[目的]通過網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)的方法分析清肺達(dá)原顆粒（Qingfei Dayuan Granules,QFDYKL）治療新型冠狀病毒肺炎（corona virus disease 2019,COVID-19）的潛在機(jī)制。[方法]從中藥系統(tǒng)藥理學(xué)數(shù)據(jù)庫與分析平臺（Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology Database and Analysis Platform,TCMSP）、Pubchem、Uniprot等數(shù)據(jù)庫中獲取QFDYKL的活性成分和作用靶點,再對靶點基因進(jìn)行基因本體（gene ontology,GO）與京都基因與基因組百科全書（Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG）富集分析,將靶點導(dǎo)入String數(shù)據(jù)庫,運(yùn)用Cytoscape 3郾7郾0軟件構(gòu)建"成分-靶點"網(wǎng)絡(luò),分析并確定QFDYKL中的核心成分。繪制蛋白互作（protein-protein interaction,PPI）網(wǎng)絡(luò),并使用分子復(fù)合物檢測（molecular complex detection,MCODE）確... 

【文章來源】：浙江中醫(yī)藥大學(xué)學(xué)報. 2020,44(09)

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【部分圖文】：

組成；C.生物過程N(yùn)ote:A.Molecularfunction;B.Cellcomposition;C.Biologicalprocess圖2藥物靶點GO富集分析Fig.2GOｅnrichmentanalysisofdrugtargetｓ852注：A.分子功能；B.細(xì)胞

浙江中醫(yī)藥大學(xué)學(xué)報2020年9月第44卷第9期圖3藥物靶點的KEGG代謝通路分析Fig.3AnalysisofKEGGmetabolicpathwaysofdrugtargets居晨浩，等：基于網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)的清肺達(dá)原顆粒治療新型冠狀病毒肺炎多組分協(xié)同作用機(jī)制研究析提示共36條通路，藥物靶點主要集中在絲裂原活化蛋白激酶（mitogen-activatedproteinkinase，MAPK）信號通路、表皮生長因子受體（epidermalgrowthfac鄄torreceptor，EGFR/ErbB）信號通路、腎素血管緊張素系統(tǒng)（reninangiotensinsystems，RAS）信號通路、RAS相關(guān)蛋白1（RAS-relatedprotein1，Rap1）信號通路、鈣信號通路、cGMP依賴蛋白激酶G（cGMPdependent-proteinkinaseG，cGMP-PKG）信號通路。見圖3。藥物通過網(wǎng)絡(luò)中的藥物靶點，在酶活性的調(diào)控、血管生成和發(fā)育、細(xì)胞增殖調(diào)控和T細(xì)胞免疫調(diào)控等過程中發(fā)揮治療COVID-19的作用。2.4PPI網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建與分析結(jié)果將藥物靶點導(dǎo)入String數(shù)據(jù)庫，將研究物種選擇為人類，將minimumrequiredinteractionscore設(shè)置為大于0郾9，獲得PPI網(wǎng)絡(luò)。見圖4。將PPI網(wǎng)絡(luò)結(jié)果以TSV格式導(dǎo)出，再將所得數(shù)據(jù)導(dǎo)入Cytoscape軟件進(jìn)行PPI網(wǎng)絡(luò)拓?fù)浞治�，De鄄gree越高，在QFDYKL治療過程中可能發(fā)揮的作用越重要，取Degree排名前20的靶點。見表2。主要靶點為磷酸肌醇-3-激酶催化亞基α肽（phosphoinositide-3-kinasesubunitα，PIK3CA）、淀粉樣β蛋白前體（amyloidβprecursorprotein，APP）MAPK1、MAPK3、90kDa熱休克蛋白αA1（heat

浙江中醫(yī)藥大學(xué)學(xué)報2020年9月第44卷第9期表2Degree前20的靶點在PPI網(wǎng)絡(luò)中的拓?fù)鋵傩訲ab.2Topologicalpropertiesofthetop20targetsinＤegreeinthePPInetwork序號靶點縮寫靶點全稱Degree中心Degree緊密中心Degree1PIK3CAphosphoinositide-3-kinasesubunitα500.07860.39302APPAmyloidβprecursorprotein490.11040.36933MAPK1mitogen-activatedproteinkinase1490.09790.41824MAPK3mitogen-activatedproteinkinase3450.06610.41455HSP90AA1heatshockprotein90αA1340.08570.39136CXCR4C-X-Cmotifchemokinereceptortype4340.03940.34277EGFRepidermalgrowthfactorreceptor320.05760.39368CHRM2muscarinicacetylcholinereceptorM2310.01120.31869JUNtranscriptionfactorAP-1280.04940.379210AGTR1type-1angiotensinⅡreceptor280.00620.327911MAPK8mitogen-activatedproteinkinase8270.03410.378712RAC1Ras-relatedC3botulinumtoxinsubstrate1270.03390.372213EGFepidermalgrowthfactor260.02620.362114JAK2Januskinase2250.02820.370215F2prothrombin250.03010.341016RB1retinoblastoma-associatedprotein1240.04820.368317CDK1cyclin-dependentkinase1240.03210.331018ADCY5adenylatecyclasetype5240.00560.29121920ESR1TACR1estrogenreceptor1tachykininreceptor123230.07820.00250.39140.3260圖4蛋白互作網(wǎng)絡(luò)Fig.4PPInetwork居晨浩，等：基于網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)的清肺達(dá)原顆粒治療新型冠狀病毒肺炎多組分協(xié)同作用機(jī)制研究854

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
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