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基于網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)與分子對(duì)接探索血必凈治療新型冠狀病毒感染所致的ARDS的分子機(jī)制

發(fā)布時(shí)間:2021-10-06 19:27
  目的:采用網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)和分子對(duì)接探索血必凈治療新型冠狀病毒(SARS-CoV-2)感染所致的急性呼吸窘迫綜合征(ARDS)的分子機(jī)制。方法:從數(shù)據(jù)庫(kù)中篩選ARDS差異基因及血必凈的有效活性成分和靶點(diǎn),然后對(duì)二者的共同靶點(diǎn)進(jìn)行基因本體(GO)富集分析及基因組百科全書(KEGG)通路分析,應(yīng)用STRING平臺(tái)構(gòu)建蛋白互作(PPI)網(wǎng)絡(luò)模型,利用Cytoscape軟件構(gòu)建中藥-活性化學(xué)成分-靶點(diǎn)-疾病網(wǎng)絡(luò)圖、靶點(diǎn)-富集通路網(wǎng)絡(luò)圖以篩選出核心化合物、靶點(diǎn)以及通路,最后對(duì)核心靶點(diǎn)和化合物通過分子對(duì)接進(jìn)行初步驗(yàn)證。結(jié)果:得到ARDS差異表達(dá)基因349個(gè),在血必凈中共有125個(gè)主要活性成分和1 447個(gè)預(yù)測(cè)靶點(diǎn),篩選出7個(gè)核心化合物,6個(gè)藥物-疾病共同靶點(diǎn),16條富集信號(hào)通路。分子對(duì)接結(jié)果顯示血必凈中的核心化合物與ACE2、SARS-CoV-2 3CL水解酶、AKT1、MAPK14具有較好的結(jié)合活性。結(jié)論:血必凈可能通過調(diào)控AKT1、MAPK14、ACE2、VEGF信號(hào)通路、色氨酸代謝、C型凝集素信號(hào)通路等多靶點(diǎn)、多途徑發(fā)揮對(duì)SARS-CoV-2導(dǎo)致的ARDS的治療作用。 

【文章來源】:中藥藥理與臨床. 2020,36(03)北大核心CSCD

【文章頁數(shù)】:8 頁

【部分圖文】:

基于網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)與分子對(duì)接探索血必凈治療新型冠狀病毒感染所致的ARDS的分子機(jī)制


ARDS患者差異基因火山圖

基因,患者,活性成分,靶點(diǎn)


ARDS患者差異基因熱圖(前40個(gè))

網(wǎng)絡(luò)圖,靶點(diǎn),網(wǎng)絡(luò)圖,化學(xué)成分


利用Perl軟件對(duì)ARDS差異基因、藥物預(yù)測(cè)靶點(diǎn)取交集,獲得藥物-疾病共同靶點(diǎn),應(yīng)用Cytoscape(3.7.2 )軟件構(gòu)建中藥-活性化學(xué)成分-靶點(diǎn)-疾病網(wǎng)絡(luò)圖,見圖3,在網(wǎng)絡(luò)中有76個(gè)節(jié)點(diǎn)、80個(gè)邊緣、70個(gè)活性成分和6個(gè)藥物-疾病共同靶點(diǎn)有相互作用。使用network analyzer工具,分析網(wǎng)絡(luò)中的拓?fù)鋮?shù),根據(jù) degree值得到7個(gè)核心化學(xué)成分:山柰酚(MOL000422,kaempferol)、槲皮素(MOL000098,quercetin)、楊梅酮(MOL002135,Myricanone)、豆甾醇(MOL000449,Stigmasterol)、β-胡蘿卜素(MOL002773,beta-carotene)、木犀草素(MOL000006,luteolin)、黃芩素(MOL002714,baicalein),主要集中在紅花和丹參中,AKT1,MAPK14和PTGS2為血必凈干預(yù)ARDS的主要靶點(diǎn)。2.5 PPI網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建

【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
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本文編號(hào):3420609

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