨性關節(jié)炎治療中的應用現(xiàn)狀[J]. 周明旺,王曉萍,李盛華. 中國中醫(yī)骨傷科雜志. 2015(04)
[10]中藥復方物質(zhì)基礎研究的現(xiàn)狀與進展[J]. 趙建榮,李曉玫. 中草藥. 2003(11)
碩士論文
[1]基于中醫(yī)傳承輔助系統(tǒng)分析中藥治療膝骨關節(jié)炎的應用規(guī)律[D]. 高曼.北京中醫(yī)藥大學 2019
本文編號:3506214
【文章來源】:按摩與康復醫(yī)學. 2020,11(16)
【文章頁數(shù)】:6 頁
【部分圖文】:
“白術-茯苓”藥對干預骨關節(jié)炎的作用靶點
通過Cytoscape軟件構建中藥-有效成分-靶點調(diào)控網(wǎng)絡,得知調(diào)控網(wǎng)絡包含94個節(jié)點,133條邊。中藥-有效成分-靶點調(diào)控網(wǎng)絡包含2個中藥,21個有效成分,71個作用靶點。其中白術包含4個有效成分,12個作用靶點;茯苓包含17個有效成分,66個作用靶點。見表1、圖2。2.3 GO和KEGG信號通路富集結果
通過String在線數(shù)據(jù)庫分析作用靶點蛋白相互網(wǎng)絡,通過Cytoscape對PPI網(wǎng)絡進行可視化后得知PPI蛋白互作網(wǎng)絡包括68個節(jié)點,597條邊。借助cytohubba插件中3種不同算法對PPI網(wǎng)絡進行計算分析,得到3個核心網(wǎng)絡,MCC算法核心網(wǎng)絡包括10個節(jié)點,45條邊;MNC算法核心網(wǎng)絡包括10個節(jié)點,44條邊;Degree算法核心網(wǎng)絡包括10個節(jié)點,44條邊。綜合3種算法的前10個核心靶點,得到13個核心靶點,分別為:白介素6(Interleukin.6,.IL-6)、腫瘤壞死因子(Tumor.Necrosis.Factor,.TNF)、白介素1β(Interleukin.1.Beta,.IL-1β)、基質(zhì)金屬肽酶9(Matrix.Metallopeptidase.9,.MMP-9)、前列腺素內(nèi)過氧化物合酶2(Prostaglandin-Endoperoxide.Synthase.2,.PTGS2)、腫瘤蛋白P53(Tumor.Protein.P53,.TP53)、轉化生長因子β1(Transforming.Growth.Factor.Beta.1,.TGF-β1)、過氧化物酶體增殖物激活受體γ(Peroxisome.Proliferator.Activated.Receptor.Gamma,.PPARG)、胰島素樣生長因子1(Insulin.Like.Growth.Factor.1,.IGF-1)、內(nèi)皮素1(Endothelin.1,.EDN1)、Fos原癌基因,AP-1轉錄因子亞基(Fos.Proto-Oncogene,.AP-1.Transcription Factor.Subunit,.FOS)、白介素4(Interleukin.4,.IL-4)、雌激素受體1(Estrogen.Receptor.1,.ESR1),見圖3。3 討論
【參考文獻】:
期刊論文
[1]中藥影響骨代謝分子機制研究進展[J]. 張妍,王健英,邢蘊蘊,劉錕,潘穎宜,袁穎. 中草藥. 2019(20)
[2]基于NF-κB通路探討鹿角壯骨膠囊對兔膝骨關節(jié)炎的保護作用機制[J]. 梁子聰,王恒,胡建山,陸瑞娜,胡先運. 中國老年學雜志. 2019(20)
[3]基于數(shù)據(jù)挖掘的中醫(yī)藥治療骨關節(jié)炎用藥規(guī)律研究[J]. 鮑丙溪,劉健,忻凌,黃旦,孫艷秋. 風濕病與關節(jié)炎. 2019(08)
[4]基于PI3K/Akt信號通路探討電針對膝骨關節(jié)炎模型大鼠軟骨細胞凋亡的影響[J]. 張媛媛,蔣昕鈺,李西海,吳明霞. 康復學報. 2019(04)
[5]基于關聯(lián)規(guī)則挖掘健脾類中藥對骨關節(jié)炎患者免疫炎癥指標的影響[J]. 周巧,劉健,忻凌,宋倩,郭錦晨,黃旦. 時珍國醫(yī)國藥. 2017(04)
[6]辛伐他汀對膝骨關節(jié)炎大鼠MMP-3、MMP-9、TGF-β1表達的影響及作用機制[J]. 孫乃坤,王耀宗,劉志剛,付代杰,尚希福,李旭. 中國老年學雜志. 2017(05)
[7]中藥復方在病證基礎上的網(wǎng)絡藥理學研究[J]. 蔡甜甜,潘華峰,王奇,方堅松,趙金媛,林鐘宇,陳曉東. 中華中醫(yī)藥雜志. 2016(11)
[8]中藥復方新藥組方設計思路與方法[J]. 任鈞國,劉建勛. 中國中藥雜志. 2015(17)
[9]中醫(yī)藥在膝骨性關節(jié)炎治療中的應用現(xiàn)狀[J]. 周明旺,王曉萍,李盛華. 中國中醫(yī)骨傷科雜志. 2015(04)
[10]中藥復方物質(zhì)基礎研究的現(xiàn)狀與進展[J]. 趙建榮,李曉玫. 中草藥. 2003(11)
碩士論文
[1]基于中醫(yī)傳承輔助系統(tǒng)分析中藥治療膝骨關節(jié)炎的應用規(guī)律[D]. 高曼.北京中醫(yī)藥大學 2019
本文編號:3506214
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