目的:基于網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué),篩選柴胡疏肝散（CSS）化學(xué)成分和潛在作用靶點,探究其治療急性胰腺炎（AP）可能的作用機制。方法:采用TCMSP數(shù)據(jù)庫檢索、篩選CSS中七味中藥柴胡、川芎、香附、白芍、枳殼、陳皮、甘草的主要活性成分及對應(yīng)蛋白靶標(biāo)。通過Drugbank和TTD數(shù)據(jù)庫收集已知調(diào)控AP的蛋白靶標(biāo),與成分對應(yīng)蛋白相對應(yīng),篩選出共有基因作為候選預(yù)測靶標(biāo)。采用String數(shù)據(jù)庫對預(yù)測靶標(biāo)進行基因本體（GO）功能分析以及KEGG通路富集分析,Discovery studio 3.0軟件對候選活性成分與候選靶標(biāo)進行虛擬對接。利用Cytoscape 3.7.2繪制"成分-靶標(biāo)"和"蛋白-通路"網(wǎng)絡(luò)圖。結(jié)果:通過口服利用度（OB）、類藥性（DL）、藥物半衰期（HL）篩選CSS全方成分,共得68個活性成分。網(wǎng)絡(luò)分析表明,CSS中的柴胡皂苷C、柴胡皂苷D、葉酸、柚皮苷、橙皮苷和甘草苷可能通過癌癥、PI3K-Akt、細(xì)胞凋亡、AGE-RAGE等信號通路來調(diào)控BCL2L1、PTGS2、MCL1、RAF1、IL-6、AKT1等25個靶點治療急性胰腺炎。結(jié)論:建立CSS-AP-靶點互作網(wǎng)絡(luò)來詮釋多成分-多靶點-... 

【文章來源】：陜西中醫(yī). 2020,41(07)

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【部分圖文】：

FDR前10名GO分析

通過TCMSP收集68個活性化合物對應(yīng)靶點,去重得到249個蛋白靶標(biāo),與TTD數(shù)據(jù)庫和DrugBank數(shù)據(jù)庫去重所得354個蛋白靶標(biāo)進行比對取交集,利用韋恩圖展示疾病靶點與成分靶點之間交集情況(圖1),紅色代表AP靶點,綠色代表CSS靶點,重疊部分為共同靶點。共得到25個交集靶點,分別為PRKCA、PPARG、PTGS1、PTGS2、MAPK14、MAPK8、MAPK1、MAPK10、GSK3B、PTGES、MDM2、APP、CASP3、CASP7、IL6、ACHE、BCL2、BCL2L1、IKBKB、AKT1、CHEK2、HMOX1、VEGFA、MCL1、RAF1,用于后續(xù)網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)分析。3 GO與KEGG富集分析

將25個預(yù)測蛋白導(dǎo)入STRING數(shù)據(jù)庫,物種選Homo sapiens,為提高準(zhǔn)確率,置信度設(shè)置為0.9,共包含25個節(jié)點,46條邊的蛋白質(zhì)相互作用網(wǎng)絡(luò)圖(PPI)(圖2)。同時,對預(yù)測蛋白進行GO分析,選取FDR排名前10名的條目建立柱狀圖(圖3),藍(lán)色為生物過程,粉色為細(xì)胞組成,黃色為分子功能。對預(yù)測蛋白進行KEGG通路分析并采用Cytoscape軟件展示FDR前20名的通路的蛋白富集情況(圖4),結(jié)果顯示,蛋白較多富集在癌癥信號通路、PI3K-Akt信號通路、細(xì)胞凋亡信號通路、AGE-RAGE信號通路和TNF信號通路等,說明CSS的活性成分可通過這些通路來干預(yù)急性胰腺炎。圖3 FDR前10名GO分析

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
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碩士論文
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本文編號：3276931