抗肝纖維化lncRNAs的轉(zhuǎn)錄組測序分析及青蒿琥酯抑制hHSC活化的機制研究
發(fā)布時間:2021-04-25 21:45
目的:首先,基于二代測序RNA-sequencing(RNA-seq)技術和高通量大數(shù)據(jù)分析方法鑒定和分析人類來源HSC細胞(human Hepatic Stellate Cell,hHSC)活化和靜止過程中差異的長鏈非編碼RNA(Long noncoding RNA,lncRNA)和mRNA表達譜改變。分析差異表達(Differentially Expressed,DE)的lncRNA可能的分子功能和參與調(diào)控的通路。鑒定出通過抑制hHSC活化的重要抗肝纖維化lncRNAs分子,為抗肝纖維化機制研究和藥物治療靶點研究提供潛在的lncRNA分子機制。最后,探討中藥單體青蒿琥酯對hHSC活化的影響,闡明青蒿琥酯參與hHSC活化或靜息內(nèi)在機制。從而發(fā)掘青蒿琥酯抗肝纖維的潛在藥物機制,為其臨床提供科學依據(jù)。方法:本研究采用丙戊酸(Valproic acid,VPA)誘導活化的hHSC靜息,建立抗肝纖維化的細胞模型;提取活化和靜止的hHSC樣品中的Total RNA建RNA文庫,應用RNA-seq技術對活化和靜息的hHSC樣品進行測序;利用HISAT對比軟件和StringTie對測序得到的rea...
【文章來源】:廣州中醫(yī)藥大學廣東省
【文章頁數(shù)】:78 頁
【學位級別】:碩士
【文章目錄】:
中文摘要
Abstract
引言
研究背景
實驗部分
第一部分 丙戊酸逆轉(zhuǎn)活化人肝星狀細胞靜息的細胞模型建立
1.1 實驗材料
1.2 實驗方法
1.3 結(jié)果
1.4 討論
1.5 小結(jié)
第二部分 抗肝纖維化相關的lncRNAs的篩選與生物信息學分析研究
2.1 實驗材料
2.2 實驗方法
2.3 實驗結(jié)果
2.4 討論
2.5 小結(jié)
第三部分 青蒿琥酯通過阻止EMT轉(zhuǎn)化抑制肝星狀細胞活化
前言
3.1 實驗材料
3.2 實驗方法
3.3 結(jié)果
3.4 討論
3.5 小結(jié)
結(jié)語和展望
參考文獻
附錄
附錄1:所有樣本RNA-seq測序數(shù)據(jù)的堿基分布圖
附錄2:所有樣本RNA-seq測序數(shù)據(jù)的堿基質(zhì)量分布圖
附錄3:本文使用的縮略語(按字母順序排列)
附錄4:碩士研究生在讀期間的研究成果
致謝
附件
【參考文獻】:
期刊論文
[1]青蒿琥酯抗肝纖維化作用機制的研究進展[J]. 錢鵬,陳劍群. 重慶醫(yī)學. 2017(02)
[2]Global epidemiology of hepatitis C virus infection: an up-date of the distribution and circulation of hepatitis C virus genotypes[J]. Arnolfo Petruzziello,Samantha Marigliano,Giovanna Loquercio,Anna Cozzolino,Carmela Cacciapuoti. World Journal of Gastroenterology. 2016(34)
[3]青蒿琥酯對肝纖維化相關分子機制的影響研究進展[J]. 白瑞丹,張洪,黃萃園. 醫(yī)學綜述. 2016(17)
[4]Effect of artesunate supplementation on bacterial translocation and dysbiosis of gut microbiota in rats with liver cirrhosis[J]. Yun-Xia Chen,Li-Na Lai,Hui-Ying Zhang,Yang-Hui Bi,Li Meng,Xu-Jiong Li,Xiao-Xia Tian,Li-Min Wang,Yi-Min Fan,Zhong-Fu Zhao,De-Wu Han,Cheng Ji. World Journal of Gastroenterology. 2016(10)
[5]Chronic hepatitis C and liver fibrosis[J]. Giada Sebastiani,Konstantinos Gkouvatsos,Kostas Pantopoulos. World Journal of Gastroenterology. 2014(32)
[6]Mechanisms of fibrogenesis in liver cirrhosis:The molecular aspects of epithelial-mesenchymal transition[J]. Sun-Jae Lee,Kyung-Hyun Kim,Kwan-Kyu Park. World Journal of Hepatology. 2014(04)
[7]肝纖維化的流行病學研究進展[J]. 范慧寧,陳尼維. 國際消化病雜志. 2014(01)
[8]中國人群乙型病毒性肝炎血清流行病學調(diào)查——乙型肝炎疫苗接種降低乙型肝炎病毒感染率[J]. 崔富強. 中國疫苗和免疫. 2010(04)
[9]江一平治療慢性肝炎肝纖維化經(jīng)驗[J]. 劉翔. 江西中醫(yī)藥. 2007(04)
[10]漢防己甲素抗肝纖維化研究進展[J]. 李定國,陸漢明,陳穎偉. 世界華人消化雜志. 1999(02)
本文編號:3160147
【文章來源】:廣州中醫(yī)藥大學廣東省
【文章頁數(shù)】:78 頁
【學位級別】:碩士
【文章目錄】:
中文摘要
Abstract
引言
研究背景
實驗部分
第一部分 丙戊酸逆轉(zhuǎn)活化人肝星狀細胞靜息的細胞模型建立
1.1 實驗材料
1.2 實驗方法
1.3 結(jié)果
1.4 討論
1.5 小結(jié)
第二部分 抗肝纖維化相關的lncRNAs的篩選與生物信息學分析研究
2.1 實驗材料
2.2 實驗方法
2.3 實驗結(jié)果
2.4 討論
2.5 小結(jié)
第三部分 青蒿琥酯通過阻止EMT轉(zhuǎn)化抑制肝星狀細胞活化
前言
3.1 實驗材料
3.2 實驗方法
3.3 結(jié)果
3.4 討論
3.5 小結(jié)
結(jié)語和展望
參考文獻
附錄
附錄1:所有樣本RNA-seq測序數(shù)據(jù)的堿基分布圖
附錄2:所有樣本RNA-seq測序數(shù)據(jù)的堿基質(zhì)量分布圖
附錄3:本文使用的縮略語(按字母順序排列)
附錄4:碩士研究生在讀期間的研究成果
致謝
附件
【參考文獻】:
期刊論文
[1]青蒿琥酯抗肝纖維化作用機制的研究進展[J]. 錢鵬,陳劍群. 重慶醫(yī)學. 2017(02)
[2]Global epidemiology of hepatitis C virus infection: an up-date of the distribution and circulation of hepatitis C virus genotypes[J]. Arnolfo Petruzziello,Samantha Marigliano,Giovanna Loquercio,Anna Cozzolino,Carmela Cacciapuoti. World Journal of Gastroenterology. 2016(34)
[3]青蒿琥酯對肝纖維化相關分子機制的影響研究進展[J]. 白瑞丹,張洪,黃萃園. 醫(yī)學綜述. 2016(17)
[4]Effect of artesunate supplementation on bacterial translocation and dysbiosis of gut microbiota in rats with liver cirrhosis[J]. Yun-Xia Chen,Li-Na Lai,Hui-Ying Zhang,Yang-Hui Bi,Li Meng,Xu-Jiong Li,Xiao-Xia Tian,Li-Min Wang,Yi-Min Fan,Zhong-Fu Zhao,De-Wu Han,Cheng Ji. World Journal of Gastroenterology. 2016(10)
[5]Chronic hepatitis C and liver fibrosis[J]. Giada Sebastiani,Konstantinos Gkouvatsos,Kostas Pantopoulos. World Journal of Gastroenterology. 2014(32)
[6]Mechanisms of fibrogenesis in liver cirrhosis:The molecular aspects of epithelial-mesenchymal transition[J]. Sun-Jae Lee,Kyung-Hyun Kim,Kwan-Kyu Park. World Journal of Hepatology. 2014(04)
[7]肝纖維化的流行病學研究進展[J]. 范慧寧,陳尼維. 國際消化病雜志. 2014(01)
[8]中國人群乙型病毒性肝炎血清流行病學調(diào)查——乙型肝炎疫苗接種降低乙型肝炎病毒感染率[J]. 崔富強. 中國疫苗和免疫. 2010(04)
[9]江一平治療慢性肝炎肝纖維化經(jīng)驗[J]. 劉翔. 江西中醫(yī)藥. 2007(04)
[10]漢防己甲素抗肝纖維化研究進展[J]. 李定國,陸漢明,陳穎偉. 世界華人消化雜志. 1999(02)
本文編號:3160147
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