為探討DNA條形碼在陜西關(guān)中野生商陸資源中的鑒定作用,本研究采用通用引物ITS2和psbA-trnH對29份商陸樣品DNA進(jìn)行PCR擴(kuò)增和測序,用Codon CodeA-ligner V3.0進(jìn)行序列拼接和校對,隨后進(jìn)行BLAST比對鑒定分析;同時運(yùn)用MEGA 6.0分析序列特征、K2P遺傳距離及種內(nèi)或種間變異,并構(gòu)建系統(tǒng)進(jìn)化樹,評價兩對引物對該區(qū)域商陸及其混偽品的鑒別能力。研究結(jié)果表明, ITS2和psbA-trnH序列的PCR擴(kuò)增和測序成功率均為100%; NJ系統(tǒng)進(jìn)化樹顯示ITS2和psbA-trnH序列均可明顯將所有樣本分別聚為商陸、垂序商陸并與其同屬近源種鄂西商陸、日本商陸及兩種混偽品各自聚為不同分支; ITS2序列在種間遺傳距離上較psbA-trnH有一定優(yōu)勢。ITS2和psbA-trnH序列均可作為DNA條形碼對商陸及其混偽品進(jìn)行識別和鑒定,為商陸資源品種現(xiàn)狀與分布研究及合理開發(fā)利用提供理論依據(jù)。
【文章目錄】：
材料與方法
結(jié)果與分析
    1 DNA擴(kuò)增及測序
    2 NCBI數(shù)據(jù)庫和中藥材DNA條形碼鑒定系統(tǒng)比對分析
    3序列特征及遺傳距離分析
    4系統(tǒng)進(jìn)化樹構(gòu)建分析
討論

【相似文獻(xiàn)】

相關(guān)期刊論文 前10條

1 林爽;吳海燕;張宏意;李坤平;;不同地理居群破布葉的psbA-trnH和ITS2序列及其聚類分析[J];中草藥;2017年07期

2 宋明;張雅琴;林韻涵;凃媛;馬孝熙;孫偉;向麗;焦文靜;劉霞;;基于ITS2和psbA-trnH序列對細(xì)小種子類藥材車前子的鑒定比較[J];中國中藥雜志;2014年12期

3 陳倩;劉義梅;劉震;陳士林;陳科力;;ITS2和psbA-trnH序列鑒別馬鞭草科藥用植物[J];中國中藥雜志;2012年08期

4 張兵鋒;;馬鞭草科藥用植物的ITS2序列分析與鑒定[J];宜春學(xué)院學(xué)報(bào);2016年12期

5 龐曉慧;宋經(jīng)元;孫超;姚輝;韓建萍;陳士林;;中藥金錢草及其混淆品的ITS2序列分析與鑒別[J];環(huán)球中醫(yī)藥;2011年02期

6 于俊林;趙莎;任明波;錢齊妮;龐曉慧;;基于ITS2條形碼鑒定柴胡與大葉柴胡[J];中國中藥雜志;2014年12期

7 韓建萍;石林春;陳士林;錢俊;羅焜;陳科力;;ITS2序列鑒定筋骨草及其近緣種[J];世界科學(xué)技術(shù)-中醫(yī)藥現(xiàn)代化;2008年06期

8 豆榮昆;畢振飛;白瑞雪;任瑤瑤;譚睿;宋良科;李迪強(qiáng);茆燦泉;;黃花紫堇、多刺綠絨蒿及其同屬近緣物種的ITS2條形碼鑒定與分析[J];中國中藥雜志;2015年08期

9 林韻涵;劉霞;胡志剛;孫偉;鄔蘭;張雅琴;宋明;張曉存;;基于ITS2序列鑒定桃仁及其近緣種[J];世界科學(xué)技術(shù)-中醫(yī)藥現(xiàn)代化;2013年03期

10 嚴(yán)華;石任兵;姚輝;張文娟;李明華;程顯隆;余坤子;魏鋒;馬雙成;;鐵皮石斛的ITS2條形碼分子鑒定及5種重金屬及有害元素的測定[J];藥物分析雜志;2015年06期

相關(guān)博士學(xué)位論文 前1條

1 劉義梅;杜鵑花屬藥用植物DNA條形碼的鑒定研究[D];湖北中醫(yī)藥大學(xué);2011年

相關(guān)碩士學(xué)位論文 前9條

1 黎潔文;基于ITS2序列分析的何首烏PCR-RFLP和AS-PCR的分子鑒別研究[D];廣州中醫(yī)藥大學(xué);2015年

2 李美妮;基于ITS2序列的中藥及其混偽品原植物的鑒定研究[D];西北農(nóng)林科技大學(xué);2012年

3 章麗;基于“品種-ITS2序列—成分—藥效”關(guān)聯(lián)性探究丹皮、赤芍、白芍功效差異的科學(xué)內(nèi)涵[D];江蘇大學(xué);2016年

4 張家曾;黃精與多花黃精的DNA條形碼研究[D];湖南中醫(yī)藥大學(xué);2013年

5 楊爍;ITS2二級結(jié)構(gòu)在藥用植物DNA條形碼鑒定中的可行性[D];山東大學(xué);2017年

6 陳倩;馬鞭草科和茜草科植物DNA條形碼研究[D];湖北中醫(yī)藥大學(xué);2012年

7 劉震;樟科和忍冬科的DNA條形碼篩選研究[D];湖北中醫(yī)藥大學(xué);2010年

8 韓潔;76種嶺南中草藥的DNA條形碼研究[D];廣州中醫(yī)藥大學(xué);2016年

9 嚴(yán)華;鐵皮石斛質(zhì)量控制體系研究[D];北京中醫(yī)藥大學(xué);2015年

本文編號：2846411